22 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BURPS668_0115  CDS  NC_009074  112303  112719  417  glyoxalase family protein  YP_001057170  unclonable  3.44124e-13  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_0958  CDS  NC_009074  935586  935789  204  cold shock protein  YP_001058009  unclonable  1.17939e-13  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_2420  CDS  NC_009074  2384444  2385259  816  hypothetical protein  YP_001059451  unclonable  6.32671e-12  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_2483  tRNA  NC_009074  2447345  2447420  76  tRNA-Glu    unclonable  1.21548e-13  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_2484  tRNA  NC_009074  2447485  2447561  77  tRNA-Asp    unclonable  1.27815e-13  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_2485  tRNA  NC_009074  2447639  2447714  76  tRNA-Glu    unclonable  1.26526e-13  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_2815  tRNA  NC_009074  2780465  2780540  76  tRNA-Asn    unclonable  6.87096e-14  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_2941  CDS  NC_009074  2897400  2897603  204  cold-shock domain-contain protein  YP_001059958  unclonable  5.29081e-13  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_3544  CDS  NC_009074  3478514  3479290  777  enoyl-CoA hydratase  YP_001060550  unclonable  1.59011e-12  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_3545  CDS  NC_009074  3478414  3478527  114  hypothetical protein  YP_001060549  unclonable  5.03878e-14  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_3746  CDS  NC_009074  3657262  3657921  660  50S ribosomal protein L3  YP_001060750  unclonable  2.1686e-12  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_3773  CDS  NC_009074  3685867  3685980  114  lipolytic enzyme, G-D-S-L  YP_001060768  unclonable  1.31726e-13  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_3774  CDS  NC_009074  3685991  3687145  1155  lipolytic enzyme, G-D-S-L  YP_001060769  unclonable  2.41856e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_3797  CDS  NC_009074  3710725  3711555  831  ompW family protein  YP_001060792  unclonable  5.17916e-12  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_A0098  CDS  NC_009075  84609  84935  327  H-NS histone family protein  YP_001061104  unclonable  4.05362e-15  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_A0099  CDS  NC_009075  84941  85108  168  hypothetical protein  YP_001061105  unclonable  2.2921e-15  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_A0954  CDS  NC_009075  930578  930718  141  hypothetical protein  YP_001061953  unclonable  1.30872e-15  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_A0955  CDS  NC_009075  930723  930941  219  hypothetical protein  YP_001061954  unclonable  1.93351e-15  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_A0956  CDS  NC_009075  931015  931140  126  hypothetical protein  YP_001061955  unclonable  1.28264e-15  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_A1216  CDS  NC_009075  1158037  1159974  1938  collagenase  YP_001062213  unclonable  7.87421e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_A3001  CDS  NC_009075  2854266  2854406  141  hypothetical protein  YP_001063992  unclonable  5.53649e-16  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS668_A3002  CDS  NC_009075  2854549  2854839  291  H-NS histone family protein  YP_001063993  unclonable  1.36233e-15  n/a    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>