113 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Pcryo_0001  CDS  NC_007969  373  372  ribonuclease P protein component  YP_579269  hitchhiker  0.0001269  unclonable  4.73513e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0002  CDS  NC_007969  574  708  135  50S ribosomal protein L34  YP_579270  hitchhiker  7.27123e-06  unclonable  4.68434e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0003  CDS  NC_007969  1365  2810  1446  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_579271  unclonable  3.10067e-05  unclonable  5.4574e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0004  CDS  NC_007969  2971  4146  1176  DNA polymerase III, beta subunit  YP_579272  unclonable  9.37309e-06  unclonable  4.68434e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0017  CDS  NC_007969  22169  23017  849  HNH endonuclease  YP_579285  unclonable  4.82727e-06  normal  0.797394  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
 
Pcryo_0031  CDS  NC_007969  37571  38275  705  pseudouridine synthase, Rsu  YP_579299  unclonable  1.38708e-06  normal  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0067  CDS  NC_007969  75551  76450  900  prepilin peptidase  YP_579335  unclonable  3.98253e-06  normal  0.330687  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0206  CDS  NC_007969  244112  244792  681  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  YP_579474  unclonable  9.08528e-07  normal  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0372  CDS  NC_007969  450611  451789  1179  OmpA/MotB  YP_579639  unclonable  1.20544e-05  normal  0.0292595  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0377  CDS  NC_007969  456501  459041  2541  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  YP_579644  unclonable  0.000730209  normal  0.0150948  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0403  CDS  NC_007969  490288  491004  717  GntR family transcriptional regulator  YP_579670  unclonable  1.48823e-06  normal  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0478  CDS  NC_007969  586931  587959  1029  rod shape-determining protein MreB  YP_579745  unclonable  4.82727e-06  normal  0.515343  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0484  CDS  NC_007969  593180  593818  639  50S ribosomal protein L3  YP_579751  unclonable  1.99127e-06  normal  0.0280354  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
 
