96 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
EcE24377A_0058  CDS  NC_009801  57952  60306  2355  organic solvent tolerance protein  YP_001461226  unclonable  8.25468e-11  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0059  CDS  NC_009801  60561  61376  816  Dna-J like membrane chaperone protein  YP_001461227  unclonable  6.13097e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0096  CDS  NC_009801  105672  106934  1263  cell division protein FtsA  YP_001461264  unclonable  4.50452e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0098  CDS  NC_009801  108247  109164  918  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_001461266  unclonable  7.41814e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0181  CDS  NC_009801  198558  200990  2433  outer membrane protein assembly factor YaeT  YP_001461346  unclonable  1.94171e-10  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0182  CDS  NC_009801  201112  201597  486  periplasmic chaperone  YP_001461347  unclonable  2.31614e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0183  CDS  NC_009801  201601  202626  1026  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  YP_001461348  unclonable  2.31464e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0368  CDS  NC_009801  397825  400899  3075  beta-D-galactosidase  YP_001461520  unclonable  2.19694e-09  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0369  CDS  NC_009801  401022  402113  1092  lac repressor  YP_001461521  unclonable  3.75664e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0472  CDS  NC_009801  490281  491579  1299  trigger factor  YP_001461623  unclonable  2.31464e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0663  CDS  NC_009801  691395  691712  318  hypothetical protein  YP_001461805  unclonable  9.19857e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0712  CDS  NC_009801  734045  734692  648  flavodoxin FldA  YP_001461848  unclonable  8.98248e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0713  CDS  NC_009801  734715  735008  294  LexA regulated protein  YP_001461849  unclonable  2.36338e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0714  CDS  NC_009801  735148  735912  765  hypothetical protein  YP_001461850  unclonable  1.45499e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0715  CDS  NC_009801  736097  736642  546  replication initiation regulator SeqA  YP_001461851  unclonable  6.19377e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0716  CDS  NC_009801  736668  738308  1641  phosphoglucomutase  YP_001461852  unclonable  2.2067e-11  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0771  CDS  NC_009801  799492  800283  792  tol-pal system protein YbgF  YP_001461903  unclonable  9.73622e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_0965  CDS  NC_009801  982634  986740  4107  DNA translocase FtsK  YP_001462088  unclonable  3.42338e-08  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1007  CDS  NC_009801  1027115  1027798  684  cytidylate kinase  YP_001462128  unclonable  8.20305e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1008  CDS  NC_009801  1027909  1029582  1674  30S ribosomal protein S1  YP_001462129  unclonable  3.83759e-11  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1061  CDS  NC_009801  1085141  1086250  1110  MOSC domain-containing protein  YP_001462180  unclonable  1.42563e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1063  CDS  NC_009801  1086494  1088602  2109  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  YP_001462181  unclonable  3.72198e-11  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1064  CDS  NC_009801  1088614  1090521  1908  ABC transporter ATPase component  YP_001462182  unclonable  1.87784e-11  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1066  CDS  NC_009801  1091909  1093549  1641  paraquat-inducible protein B  YP_001462184  unclonable  8.23988e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1067  CDS  NC_009801  1093546  1094109  564  hypothetical protein  YP_001462185  unclonable  1.85697e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1068  CDS  NC_009801  1094602  1095120  519  3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  YP_001462186  unclonable  3.1001e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1069  CDS  NC_009801  1095189  1096949  1761  S16 family peptidase  YP_001462187  unclonable  2.6445e-11  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1071  CDS  NC_009801  1097662  1098714  1053  outer membrane protein A  YP_001462189  unclonable  3.3965e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1072  CDS  NC_009801  1099071  1099580  510  SOS cell division inhibitor  YP_001462191  unclonable  3.94327e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1073  CDS  NC_009801  1098869  1099087  219  hypothetical protein  YP_001462190  unclonable  1.36121e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1075  CDS  NC_009801  1099799  1100428  630  TfoX family protein  YP_001462192  unclonable  