59 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
EcHS_A0146  CDS  NC_009800  156777  158141  -  1365  poly(A) polymerase I  YP_001456927  unclonable  4.2681200000000003e-19  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0408  CDS  NC_009800  427737  430811  -  3075  beta-D-galactosidase  YP_001457178  unclonable  0.0000000000000144327  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0409  CDS  NC_009800  430934  432025  -  1092  lac repressor  YP_001457179  unclonable  3.9973e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0513  CDS  NC_009800  521198  522496  +  1299  trigger factor  YP_001457281  unclonable  2.68965e-19  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0684    NC_009800  698836  700047  -  1212      unclonable  8.744909999999999e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0731  CDS  NC_009800  741289  741936  -  648  flavodoxin FldA  YP_001457482  unclonable  1.8987999999999998e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0732  CDS  NC_009800  741959  742252  -  294  LexA regulated protein  YP_001457483  unclonable  1.95489e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0733  CDS  NC_009800  742392  743156  -  765  hypothetical protein  YP_001457484  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0796  CDS  NC_009800  806452  807243  +  792  tol-pal system protein YbgF  YP_001457542  unclonable  5.27837e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0995  CDS  NC_009800  993572  997561  +  3990  DNA translocase FtsK  YP_001457731  unclonable  0.00000000000212407  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1063  CDS  NC_009800  1077566  1078084  -  519  3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  YP_001457793  unclonable  6.76561e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1064  CDS  NC_009800  1078153  1079913  -  1761  S16 family peptidase  YP_001457794  unclonable  1.20941e-18  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1065  CDS  NC_009800  1080099  1080551  +  453  hypothetical protein  YP_001457795  unclonable  1.95489e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1066  CDS  NC_009800  1080627  1081667  -  1041  outer membrane protein A  YP_001457796  unclonable  6.14063e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1208  CDS  NC_009800  1208620  1209579  +  960  23S rRNA pseudouridylate synthase C  YP_001457930  unclonable  5.7217399999999996e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1209  CDS  NC_009800  1209691  1210314  -  624  Maf-like protein  YP_001457931  unclonable  7.40436e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1210  CDS  NC_009800  1210474  1210995  +  522  hypothetical protein  YP_001457932  unclonable  3.98054e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1211  CDS  NC_009800  1211047  1211220  +  174  50S ribosomal protein L32  YP_001457933  unclonable  2.3151100000000002e-23  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1212  CDS  NC_009800  1211301  1212371  +  1071  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsX  YP_001457934  unclonable  5.7805e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1213  CDS  NC_009800  1212439  1213392  +  954  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  YP_001457935  unclonable  2.16382e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1214  CDS  NC_009800  1213408  1214337  +  930  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  YP_001457936  unclonable  1.78744e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1215  CDS  NC_009800  1214350  1215084  +  735  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  YP_001457937  unclonable  7.480399999999999e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1216  CDS  NC_009800  1215295  1215531  +  237  acyl carrier protein  YP_001457938  unclonable  3.59624e-23  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1315  CDS  NC_009800  1312153  1313409  +  1257  glutamyl-tRNA reductase  YP_001458033  unclonable  2.01079e-19  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1391  CDS  NC_009800  1388121  1389290  +  1170  tetratricopeptide repeat protein  YP_001458105  unclonable  4.935719999999999e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1629  CDS  NC_009800  1650585  1651331  +  747  3-hydroxy acid dehydrogenase  YP_001458333  unclonable  5.5514199999999995e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1630  CDS  NC_009800  1651420  1652106  +  687  GntR family transcriptional regulator  YP_001458334  unclonable  3.79226e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1631  CDS  NC_009800  1652241  1652513  -  273  hypothetical protein  YP_001458335  unclonable  3.90088e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1739  CDS  NC_009800  1760890  1761822  -  933  putative DNA-binding transcriptional