Pcryo_0485  CDS  NC_007969  593833  594435  603  50S ribosomal protein L4  YP_579752  unclonable  2.38586e-06  normal  0.0299035  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0486  CDS  NC_007969  594432  594782  351  50S ribosomal protein L23  YP_579753  unclonable  9.45976e-07  normal  0.0263712  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0487  CDS  NC_007969  594794  595621  828  50S ribosomal protein L2  YP_579754  unclonable  3.49566e-06  normal  0.0292595  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0488  CDS  NC_007969  595634  595909  276  30S ribosomal protein S19  YP_579755  unclonable  4.0228e-07  normal  0.0259366  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0489  CDS  NC_007969  595920  596249  330  50S ribosomal protein L22  YP_579756  unclonable  3.94007e-07  normal  0.0259366  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0490  CDS  NC_007969  596253  596981  729  30S ribosomal protein S3  YP_579757  unclonable  1.27993e-06  normal  0.0282319  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0491  CDS  NC_007969  596985  597398  414  50S ribosomal protein L16  YP_579758  unclonable  4.19023e-07  normal  0.026966  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0492  CDS  NC_007969  597398  597595  198  50S ribosomal protein L29  YP_579759  unclonable  2.69132e-07  normal  0.0259366  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0493  CDS  NC_007969  597592  597867  276  ribosomal protein S17  YP_579760  unclonable  3.94007e-07  normal  0.0259366  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0494  CDS  NC_007969  598049  598417  369  50S ribosomal protein L14  YP_579761  unclonable  5.12994e-07  normal  0.0255755  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0495  CDS  NC_007969  598426  598743  318  50S ribosomal protein L24  YP_579762  unclonable  4.19023e-07  normal  0.0253858  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0496  CDS  NC_007969  598765  599301  537  50S ribosomal protein L5  YP_579763  unclonable  1.02637e-06  normal  0.067435  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0516  CDS  NC_007969  611444  612172  729  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  YP_579783  unclonable  1.97068e-06  decreased coverage  0.00245828  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0517  CDS  NC_007969  612485  612721  237  acyl carrier protein  YP_579784  unclonable  4.4528e-07  decreased coverage  0.00212296  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0695  CDS  NC_007969  825659  826144  486  hypothetical protein  YP_579962  unclonable  9.75548e-07  normal  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0746  CDS  NC_007969  877536  880139  2604  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  YP_580013  unclonable  0.00125292  normal  0.5898  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0805  CDS  NC_007969  949663  950043  381  glycine cleavage system protein H  YP_580072  unclonable  3.12809e-07  normal  0.950872  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0806  CDS  NC_007969  950110  951282  1173  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  YP_580073  unclonable  4.14833e-06  normal  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0938  CDS  NC_007969  1113443  1115584  2142  hypothetical protein  YP_580203  normal  0.102754  unclonable  2.7622e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0939  CDS  NC_007969  1116101  1118533  2433  ATPase  YP_580204  normal  0.77127  unclonable  3.28299e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0940  CDS  NC_007969  1118538  1119662  1125  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  YP_580205  normal  unclonable  2.44795e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0941  CDS  NC_007969  1119809  1120543  735  hypothetical protein  YP_580206  normal  unclonable  2.18956e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0942  CDS  NC_007969  1121231  1122136  906  hypothetical protein  YP_580207  normal  unclonable  2.37468e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0943  CDS  NC_007969  1122151  1122735  585  hypothetical protein  YP_580208  normal  unclonable  2.08116e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0944  CDS  NC_007969  1122859  1123716  858  protein serine/threonine phosphatases  YP_580209  normal  unclonable  2.44795e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0945  CDS  NC_007969  1123740  1124858  1119  putative transcription factor  YP_580210  normal  unclonable  2.35014e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0946  CDS  NC_007969  1124933  1125934  1002  hypothetical protein  YP_580211  normal  unclonable  2.25711e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0947  CDS  NC_007969  1126026  1126763  738  hypothetical protein  YP_580212  normal  unclonable  2.14537e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0948  CDS  NC_007969  1126760  1129924  3165  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  YP_580213  normal  unclonable  5.68458e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0949  CDS  NC_007969  1129928  1132099  2172  hypothetical protein  YP_580214  normal  unclonable  4.4524e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0950  CDS  NC_007969  1132101  1133576  1476  hypothetical protein  YP_580215  normal  unclonable  4.01768e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0951  CDS  NC_007969  1133642  1134901  1260  restriction modification system DNA specificity subunit  YP_580216  normal  unclonable  4.06123e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0952  CDS  NC_007969  1134901  1137330  2430  type I restriction-modification system, M subunit  YP_580217  normal  unclonable  6.09916e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0953  CDS  NC_007969  1137832  1139898  2067  hypothetical protein  YP_580218  normal  unclonable  4.73513e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0954  CDS  NC_007969  1139917  1140648  732  hypothetical protein  YP_580219  normal  0.636597  unclonable  3.21673e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0955  CDS  NC_007969  1140654  1142075  1422  hypothetical protein  YP_580220  normal  0.183403  unclonable  4.27279e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0956  CDS  NC_007969  1142085  1145312  3228  SNF2-related  YP_580221  normal  0.0419207  unclonable  7.16871e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0957  CDS  NC_007969  1145483  1146262  780  transposase, mutator type  YP_580222  normal  0.209569  unclonable  3.97615e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0958  CDS  NC_007969  1146375  1146764  390  transposase mutator family protein  YP_580223  normal  0.0510874  unclonable  3.41963e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0959  CDS  NC_007969  1146863  1147204  342  hypothetical protein  YP_580224  normal  0.0220265  unclonable  3.31727e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0960  CDS  NC_007969  1147191  1147484  294  hypothetical protein  YP_580225  normal  0.0399553  unclonable  3.05628e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0961  CDS  NC_007969  1147481  1148725  1245  phage integrase  YP_580226  normal  0.531442  unclonable  3.81875e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0962  CDS  NC_007969  1148742  1148957  216  hypothetical protein  YP_580227  normal  unclonable  3.05628e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0963  CDS  NC_007969  1149154  1149378  225  XRE family transcriptional regulator  YP_580228  normal  unclonable  3.05628e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0964  CDS  NC_007969  1150134  1151804  1671  pyruvate decarboxylase  YP_580229  normal  0.719154  unclonable  4.49891e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0965  CDS  NC_007969  1151960  1152334  375  hypothetical protein  YP_580230  normal  0.112689  unclonable  2.87605e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_0966  CDS  NC_007969  1152543  1154333  1791  potassium/proton antiporter  YP_580231  normal  0.230877  unclonable  4.31742e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1044  CDS  NC_007969  1248157  1248849  693  TetR family transcriptional regulator  YP_580309  unclonable  1.81846e-06  normal  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1070  CDS  NC_007969  1288202  1289119  918  MaoC-like dehydratase  YP_580335  unclonable  3.25805e-06  normal  0.560447  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1155  CDS  NC_007969  1399632  1400561  930  transcriptional regulator CysB-like protein  YP_580420  unclonable  4.27804e-06  normal  0.581865  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1169  CDS  NC_007969  1417033  1417173  141  entericidin EcnAB  YP_580434  unclonable  1.08123e-07  hitchhiker  0.000475974  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1170  CDS  NC_007969  1417435  1417995  561  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  YP_580435  unclonable  4.14692e-07  hitchhiker  0.000503269  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1171  CDS  NC_007969  1418067  1418438  372  putative DsrC-like protein  YP_580436  unclonable  2.53263e-07  hitchhiker  0.000489531  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
 
Pcryo_1172  CDS  NC_007969  1418435  1418773  339  hypothetical protein  YP_580437  unclonable  2.38329e-07  hitchhiker  0.000458598  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
 