5.5454e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1215  CDS  NC_009801  1229046  1229282  237  acyl carrier protein  YP_001462326  unclonable  1.03813e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1216  CDS  NC_009801  1229370  1230611  1242  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  YP_001462327  unclonable  3.22772e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1218  CDS  NC_009801  1231543  1232565  1023  hypothetical protein  YP_001462329  unclonable  1.09839e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1219  CDS  NC_009801  1232555  1233196  642  thymidylate kinase  YP_001462330  unclonable  2.91901e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1419  CDS  NC_009801  1422274  1423128  855  Rha family phage regulatory protein  YP_001462521  unclonable  1.00347e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1482  CDS  NC_009801  1472287  1473456  1170  tetratricopeptide repeat protein  YP_001462579  unclonable  4.55068e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1749  CDS  NC_009801  1749064  1749750  687  GntR family transcriptional regulator  YP_001462832  unclonable  2.22448e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1872  CDS  NC_009801  1864684  1865616  933  putative DNA-binding transcriptional regulator  YP_001462954  unclonable  1.44024e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1873  CDS  NC_009801  1863662  1864687  1026  DNA-binding transcriptional repressor PurR  YP_001462953  unclonable  3.26079e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_1893  CDS  NC_009801  1883240  1883476  237  major outer membrane lipoprotein  YP_001462971  unclonable  1.01718e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2022  CDS  NC_009801  2005107  2006315  1209  IS605 family transposase OrfB  YP_001463096  unclonable  2.53507e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2060  CDS  NC_009801  2042433  2043131  699  putative solute/DNA competence effector  YP_001463133  unclonable  8.98248e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2145  CDS  NC_009801  2119090  2119638  549  phosphatidylglycerophosphate synthetase  YP_001463215  unclonable  7.41814e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2186  CDS  NC_009801  2154570  2154797  228  hypothetical protein  YP_001463255  unclonable  9.48052e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2250  CDS  NC_009801  2214852  2215076  225  hypothetical protein  YP_001463316  unclonable  1.61375e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2251  CDS  NC_009801  2215116  2215592  477  hypothetical protein  YP_001463317  unclonable  3.46124e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2252  CDS  NC_009801  2215936  2216331  396  transcriptional repressor DicA  YP_001463318  unclonable  2.18001e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2257  CDS  NC_009801  2220180  2221208  1029  phage integrase family site specific recombinase  YP_001463323  unclonable  2.31464e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2259  CDS  NC_009801  2221477  2222274  798  hypothetical protein  YP_001463324  unclonable  1.06573e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2267  CDS  NC_009801  2236030  2237670  1641  hypothetical protein  YP_001463330  unclonable  1.0697e-11  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2269  CDS  NC_009801  2237791  2238741  951  transcriptional regulator Cbl  YP_001463331  unclonable  8.89139e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2593  CDS  NC_009801  2589076  2589618  543  NUDIX family hydrolase  YP_001463643  unclonable  5.83084e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2689  CDS  NC_009801  2681413  2682828  1416  glutamyl-tRNA synthetase  YP_001463736  unclonable  5.85345e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2694  CDS  NC_009801  2683937  2684863  927  LysR family transcriptional regulator  YP_001463738  unclonable  2.01069e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2695  CDS  NC_009801  2683605  2683946  342  hypothetical protein  YP_001463737  unclonable  2.11518e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2697  CDS  NC_009801  2684953  2685951  999  bile acid/Na+ symporter family protein  YP_001463739  unclonable  2.09356e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2794    NC_009801  2784631  2786001  1371      unclonable  9.77059e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_2898  CDS  NC_009801  2900451  2901041  591  heat shock protein GrpE  YP_001463933  unclonable  5.38048e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_3088  CDS  NC_009801  3091494  3093728  2235  GDP/GTP pyrophosphokinase  YP_001464106  unclonable  2.21392e-10  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_3112  CDS  NC_009801  3120220  3121320  1101  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  YP_001464130  unclonable  1.30243e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_3113  CDS  NC_009801  3121313  3121708  396  hypothetical protein  