13 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Pden_0111  CDS  NC_008686  102697  103602  906  hypothetical protein  YP_913924  unclonable  2.53104e-11  decreased coverage  0.00222502  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_1825  CDS  NC_008686  1822871  1823380  510  CarD family transcriptional regulator  YP_915618  unclonable  4.95809e-12  normal  0.361852  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_2052  CDS  NC_008686  2060592  2060891  300  hypothetical protein  YP_915840  hitchhiker  0.00391376  unclonable  1.8842e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_2053  CDS  NC_008686  2060891  2061109  219  hypothetical protein  YP_915841  hitchhiker  0.00283188  unclonable  1.8842e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_2054  CDS  NC_008686  2061405  2062328  924  hypothetical protein  YP_915842  decreased coverage  1.3578e-07  unclonable  2.42077e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_2055  CDS  NC_008686  2063243  2063758  516  hypothetical protein  YP_915843  normal  0.0592426  unclonable  2.37237e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_2056  CDS  NC_008686  2063766  2065175  1410  hypothetical protein  YP_915844  normal  0.0826059  unclonable  2.78509e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_3266  CDS  NC_008687  430569  431600  1032  hypothetical protein  YP_917040  normal  unclonable  3.01763e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_3267  CDS  NC_008687  431624  432613  990  amidohydrolase 2  YP_917041  normal  unclonable  3.14139e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_3268  CDS  NC_008687  432650  434680  2031  hypothetical protein  YP_917042  normal  unclonable  4.11591e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_3772  CDS  NC_008687  910818  911285  468  hypothetical protein  YP_917534  hitchhiker  1.30829e-06  unclonable  1.52701e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_3773  CDS  NC_008687  911496  911693  198  hypothetical protein  YP_917535  hitchhiker  1.61337e-08  unclonable  1.32701e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Pden_3774  CDS  NC_008687  911697  911996  300  Arc domain-containing protein  YP_917536  hitchhiker  3.31674e-09  unclonable  1.39531e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>