regulator  YP_001458443  unclonable  9.075529999999999e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A1758  CDS  NC_009800  1779445  1779681  +  237  major outer membrane lipoprotein  YP_001458460  unclonable  2.20557e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A2010  CDS  NC_009800  2011896  2012444  -  549  phosphatidylglycerophosphate synthetase  YP_001458701  unclonable  1.8607999999999997e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A2108  CDS  NC_009800  2096806  2098446  -  1641  hypothetical protein  YP_001458788  unclonable  6.24671e-19  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A2537  CDS  NC_009800  2550659  2552074  -  1416  glutamyl-tRNA synthetase  YP_001459189  unclonable  1.81823e-19  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A2660  CDS  NC_009800  2671872  2673242  +  1371  exodeoxyribonuclease VII large subunit  YP_001459302  unclonable  1.87444e-19  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A2952  CDS  NC_009800  2959859  2960776  -  918  DNA-binding transcriptional activator GcvA  YP_001459580  unclonable  2.32585e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A3245  CDS  NC_009800  3254226  3254441  +  216  30S ribosomal protein S21  YP_001459859  unclonable  1.3626999999999999e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A3378  CDS  NC_009800  3383788  3384045  -  258  50S ribosomal protein L27  YP_001459987  unclonable  1.4045e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A3379  CDS  NC_009800  3384066  3384377  -  312  50S ribosomal protein L21  YP_001459988  unclonable  2.03555e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A3380  CDS  NC_009800  3384636  3385607  +  972  octaprenyl diphosphate synthase  YP_001459989  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4208  CDS  NC_009800  4203658  4204608  -  951  pantothenate kinase  YP_001460765  unclonable  2.8712499999999996e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4213  CDS  NC_009800  4205526  4206710  +  1185  elongation factor Tu  YP_001460766  unclonable  7.910989999999999e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4214  CDS  NC_009800  4206940  4207323  +  384  preprotein translocase subunit SecE  YP_001460767  unclonable  6.05954e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4215  CDS  NC_009800  4207325  4207870  +  546  transcription antitermination protein NusG  YP_001460768  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4216  CDS  NC_009800  4208029  4208457  +  429  50S ribosomal protein L11  YP_001460769  unclonable  7.8656399999999995e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4217  CDS  NC_009800  4208461  4209165  +  705  50S ribosomal protein L1  YP_001460770  unclonable  6.26604e-21  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4409  CDS  NC_009800  4417664  4418803  -  1140  iron-sulfur cluster binding protein  YP_001460947  unclonable  7.448649999999999e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4517  CDS  NC_009800  4522377  4523477  +  1101  putative permease  YP_001461054  unclonable  4.2463499999999995e-20  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4654  tRNA  NC_009800  726065  726143  -  79  tRNA-Met    unclonable  2.94372e-23  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4655  tRNA  NC_009800  807407  807484  +  78  tRNA-Lys    unclonable  8.59319e-23  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4681  tRNA  NC_009800  2552333  2552408  +  76  tRNA-Val    unclonable  4.95676e-23  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4682  tRNA  NC_009800  2552452  2552529  +  78  tRNA-Val    unclonable  4.8092300000000003e-23  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4683  tRNA  NC_009800  2552574  2552651  +  78  tRNA-Val    unclonable  4.66609e-23  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4717  tRNA  NC_009800  4204969  4205046  +  78  tRNA-Thr    unclonable  1.16021e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4718  tRNA  NC_009800  4205054  4205138  +  85  tRNA-Tyr    unclonable  1.22023e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4719  tRNA  NC_009800  4205255  4205329  +  75  tRNA-Gly    unclonable  1.20782e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4720  tRNA  NC_009800  4205335  4205412  +  78  tRNA-Thr    unclonable  1.2702999999999999e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4724  tRNA  NC_009800  4417212  4417289  +  78  tRNA-Gly    unclonable  1.56815e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4725  tRNA  NC_009800  4417323  4417400  +  78  tRNA-Gly    unclonable  1.64891e-22  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A4740  misc_RNA  NC_009800  1210269  1210437  +  169  sraB RNA    unclonable  3.7065600000000004e-23  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>