59 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
EcHS_A0146  CDS  NC_009800  156777  158141  1365  poly(A) polymerase I  YP_001456927  unclonable  4.26812e-19  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0408  CDS  NC_009800  427737  430811  3075  beta-D-galactosidase  YP_001457178  unclonable  1.44327e-14  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0409  CDS  NC_009800  430934  432025  1092  lac repressor  YP_001457179  unclonable  3.9973e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0513  CDS  NC_009800  521198  522496  1299  trigger factor  YP_001457281  unclonable  2.68965e-19  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0684    NC_009800  698836  700047  1212      unclonable  8.74491e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0731  CDS  NC_009800  741289  741936  648  flavodoxin FldA  YP_001457482  unclonable  1.8988e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0732  CDS  NC_009800  741959  742252  294  LexA regulated protein  YP_001457483  unclonable  1.95489e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0733  CDS  NC_009800  742392  743156  765  hypothetical protein  YP_001457484  unclonable  5.44031e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0796  CDS  NC_009800  806452  807243  792  tol-pal system protein YbgF  YP_001457542  unclonable  5.27837e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0995  CDS  NC_009800  993572  997561  3990  DNA translocase FtsK  YP_001457731  unclonable  2.12407e-12  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1063  CDS  NC_009800  1077566  1078084  519  3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  YP_001457793  unclonable  6.76561e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1064  CDS  NC_009800  1078153  1079913  1761  S16 family peptidase  YP_001457794  unclonable  1.20941e-18  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1065  CDS  NC_009800  1080099  1080551  453  hypothetical protein  YP_001457795  unclonable  1.95489e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1066  CDS  NC_009800  1080627  1081667  1041  outer membrane protein A  YP_001457796  unclonable  6.14063e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1208  CDS  NC_009800  1208620  1209579  960  23S rRNA pseudouridylate synthase C  YP_001457930  unclonable  5.72174e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1209  CDS  NC_009800  1209691  1210314  624  Maf-like protein  YP_001457931  unclonable  7.40436e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1210  CDS  NC_009800  1210474  1210995  522  hypothetical protein  YP_001457932  unclonable  3.98054e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1211  CDS  NC_009800  1211047  1211220  174  50S ribosomal protein L32  YP_001457933  unclonable  2.31511e-23  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1212  CDS  NC_009800  1211301  1212371  1071  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsX  YP_001457934  unclonable  5.7805e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1213  CDS  NC_009800  1212439  1213392  954  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  YP_001457935  unclonable  2.16382e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1214  CDS  NC_009800  1213408  1214337  930  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  YP_001457936  unclonable  1.78744e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1215  CDS  NC_009800  1214350  1215084  735  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  YP_001457937  unclonable  7.4804e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1216  CDS  NC_009800  1215295  1215531  237  acyl carrier protein  YP_001457938  unclonable  3.59624e-23  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1315  CDS  NC_009800  1312153  1313409  1257  glutamyl-tRNA reductase  YP_001458033  unclonable  2.01079e-19  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1391  CDS  NC_009800  1388121  1389290  1170  tetratricopeptide repeat protein  YP_001458105  unclonable  4.93572e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1629  CDS  NC_009800  1650585  1651331  747  3-hydroxy acid dehydrogenase  YP_001458333  unclonable  5.55142e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1630  CDS  NC_009800  1651420  1652106  687  GntR family transcriptional regulator  YP_001458334  unclonable  3.79226e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1631  CDS  NC_009800  1652241  1652513  273  hypothetical protein  YP_001458335  unclonable  3.90088e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1739  CDS  NC_009800  1760890  1761822  933  putative DNA-binding transcriptional regulator  YP_001458443  unclonable  9.07553e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1758  CDS  NC_009800  1779445  1779681  237  major outer membrane lipoprotein  YP_001458460  unclonable  2.20557e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A2010  CDS  NC_009800  2011896  2012444  549  phosphatidylglycerophosphate synthetase  YP_001458701  unclonable  1.8608e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A2108  CDS  NC_009800  2096806  2098446  1641  hypothetical protein  YP_001458788  unclonable  6.24671e-19  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A2537  CDS  NC_009800  2550659  2552074  1416  glutamyl-tRNA synthetase  YP_001459189  unclonable  1.81823e-19  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A2660  CDS  NC_009800  2671872  2673242  1371  exodeoxyribonuclease VII large subunit  YP_001459302  unclonable  1.87444e-19  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A2952  CDS  NC_009800  2959859  2960776  918  DNA-binding transcriptional activator GcvA  YP_001459580  unclonable  2.32585e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A3245  CDS  NC_009800  3254226  3254441  216  30S ribosomal protein S21  YP_001459859  unclonable  1.3627e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A3378  CDS  NC_009800  3383788  3384045  258  50S ribosomal protein L27  YP_001459987  unclonable  1.4045e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A3379  CDS  NC_009800  3384066  3384377  312  50S ribosomal protein L21  YP_001459988  unclonable  2.03555e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A3380  CDS  NC_009800  3384636  3385607  972  octaprenyl diphosphate synthase  YP_001459989  unclonable  1.39544e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4208  CDS  NC_009800  4203658  4204608  951  pantothenate kinase  YP_001460765  unclonable  2.87125e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4213  CDS  NC_009800  4205526  4206710  1185  elongation factor Tu  YP_001460766  unclonable  7.91099e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4214  CDS  NC_009800  4206940  4207323  384  preprotein translocase subunit SecE  YP_001460767  unclonable  6.05954e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4215  CDS  NC_009800  4207325  4207870  546  transcription antitermination protein NusG  YP_001460768  unclonable  1.37761e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4216  CDS  NC_009800  4208029  4208457  429  50S ribosomal protein L11  YP_001460769  unclonable  7.86564e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4217  CDS  NC_009800  4208461  4209165  705  50S ribosomal protein L1  YP_001460770  unclonable  6.26604e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4409  CDS  NC_009800  4417664  4418803  1140  iron-sulfur cluster binding protein  YP_001460947  unclonable  7.44865e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4517  CDS  NC_009800  4522377  4523477  1101  putative permease  YP_001461054  unclonable  4.24635e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4654  tRNA  NC_009800  726065  726143  79  tRNA-Met    unclonable  2.94372e-23  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4655  tRNA  NC_009800  807407  807484  78  tRNA-Lys    unclonable  8.59319e-23  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4681  tRNA  NC_009800  2552333  2552408  76  tRNA-Val    unclonable  4.95676e-23  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4682  tRNA  NC_009800  2552452  2552529  78  tRNA-Val    unclonable  4.80923e-23  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4683  tRNA  NC_009800  2552574  2552651  78  tRNA-Val    unclonable  4.66609e-23  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4717  tRNA  NC_009800  4204969  4205046  78  tRNA-Thr    unclonable  1.16021e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4718  tRNA  NC_009800  4205054  4205138  85  tRNA-Tyr    unclonable  1.22023e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4719  tRNA  NC_009800  4205255  4205329  75  tRNA-Gly    unclonable  1.20782e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4720  tRNA  NC_009800  4205335  4205412  78  tRNA-Thr    unclonable  1.2703e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4724  tRNA  NC_009800  4417212  4417289  78  tRNA-Gly    unclonable  1.56815e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4725  tRNA  NC_009800  4417323  4417400  78  tRNA-Gly    unclonable  1.64891e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4740  misc_RNA  NC_009800  1210269  1210437  169  sraB RNA    unclonable  3.70656e-23  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>