30 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Plut_0136  CDS  NC_007512  147927  148466  540  hypothetical protein  YP_374069  unclonable  3.3624e-11  normal  0.854848  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0137  CDS  NC_007512  148884  149324  441  hypothetical protein  YP_374070  unclonable  2.09855e-11  normal  0.366242  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0175  CDS  NC_007512  183276  183665  390  30S ribosomal protein S12  YP_374108  unclonable  1.8595e-11  normal  0.463989  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0176  CDS  NC_007512  183700  184167  468  30S ribosomal protein S7  YP_374109  unclonable  1.8595e-11  normal  0.461741  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0177  CDS  NC_007512  184210  186324  2115  elongation factor G  YP_374110  unclonable  2.63654e-07  normal  0.56693  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0265  CDS  NC_007512  270991  271233  243  chlorosome envelope protein A  YP_374196  unclonable  1.05111e-11  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0301  CDS  NC_007512  306600  307379  780  hypothetical protein  YP_374232  hitchhiker  7.14292e-09  unclonable  7.38191e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0302  CDS  NC_007512  307476  308063  588  outer surface protein, putative  YP_374233  unclonable  9.82114e-11  unclonable  6.60987e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0303  CDS  NC_007512  308123  308608  486  hypothetical protein  YP_374234  hitchhiker  1.4956e-05  unclonable  6.28456e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0304  CDS  NC_007512  308726  309844  1119  glycosyl transferase  YP_374235  normal  0.0175476  unclonable  7.45959e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0305  CDS  NC_007512  309968  312871  2904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_374236  normal  unclonable  1.33293e-06  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0335  CDS  NC_007512  345144  345887  744  hypothetical protein  YP_374266  unclonable  1.59017e-10  normal  0.161063  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0489  CDS  NC_007512  571386  572480  1095  hypothetical protein  YP_374420  unclonable  9.75804e-10  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0490  CDS  NC_007512  572732  573238  507  NUDIX/MutT family protein  YP_374421  unclonable  2.25283e-11  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0536  CDS  NC_007512  626676  629318  2643  hypothetical protein  YP_374463  unclonable  4.22486e-06  normal  0.794266  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0542  CDS  NC_007512  634475  636118  1644  chaperonin GroEL  YP_374469  unclonable  2.0634e-08  normal  0.698451  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0561  CDS  NC_007512  656931  658205  1275  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  YP_374487  unclonable  1.87541e-09  normal  0.129733  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0676  CDS  NC_007512  781424  795409  13986  VCBS  YP_374597  normal  unclonable  0.000119465  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0710  CDS  NC_007512  824903  826240  1338  Outer membrane protein-like  YP_374631  unclonable  5.72058e-09  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_0946  CDS  NC_007512  1068238  1069425  1188  NADH-dependent butanol dehydrogenase  YP_374851  unclonable  1.48725e-09  normal  0.466249  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_1118  CDS  NC_007512  1272096  1272293  198  hypothetical protein  YP_375023  unclonable  3.56616e-12  normal  0.666231  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_1207  CDS  NC_007512  1366218  1366640  423  sigma-24 (FecI-like)  YP_375112  unclonable  2.22936e-11  normal  0.681645  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_1208  CDS  NC_007512  1366804  1367823  1020  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  YP_375113  unclonable  7.15023e-10  normal  0.460788  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_1442  CDS  NC_007512  1624903  1626168  1266  hypothetical protein  YP_375344  unclonable  4.0293e-09  normal  0.558429  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_1718  CDS  NC_007512  1924273  1925562  1290  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  YP_375615  unclonable  2.82994e-09  normal  0.360992  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_1758  CDS  NC_007512  1968437  1969039  603  Holliday junction DNA helicase RuvA  YP_375655  unclonable  5.83338e-11  normal  0.326714  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_1976  CDS  NC_007512  2200095  2202299  2205  photosystem P840 reaction center, large subunit  YP_375861  unclonable  3.29009e-07  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_2133  CDS  NC_007512  2363373  2364842  1470  chromosomal replication initiation protein  YP_376018  unclonable  8.45727e-09  normal  0.662665  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_R0009  tRNA  NC_007512  826324  826396  73  tRNA-Pro    unclonable  6.18395e-12  normal  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Plut_R0047  tRNA  NC_007512  148563  148637  75  tRNA-Asn    unclonable  2.51185e-12  normal  0.812325  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>