YP_001464131  unclonable  1.03813e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_3114  CDS  NC_009801  3121727  3122644  918  DNA-binding transcriptional activator GcvA  YP_001464132  unclonable  6.98481e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_3150  CDS  NC_009801  3165139  3165669  531  dinucleoside polyphosphate hydrolase  YP_001464165  unclonable  2.88941e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_3151  CDS  NC_009801  3166354  3167043  690  DNA mismatch repair protein  YP_001464166  unclonable  4.14624e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_3238  CDS  NC_009801  3258952  3259281  330  Z-ring-associated protein  YP_001464249  unclonable  2.74743e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_3504  CDS  NC_009801  3513573  3514346  774  zinc transporter ZupT  YP_001464501  unclonable  2.24726e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_3670  CDS  NC_009801  3670020  3670277  258  50S ribosomal protein L27  YP_001464660  unclonable  9.67389e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_3671  CDS  NC_009801  3670298  3670609  312  50S ribosomal protein L21  YP_001464662  unclonable  1.25607e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_3672  CDS  NC_009801  3670271  3670816  546  hypothetical protein  YP_001464661  unclonable  2.48551e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_4136  CDS  NC_009801  4126279  4127088  810  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  YP_001465115  unclonable  8.71365e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_4382  CDS  NC_009801  4372179  4374965  2787  DNA polymerase I  YP_001465344  unclonable  1.70331e-10  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_4519  CDS  NC_009801  4512970  4514154  1185  elongation factor Tu  YP_001465471  unclonable  3.4313e-12  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_4520  CDS  NC_009801  4514384  4514767  384  preprotein translocase subunit SecE  YP_001465472  unclonable  1.32073e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_4521  CDS  NC_009801  4514769  4515314  546  transcription antitermination protein NusG  YP_001465473  unclonable  2.38759e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_4522  CDS  NC_009801  4515419  4516420  1002  hypothetical protein  YP_001465474  unclonable  9.2596e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_4719  CDS  NC_009801  4723729  4724274  546  oligoribonuclease  YP_001465662  unclonable  3.75023e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_4774    NC_009801  4768565  4769194  630      unclonable  2.86011e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_4956  CDS  NC_009801  4940967  4941440  474  hypothetical protein  YP_001465882  unclonable  1.76607e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_5018  tRNA  NC_009801  720343  720427  85  tRNA-Leu    unclonable  5.85411e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_5019  tRNA  NC_009801  720436  720512  77  tRNA-Met    unclonable  5.40299e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_5020  tRNA  NC_009801  800448  800523  76  tRNA-Lys    unclonable  7.9938e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_5021  tRNA  NC_009801  800659  800734  76  tRNA-Val    unclonable  7.9938e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_5039  tRNA  NC_009801  2118863  2118938  76  tRNA-Gly    unclonable  1.0276e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_5040  tRNA  NC_009801  2221294  2221383  90  tRNA-Ser    unclonable  6.8764e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_5041  tRNA  NC_009801  2222375  2222450  76  tRNA-Asn    unclonable  1.17093e-13  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_5042  tRNA  NC_009801  2235854  2235929  76  tRNA-Asn    unclonable  4.64951e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_5043  tRNA  NC_009801  2237678  2237753  76  tRNA-Asn    unclonable  3.44379e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_5049  tRNA  NC_009801  2683087  2683162  76  tRNA-Val    unclonable  6.03353e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_5050  tRNA  NC_009801  2683207  2683282  76  tRNA-Val    unclonable  6.8764e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_5051  tRNA  NC_009801  2683329  2683404  76  tRNA-Val    unclonable  6.73895e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_5052  tRNA  NC_009801  2683409  2683484  76  tRNA-Lys    unclonable  7.15976e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_5062  tRNA  NC_009801  2978967  2979043  77  tRNA-Arg    unclonable  1.87047e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_5063  tRNA  NC_009801  2979047  2979139  93  tRNA-Ser    unclonable  1.88963e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_5102  tRNA  NC_009801  4512699  4512773  75  tRNA-Gly    unclonable  6.1566e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_5103  tRNA  NC_009801  4512780  4512855  76  tRNA-Thr    unclonable  6.47348e-14  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>