177 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Sbal_0001  CDS  NC_009052  41  1429  1389  chromosomal replication initiation protein  YP_001048407  unclonable  2.57358e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0002  CDS  NC_009052  1449  2549  1101  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001048408  unclonable  8.48773e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0053  CDS  NC_009052  63394  66159  2766  DNA polymerase I  YP_001048458  unclonable  9.15793e-06  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0212  CDS  NC_009052  242378  243151  774  hypothetical protein  YP_001048615  unclonable  1.16601e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0230  CDS  NC_009052  260780  262033  1254  tetratricopeptide domain-containing protein  YP_001048633  unclonable  1.37712e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0231  CDS  NC_009052  262434  264413  1980  cytochrome c-type biogenesis protein CcmF  YP_001048634  unclonable  3.23777e-07  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0232  CDS  NC_009052  264425  264979  555  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  YP_001048635  unclonable  2.93816e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0233  CDS  NC_009052  264976  265455  480  cytochrome C biogenesis protein  YP_001048636  unclonable  1.46648e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0234  CDS  NC_009052  265452  266039  588  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_001048637  unclonable  2.90768e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0298  CDS  NC_009052  332798  334975  2178  TonB-dependent receptor  YP_001048700  unclonable  5.94671e-07  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0380  CDS  NC_009052  421599  422918  1320  N-acetylglutamate synthase  YP_001048781  unclonable  1.81036e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0381  CDS  NC_009052  423038  423577  540  hypothetical protein  YP_001048782  unclonable  5.37441e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0405  CDS  NC_009052  452706  453941  1236  cell division protein FtsA  YP_001048806  unclonable  4.57966e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0406  CDS  NC_009052  453975  455162  1188  cell division protein FtsZ  YP_001048807  unclonable  3.85865e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0410  CDS  NC_009052  457710  460436  2727  preprotein translocase subunit SecA  YP_001048811  unclonable  6.68842e-06  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0513  CDS  NC_009052  576619  577143  525  hypothetical protein  YP_001048911  unclonable  3.97292e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0555  CDS  NC_009052  627488  628909  1422  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_001048953  unclonable  2.30448e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0680  CDS  NC_009052  772272  774830  2559  TonB-dependent receptor  YP_001049077  unclonable  2.04176e-06  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0685  CDS  NC_009052  778174  780258  2085  endothelin-converting protein 1  YP_001049082  unclonable  1.74697e-07  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0791  CDS  NC_009052  896039  896626  588  hypothetical protein  YP_001049185  unclonable  6.70126e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0802  CDS  NC_009052  907787  907963  177  hypothetical protein  YP_001049196  unclonable  5.53909e-11  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0877  CDS  NC_009052  997203  998891  1689  glucan biosynthesis protein D  YP_001049271  unclonable  4.43395e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0904  CDS  NC_009052  1035956  1036864  909  hypothetical protein  YP_001049298  unclonable  4.6277e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0980  CDS  NC_009052  1122974  1125271  2298  organic solvent tolerance protein  YP_001049373  unclonable  9.00172e-07  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1000  CDS  NC_009052  1146537  1146842  306  hypothetical protein  YP_001049393  unclonable  1.03253e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1001  CDS  NC_009052  1146986  1148254  1269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001049394  unclonable  6.19946e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1002  CDS  NC_009052  1148266  1148979  714  two component transcriptional regulator  YP_001049395  unclonable  4.71824e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1015  CDS  NC_009052  1158838  1160463  1626  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001049408  unclonable  4.34326e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1016  CDS  NC_009052  1161249  1162010  762  putative lipoprotein  YP_001049409  unclonable  1.50012e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1083    NC_009052  1245955  1248752  2798      unclonable  8.10703e-06  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1147  CDS  NC_009052  1325231  1325446  216  30S ribosomal protein S21  YP_001049535  unclonable  1.10786e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1148  CDS  NC_009052  1325662  1326678  1017  putative DNA-binding/iron metalloprotein/AP endonuclease  YP_001049536  unclonable  4.44335e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1182  CDS  NC_009052  1364585  1365652  1068  putative adenylate/guanylate cyclase  YP_001049569  unclonable  4.31014e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1183  CDS  NC_009052  