36 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Nmul_A0055  CDS  NC_007614  61303  62151  849  integrase catalytic subunit  YP_410756  unclonable  3.15593e-07  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0158  CDS  NC_007614  165600  166439  840  hypothetical protein  YP_410858  unclonable  1.30307e-07  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0262  CDS  NC_007614  283861  284481  621  hypothetical protein  YP_410962  unclonable  1.01412e-07  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0276  CDS  NC_007614  296883  298358  1476  hypothetical protein  YP_410976  unclonable  5.56159e-06  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0483  CDS  NC_007614  540160  542055  1896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_411183  unclonable  1.61272e-05  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0562  CDS  NC_007614  647597  648469  873  phosphoribulokinase  YP_411262  unclonable  2.47732e-07  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0673  CDS  NC_007614  772035  772838  804  RNA methyltransferase TrmH, group 1  YP_411372  unclonable  7.36147e-08  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0798  CDS  NC_007614  913519  914349  831  ammonia monooxygenase/methane monooxygenase, subunit C  YP_411497  unclonable  2.0472e-07  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0872  CDS  NC_007614  990746  992275  1530  hypothetical protein  YP_411567  unclonable  2.69659e-06  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1140  CDS  NC_007614  1312500  1312817  318  hypothetical protein  YP_411835  unclonable  2.98564e-08  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1141  CDS  NC_007614  1312849  1313169  321  hypothetical protein  YP_411836  unclonable  2.83805e-08  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1142  CDS  NC_007614  1313347  1313667  321  hypothetical protein  YP_411837  unclonable  2.25179e-08  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1390  CDS  NC_007614  1581954  1583093  1140  hypothetical protein  YP_412085  unclonable  6.76729e-07  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1391  CDS  NC_007614  1583207  1583512  306  hypothetical protein  YP_412086  unclonable  2.32117e-08  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1398  CDS  NC_007614  1592557  1593132  576  hypothetical protein  YP_412093  unclonable  3.13982e-08  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1530  CDS  NC_007614  1750490  1751014  525  hypothetical protein  YP_412225  unclonable  4.32543e-08  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1531  CDS  NC_007614  1751511  1752080  570  XRE family transcriptional regulator  YP_412226  unclonable  2.56618e-08  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1532  CDS  NC_007614  1752238  1752513  276  hypothetical protein  YP_412227  unclonable  9.23745e-09  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1533  CDS  NC_007614  1752600  1752926  327  hypothetical protein  YP_412228  unclonable  1.32495e-08  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1534  CDS  NC_007614  1753284  1753541  258  hypothetical protein  YP_412229  unclonable  1.31132e-08  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1601  CDS  NC_007614  1834649  1835062  414  chain A, red copper protein nitrosocyanin  YP_412294  unclonable  5.67409e-08  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A1739  CDS  NC_007614  1991274  1992218  945  transcriptional regulator CysB-like protein  YP_412428  unclonable  2.79611e-07  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2114  CDS  NC_007614  2409683  2410480  798  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_412799  unclonable  1.09897e-07  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2215  CDS  NC_007614  2514979  2515674  696  hypothetical protein  YP_412899  unclonable  1.53024e-07  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2337  CDS  NC_007614  2662757  2663029  273  histone-like DNA-binding protein  YP_413020  unclonable  4.98066e-08  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2344  CDS  NC_007614  2671276  2672934  1659  chaperonin GroEL  YP_413027  unclonable  5.84882e-06  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2345  CDS  NC_007614  2672987  2673277  291  co-chaperonin GroES  YP_413028  unclonable  2.86758e-08  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2346  CDS  NC_007614  2673587  2673994  408  hypothetical protein  YP_413029  unclonable  4.37044e-08  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2486  CDS  NC_007614  2840623  2841540  918  peptidase M23B  YP_413167  unclonable  4.62301e-07  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2561  CDS  NC_007614  2933433  2934716  1284  porin  YP_413242  unclonable  6.90644e-07  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2636  CDS  NC_007614  3022090  3022833  744  coenzyme PQQ synthesis C  YP_413315  unclonable  2.30903e-07  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2663  CDS  NC_007614  3056810  3057661  852  formate/nitrite transporter  YP_413342  unclonable  1.34322e-07  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2664  CDS  NC_007614  3057699  3058322  624  hypothetical protein  YP_413343  unclonable  4.68896e-08  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2766  CDS  NC_007614  3171483  3172313  831  ammonia monooxygenase/methane monooxygenase, subunit C  YP_413445  unclonable  2.88228e-07  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A2767  CDS  NC_007614  3172696  3173553  858  parB-like partition proteins  YP_413446  unclonable  1.94668e-07  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_AR0043  tRNA  NC_007614  2662667  2662742  76  tRNA-Val    unclonable  2.80883e-08  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>