18 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Noc_0443  CDS  NC_007484  479823  479963  141  hypothetical protein  YP_342497  unclonable  7.95345e-13  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0677  CDS  NC_007484  734486  734965  480  hypothetical protein  YP_342726  unclonable  3.64222e-12  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0888  CDS  NC_007484  969458  969727  270  acylphosphatase  YP_342930  unclonable  1.0114e-12  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
 
Noc_0889  CDS  NC_007484  970002  970457  456  multicopper oxidase, type 3  YP_342931  unclonable  3.56897e-12  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0993  CDS  NC_007484  1100150  1100668  519  hypothetical protein  YP_343032  unclonable  3.79205e-12  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_1816  CDS  NC_007484  2057810  2058631  822  hemolysin-type calcium-binding region  YP_343816  unclonable  3.60233e-11  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
 
Noc_1817  CDS  NC_007484  2058831  2060198  1368  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  YP_343817  unclonable  9.64329e-10  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_1990  CDS  NC_007484  2288077  2289069  993  hypothetical protein  YP_343982  unclonable  1.22481e-10  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_2250  CDS  NC_007484  2598576  2599994  1419  glutamyl-tRNA synthetase  YP_344238  unclonable  3.47292e-10  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_2501  CDS  NC_007484  2845776  2846966  1191  monooxygenase subunit B protein  YP_344484  unclonable  1.58949e-10  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_2502  CDS  NC_007484  2847092  2847835  744  ammonia monooxygenase  YP_344485  unclonable  1.36472e-11  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
 
Noc_2503  CDS  NC_007484  2848145  2848930  786  ammonia monooxygenase/methane monooxygenase, subunit C  YP_344486  unclonable  1.7705e-11  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
 
Noc_2532  CDS  NC_007484  2884629  2885588  960  OmpA/MotB  YP_344515  unclonable  6.51702e-11  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
 
Noc_2601  CDS  NC_007484  2954247  2955578  1332  hypothetical protein  YP_344584  unclonable  5.56017e-10  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_2651  CDS  NC_007484  3004009  3004485  477  hypothetical protein  YP_344634  unclonable  4.72667e-12  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_2769  CDS  NC_007484  3142269  3142628  360  RNA-binding protein, RNP-1  YP_344746  unclonable  1.35251e-12  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_2826  CDS  NC_007484  3201672  3202544  873  phosphoribulokinase  YP_344803  unclonable  4.54104e-11  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_2922  CDS  NC_007484  3305750  3306040  291  co-chaperonin GroES  YP_344898  unclonable  1.27335e-12  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>