Pcryo_1175  CDS  NC_007969  1420095  1422950  2856  bifunctional glutamine-synthetase adenylyltransferase/deadenyltransferase  YP_580440  normal  0.253631  unclonable  7.02399e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1176  CDS  NC_007969  1423215  1424144  930  branched-chain amino acid aminotransferase  YP_580441  normal  unclonable  4.01768e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1183  CDS  NC_007969  1430984  1432810  1827  aspartyl-tRNA synthetase  YP_580448  unclonable  9.58333e-05  hitchhiker  0.00287943  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1312  CDS  NC_007969  1602618  1603904  1287  manganese transporter NRAMP  YP_580577  unclonable  9.76334e-06  normal  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1626  CDS  NC_007969  2000332  2003067  2736  hypothetical protein  YP_580887  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1627  CDS  NC_007969  2003177  2003767  591  hypothetical protein  YP_580888  unclonable  9.55857e-07  normal  0.0204605  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1628  CDS  NC_007969  2004277  2004552  276  hypothetical protein  YP_580889  unclonable  3.28975e-07  normal  0.019862  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1639  CDS  NC_007969  2018934  2020220  1287  aspartate kinase  YP_580900  unclonable  1.45942e-05  hitchhiker  0.000682871  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1640  CDS  NC_007969  2020625  2020870  246  carbon storage regulator  YP_580901  unclonable  4.7794e-07  hitchhiker  0.000536973  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1641  CDS  NC_007969  2020963  2021337  375  hypothetical protein  YP_580902  unclonable  6.72266e-07  hitchhiker  0.00055225  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1642  CDS  NC_007969  2021433  2021744  312  hypothetical protein  YP_580903  unclonable  4.59021e-07  hitchhiker  0.000578829  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1643  CDS  NC_007969  2021799  2022818  1020  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  YP_580904  unclonable  7.29399e-06  hitchhiker  0.000860792  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1644  CDS  NC_007969  2023101  2023823  723  hypothetical protein  YP_580905  unclonable  3.19229e-06  hitchhiker  0.000785706  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1652  CDS  NC_007969  2035541  2037415  1875  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_580913  unclonable  9.29263e-05  unclonable  7.46422e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1653  CDS  NC_007969  2037810  2038082  273  histone-like DNA-binding protein  YP_580914  unclonable  4.7794e-07  unclonable  4.40637e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
 
Pcryo_1654  CDS  NC_007969  2038557  2039240  684  hypothetical protein  YP_580915  hitchhiker  0.00109399  unclonable  5.40097e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1655  CDS  NC_007969  2039623  2040135  513  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_580916  hitchhiker  0.00267813  unclonable  4.98182e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1656  CDS  NC_007969  2040132  2041358  1227  cysteine desulfurase IscS  YP_580917  normal  0.0819836  unclonable  5.56983e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1673  CDS  NC_007969  2058578  2060269  1692  30S ribosomal protein S1  YP_580934  unclonable  4.6796e-05  normal  0.385935  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
 
Pcryo_1732  CDS  NC_007969  2146207  2147874  1668  cardiolipin synthetase  YP_580993  unclonable  6.20411e-05  normal  0.647101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1739  CDS  NC_007969  2153173  2153829  657  adenylate kinases  YP_581000  unclonable  2.2686e-06  normal  0.166056  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1740  CDS  NC_007969  2154049  2155329  1281  putative cytochrome c-type biogenesis protein  YP_581001  unclonable  1.53485e-05  normal  0.193617  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1747  CDS  NC_007969  2163709  2164137  429  50S ribosomal protein L13  YP_581008  unclonable  6.79553e-07  normal  0.257999  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
 
Pcryo_1759  CDS  NC_007969  2177288  2179090  1803  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  YP_581020  unclonable  9.01075e-05  normal  0.0327712  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1872  CDS  NC_007969  2313308  2313532  225  heavy metal transport/detoxification protein  YP_581133  normal  0.230412  unclonable  6.67879e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1873  CDS  NC_007969  2313668  2313922  255  hypothetical protein  YP_581134  normal  0.565853  unclonable  6.60975e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1874  CDS  NC_007969  2313950  2314825  876  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  YP_581135  normal  0.552524  unclonable  7.69457e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1875  CDS  NC_007969  2315015  2316649  1635  CTP synthetase  YP_581136  normal  unclonable  0.000103989  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1876  CDS  NC_007969  2316813  2317595  783  hypothetical protein  YP_581137  normal  0.0571167  unclonable  8.342e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1877  CDS  NC_007969  2317793  2318878  1086  porin  YP_581138  unclonable  5.0808e-06  unclonable  8.17359e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_1878  CDS  NC_007969  2319428  2321632  2205  malate synthase G  YP_581139  hitchhiker  0.00162992  unclonable  0.000109363  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_2026  CDS  NC_007969  2489536  2490498  963  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_581287  unclonable  4.14833e-06  normal  0.794649  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
-
 
Pcryo_2027  CDS  NC_007969  2490812  2492008  1197  cell division protein FtsZ  YP_581288  unclonable  1.30635e-05  normal  0.845154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria 
 
 
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>