1365775  1366446  672  DNA mismatch repair protein  YP_001049570  unclonable  5.48416e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1199  CDS  NC_009052  1380541  1382331  1791  GTP-binding protein LepA  YP_001049586  unclonable  1.13159e-07  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1212  CDS  NC_009052  1392751  1393497  747  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_001049599  unclonable  4.48522e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1213  CDS  NC_009052  1393532  1393885  354  50S ribosomal protein L19  YP_001049600  unclonable  8.88328e-11  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1223  CDS  NC_009052  1406823  1407272  450  cytochrome c, class II  YP_001049610  unclonable  3.08946e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1232  CDS  NC_009052  1416743  1420027  3285  peptidase S41  YP_001049619  unclonable  5.24055e-05  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1356  CDS  NC_009052  1555923  1556543  621  heat shock protein GrpE  YP_001049743  unclonable  8.27789e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1379  CDS  NC_009052  1583843  1585141  1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_001049766  unclonable  5.0186e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1461  CDS  NC_009052  1694533  1694997  465  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  YP_001049848  unclonable  4.43869e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1590  CDS  NC_009052  1853653  1855845  2193  decaheme cytochrome c  YP_001049973  unclonable  4.52412e-07  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1601  CDS  NC_009052  1869367  1870746  1380  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_001049984  unclonable  1.05927e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1602  CDS  NC_009052  1870897  1871751  855  bifunctional 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/ 5,10-methylene-tetrahydrofolate cyclohydrolase  YP_001049985  unclonable  1.25138e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1603  CDS  NC_009052  1872731  1874035  1305  trigger factor  YP_001049986  unclonable  7.36756e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1606  CDS  NC_009052  1876231  1878585  2355  ATP-dependent protease La  YP_001049989  unclonable  9.76039e-07  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1631  CDS  NC_009052  1904800  1906011  1212  porin  YP_001050014  unclonable  1.33613e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1633  CDS  NC_009052  1910001  1912817  2817  TonB-dependent receptor  YP_001050016  unclonable  1.09848e-05  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1709  CDS  NC_009052  1987019  1988578  1560  sulphate transporter  YP_001050087  unclonable  3.77165e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1710  CDS  NC_009052  1988733  1992167  3435  ribonuclease  YP_001050088  unclonable  5.80294e-05  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1714  CDS  NC_009052  1995454  1995978  525  hypothetical protein  YP_001050092  unclonable  2.35289e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1715  CDS  NC_009052  1995995  1996165  171  50S ribosomal protein L32  YP_001050093  unclonable  6.25062e-11  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1716  CDS  NC_009052  1996181  1997209  1029  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsX  YP_001050094  unclonable  2.43061e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1739  CDS  NC_009052  2023230  2023901  672  ribonuclease T  YP_001050117  unclonable  7.63816e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1740  CDS  NC_009052  2024043  2024912  870  OmpA/MotB domain-containing protein  YP_001050118  unclonable  2.40538e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1741  CDS  NC_009052  2025720  2027903  2184  prolyl oligopeptidase  YP_001050119  unclonable  7.89532e-07  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1742  CDS  NC_009052  2028075  2028476  402  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  YP_001050120  unclonable  2.82054e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1743  CDS  NC_009052  2028466  2029152  687  MotA/TolQ/ExbB proton channel  YP_001050121  unclonable  9.15639e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1744  CDS  NC_009052  2029152  2029586  435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  YP_001050122  unclonable  2.76409e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1745  CDS  NC_009052  2029587  2030615  1029  TolA family protein  YP_001050123  unclonable  2.94178e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1746  CDS  NC_009052  2030629  2031957  1329  translocation protein TolB  YP_001050124  unclonable  1.49314e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1747  CDS  NC_009052  2032004  2032540  537  OmpA domain-containing protein  YP_001050125  unclonable  2.84949e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1748  CDS  NC_009052  2032565  2033314  750  TPR repeat-containing protein  YP_001050126  unclonable  7.56054e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1781  CDS  NC_009052  2073622  2075556  1935  putative serine protein kinase, PrkA  YP_001050157  unclonable  2.5136e-07  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1782  CDS  NC_009052  2075842  2076426  585  superoxide dismutase  YP_001050158  unclonable  4.39358e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1783  CDS  NC_009052  2076651  2076983  