42 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BURPS1710b_0001  rRNA  NC_007434  533  648  116  5S ribosomal RNA    unclonable  4.61312e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0002  rRNA  NC_007434  830  3711  2882  23S ribosomal RNA    unclonable  2.80391e-08  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0003  tRNA  NC_007434  4065  4140  76  tRNA-Ala    unclonable  5.86808e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0004  tRNA  NC_007434  4175  4251  77  tRNA-Ile    unclonable  5.86808e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0005  rRNA  NC_007434  4334  5821  1488  16S ribosomal RNA    unclonable  1.29468e-09  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0026  CDS  NC_007434  31191  32021  831  OmpW family outer membrane protein  YP_331444  unclonable  5.41983e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0027  CDS  NC_007434  32208  33146  939  transcriptional regulatory protein  YP_331445  unclonable  7.39069e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0320  CDS  NC_007434  333973  335478  1506  hypothetical protein  YP_331735  unclonable  2.53408e-09  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0321  CDS  NC_007434  334989  335405  417  glyoxalase family protein  YP_331737  unclonable  3.22119e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0322  CDS  NC_007434  335807  336901  1095  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  YP_331738  unclonable  1.61378e-09  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_1113  CDS  NC_007434  1166664  1166978  315  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  YP_332526  unclonable  9.20872e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_1114  CDS  NC_007434  1166621  1169275  2655  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpA  YP_332525  unclonable  1.82282e-08  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_1115  CDS  NC_007434  1166882  1170730  3849  200 kDa antigen p200, putative  YP_332527  unclonable  2.01408e-07  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_1472  CDS  NC_007434  1542852  1544069  1218  hypothetical protein  YP_332881  unclonable  9.30484e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_1473  rRNA  NC_007434  1544706  1546193  1488  16S ribosomal RNA    unclonable  1.53483e-09  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_1953  CDS  NC_007434  2125504  2126235  732  hypothetical protein  YP_333352  unclonable  2.97307e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_2626  CDS  NC_007434  2906793  2908262  1470  hypothetical protein  YP_334013  unclonable  1.64664e-09  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_2627  CDS  NC_007434  2906882  2908462  1581  hypothetical protein  YP_334014  unclonable  2.22411e-09  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_2628  CDS  NC_007434  2907044  2908558  1515  glutamyl-tRNA synthetase  YP_334015  unclonable  1.91371e-09  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_2933  tRNA  NC_007434  3240254  3240329  76  tRNA-Asn    unclonable  1.03893e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_2934  tRNA  NC_007434  3240419  3240494  76  tRNA-Asn    unclonable  1.07091e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_2935  CDS  NC_007434  3240633  3241112  480  CreA protein  YP_334314  unclonable  2.38483e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_2936  CDS  NC_007434  3241161  3242507  1347  hypothetical protein  YP_334315  unclonable  8.67442e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_3041  CDS  NC_007434  3354933  3355136  204  cold shock transcription regulator protein  YP_334418  unclonable  2.33724e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_3776  CDS  NC_007434  4101549  4102208  660  50S ribosomal protein L3  YP_335140  unclonable  3.25408e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_3797  tRNA  NC_007434  4124739  4124824  86  tRNA-Tyr    unclonable  3.92981e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_3798  CDS  NC_007434  4125373  4125492  120  IS407A, transposase OrfA  YP_335158  unclonable  4.80288e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_3799  CDS  NC_007434  4125511  4125636  126  IS407A, transposase OrfA  YP_335159  unclonable  4.80288e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A1239  CDS  NC_007435  1551217  1551507  291  H-NS histone family protein  YP_336396  unclonable  9.58752e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A1497  CDS  NC_007435  1829947  1830504  558  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  YP_336654  unclonable  2.55815e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A1498  CDS  NC_007435  1830739  1830891  153  hypothetical protein  YP_336655  unclonable  9.98036e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A1499  CDS  NC_007435  1830868  1831473  606  RNA polymerase sigma factor  YP_336656  unclonable  2.88475e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A1570  CDS  NC_007435  1906550  1907071  522  H-NS histone family protein  YP_336727  unclonable  1.03893e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A1571  CDS  NC_007435  1906848  1908752  1905  alpha-ketoglutarate permease  YP_336728  unclonable  1.93325e-09  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A2199  CDS  NC_007435  2688840  2689103  264  hypothetical protein  YP_337350  unclonable  4.43154e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A2200  CDS  NC_007435  2689339  2689581  243  putative terpene cyclase  YP_337351  unclonable  3.77513e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A2201  CDS  NC_007435  2689581  2690390  810  putative terpene cyclase  YP_337352  unclonable  1.44579e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A2202  CDS  NC_007435  2690419  2690658  240  hypothetical protein  YP_337353  unclonable  4.61312e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A2203  CDS  NC_007435  2690728  2691204  477  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  YP_337354  unclonable  8.08361e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A2204  CDS  NC_007435  2691497  2692156  660  glutathione S-transferase-like protein  YP_337355  unclonable  9.39621e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A2205  CDS  NC_007435  2692197  2692907  711  hypothetical protein  YP_337356  unclonable  2.09346e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_A2206  CDS  NC_007435  2692957  2693253  297  hypothetical protein  YP_337357  unclonable  8.16613e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>