18 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Rfer_0001  CDS  NC_007908  1419  1413  chromosomal replication initiation protein  YP_521294  unclonable  8.52444e-07  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_0013  CDS  NC_007908  14571  15326  756  GntR family transcriptional regulator  YP_521306  unclonable  5.01062e-08  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
 
Rfer_0014  CDS  NC_007908  15516  16868  1353  fumarate lyase  YP_521307  unclonable  3.53189e-07  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_0528  CDS  NC_007908  552646  553662  1017  porin  YP_521810  unclonable  4.23032e-07  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_0965  CDS  NC_007908  1016453  1017295  843  extracellular solute-binding protein  YP_522240  unclonable  4.39884e-08  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
 
Rfer_1099  CDS  NC_007908  1177505  1178767  1263  extracellular solute-binding protein  YP_522371  unclonable  4.91601e-07  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_1583  CDS  NC_007908  1714025  1715452  1428  cytochrome c, class I  YP_522846  unclonable  7.40916e-07  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_1746  CDS  NC_007908  1882251  1882997  747  PE-PGRS family protein  YP_523006  unclonable  8.77581e-08  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
 
Rfer_2071  CDS  NC_007908  2244661  2246916  2256  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  YP_523327  unclonable  2.08286e-05  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_2140  CDS  NC_007908  2322234  2322776  543  phasin  YP_523395  unclonable  1.78804e-08  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_2176  CDS  NC_007908  2375664  2376200  537  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_523431  unclonable  5.32163e-08  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_2739  CDS  NC_007908  3023344  3024759  1416  hypothetical protein  YP_523983  unclonable  8.52444e-07  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_3798  CDS  NC_007908  4238230  4240332  2103  elongation factor G  YP_525029  unclonable  1.36641e-05  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_3799  CDS  NC_007908  4240496  4240969  474  30S ribosomal protein S7  YP_525030  unclonable  1.56972e-08  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_3800  CDS  NC_007908  4241119  4241496  378  30S ribosomal protein S12  YP_525031  unclonable  1.17431e-08  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
 
Rfer_3801  CDS  NC_007908  4241685  4242869  1185  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  YP_525032  unclonable  2.64221e-07  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_3805  CDS  NC_007908  4245200  4246216  1017  delta-aminolevulinic acid dehydratase  YP_525036  unclonable  1.00968e-07  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Rfer_4080  CDS  NC_007908  4550312  4553122  2811  hypothetical protein  YP_525309  unclonable  0.000183317  n/a    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>