333  glutaredoxin-like protein  YP_001050159  unclonable  1.51147e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1868  CDS  NC_009052  2167521  2168186  666  septum formation inhibitor  YP_001050243  unclonable  4.0137e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1914  CDS  NC_009052  2223939  2225339  1401  asparaginyl-tRNA synthetase  YP_001050289  unclonable  1.57072e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1998  CDS  NC_009052  2320045  2320983  939  LysR family transcriptional regulator  YP_001050371  unclonable  2.76986e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_1999  CDS  NC_009052  2321167  2321637  471  ribonuclease H  YP_001050372  unclonable  2.90768e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2000  CDS  NC_009052  2321708  2322436  729  DNA polymerase III, epsilon subunit  YP_001050373  unclonable  8.79357e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2001  CDS  NC_009052  2322447  2323820  1374  hypothetical protein  YP_001050374  unclonable  1.25665e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2055  CDS  NC_009052  2380549  2382396  1848  signal peptide peptidase SppA, 67K type  YP_001050425  unclonable  1.00228e-07  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2062  CDS  NC_009052  2391138  2393888  2751  DNA gyrase, A subunit  YP_001050432  unclonable  4.88148e-06  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2077  CDS  NC_009052  2409295  2411052  1758  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_001050447  unclonable  8.61325e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2156  CDS  NC_009052  2500456  2503209  2754  cell divisionFtsK/SpoIIIE  YP_001050522  unclonable  8.52872e-06  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2227  CDS  NC_009052  2576514  2577290  777  alpha/beta hydrolase fold  YP_001050592  unclonable  6.90683e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2228  CDS  NC_009052  2577392  2577613  222  hypothetical protein  YP_001050593  unclonable  6.4451e-11  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2229  CDS  NC_009052  2577624  2577896  273  LexA regulated protein  YP_001050594  unclonable  7.71947e-11  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2230  CDS  NC_009052  2577951  2578478  528  flavodoxin FldA  YP_001050595  unclonable  2.7082e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2231  CDS  NC_009052  2578565  2579743  1179  hypothetical protein  YP_001050596  unclonable  4.96649e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2232  CDS  NC_009052  2579789  2580349  561  elongation factor P  YP_001050597  unclonable  3.15255e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2233  CDS  NC_009052  2580493  2581827  1335  glutamate--ammonia ligase  YP_001050598  unclonable  1.37712e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2234  CDS  NC_009052  2582124  2583506  1383  Na+/H+ antiporter NhaC  YP_001050599  unclonable  1.46324e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2305  CDS  NC_009052  2682424  2683203  780  glutamine amidotransferase class-II  YP_001050669  unclonable  9.53418e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2391  CDS  NC_009052  2781810  2782715  906  alpha-L-glutamate ligase  YP_001050753  unclonable  1.34298e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2407  CDS  NC_009052  2799113  2800114  1002  hypothetical protein  YP_001050769  unclonable  9.06332e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2468  CDS  NC_009052  2881805  2882275  471  17 kDa surface antigen  YP_001050830  unclonable  3.41658e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2469  CDS  NC_009052  2882330  2883043  714  leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase  YP_001050831  unclonable  9.63207e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2470  CDS  NC_009052  2883030  2883740  711  arginyl-tRNA-protein transferase  YP_001050832  unclonable  7.71659e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2471  CDS  NC_009052  2883823  2884041  219  translation initiation factor IF-1  YP_001050833  unclonable  8.28096e-11  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2509  CDS  NC_009052  2932085  2932516  432  ferric uptake regulator  YP_001050871  unclonable  6.31479e-11  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2557  CDS  NC_009052  2993273  2994136  864  heat shock protein HtpX  YP_001050919  unclonable  2.24131e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2573  CDS  NC_009052  3018137  3018502  366  hypothetical protein  YP_001050935  unclonable  2.12761e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2574  CDS  NC_009052  3018690  3022133  3444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  YP_001050936  unclonable  5.34901e-05  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2575  CDS  NC_009052  3022171  3022725  555  adenine phosphoribosyltransferase  YP_001050937  unclonable  3.28192e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2576  CDS  NC_009052  3022990  3023358  369  hypothetical protein  YP_001050938  unclonable  1.63875e-10  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2577  CDS  NC_009052  3023440  3023562  123  hypothetical protein  YP_001050939  unclonable  6.00425e-11  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_2589  CDS  NC_009052  3032992  3034935  1944  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  YP_001050951  unclonable  9.15199e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>