18 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bcen_0082  CDS  NC_008060  85763  86959  1197  cell division protein FtsZ  YP_619970  unclonable  3.08232e-09  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0441  CDS  NC_008060  484198  485142  945  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_620326  unclonable  7.98578e-10  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0527  CDS  NC_008060  568123  568326  204  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_620411  unclonable  9.67156e-11  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0620  CDS  NC_008060  666125  666448  324  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  YP_620503  unclonable  1.16971e-10  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0807  CDS  NC_008060  870837  872414  1578  lytic transglycosylase, catalytic  YP_620690  unclonable  4.88034e-08  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0840  CDS  NC_008060  908374  909645  1272  RelA/SpoT  YP_620722  unclonable  2.81443e-08  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0991  CDS  NC_008060  1081472  1083709  2238  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  YP_620873  unclonable  1.21371e-06  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_1638  CDS  NC_008060  1818966  1819343  378  preprotein translocase subunit SecG  YP_621516  unclonable  1.64362e-10  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3344  CDS  NC_008061  433352  437836  4485  PAAR  YP_623212  unclonable  0.0030504  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3437  CDS  NC_008061  550690  551580  891  LysR family transcriptional regulator  YP_623304  unclonable  2.17506e-10  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3438  CDS  NC_008061  551717  552655  939  Beta-lactamase  YP_623305  unclonable  2.52783e-10  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3439  CDS  NC_008061  553138  553338  201  hypothetical protein  YP_623306  unclonable  3.42472e-12  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3440  CDS  NC_008061  553917  554285  369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  YP_623307  unclonable  8.426e-12  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_3639  CDS  NC_008061  765741  766031  291  hypothetical protein  YP_623504  unclonable  1.2826e-11  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_6021  CDS  NC_008062  608372  609781  1410  glutamyl-tRNA synthetase  YP_625859  unclonable  5.13528e-09  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_R0018  tRNA  NC_008060  665947  666022  76  tRNA-Asn    unclonable  3.18687e-11  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_R0055  rRNA  NC_008060  2815867  2817392  1526  16S ribosomal RNA    unclonable  2.62376e-08  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_R0092  tRNA  NC_008062  609911  609986  76  tRNA-Ala    unclonable  4.31101e-12  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>