48 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Tcr_0001  CDS  NC_007520  1404  1404  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_390272  unclonable  9.849e-13  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0002  CDS  NC_007520  1580  2686  1107  DNA polymerase III, beta subunit  YP_390273  unclonable  1.01704e-13  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0003  CDS  NC_007520  2785  3873  1089  DNA replication and repair protein RecF  YP_390274  unclonable  1.76519e-13  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0004  CDS  NC_007520  3978  4649  672  two component transcriptional regulator  YP_390275  unclonable  1.17037e-14  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0013  CDS  NC_007520  16506  17447  942  phosphoribulokinase  YP_390284  unclonable  4.50397e-14  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0045  CDS  NC_007520  55621  56889  1269  hypothetical protein  YP_390316  unclonable  2.24806e-13  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0105  CDS  NC_007520  131416  136209  4794  VCBS  YP_390375  unclonable  0.00289742  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0270  CDS  NC_007520  318361  318738  378  hypothetical protein  YP_390540  unclonable  3.57996e-16  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
 
Tcr_0271  CDS  NC_007520  318752  319765  1014  hypothetical protein  YP_390541  unclonable  3.57372e-14  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0281  CDS  NC_007520  328853  330043  1191  elongation factor Tu  YP_390551  unclonable  4.67767e-13  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0342  CDS  NC_007520  390817  391074  258  50S ribosomal protein L27  YP_390612  unclonable  8.5444e-17  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0343  CDS  NC_007520  391231  392271  1041  GTPase ObgE  YP_390613  unclonable  5.91605e-14  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0344  CDS  NC_007520  392281  393411  1131  gamma-glutamyl kinase  YP_390614  unclonable  1.1704e-13  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0345  CDS  NC_007520  393619  393909  291  chaperonin Cpn10  YP_390615  unclonable  2.95654e-16  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0392  CDS  NC_007520  443058  444023  966  ribose-phosphate pyrophosphokinase  YP_390662  unclonable  1.91393e-13  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0464  CDS  NC_007520  521125  522162  1038  porin  YP_390734  unclonable  9.37994e-14  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0485  CDS  NC_007520  542611  542973  363  Iojap-related protein  YP_390755  unclonable  3.40385e-16  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0514  CDS  NC_007520  579174  579506  333  hypothetical protein  YP_390784  unclonable  3.95823e-16  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0528  CDS  NC_007520  590900  591502  603  hypothetical protein  YP_390798  unclonable  4.1727e-15  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0529  CDS  NC_007520  592220  594310  2091  DNA-directed DNA polymerase  YP_390799  unclonable  3.24921e-10  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0587  CDS  NC_007520  661576  662829  1254  cell division protein FtsA  YP_390857  unclonable  2.83199e-13  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0712  CDS  NC_007520  781073  781813  741  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  YP_390982  unclonable  3.08432e-15  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0798  CDS  NC_007520  871125  872075  951  peptidase M23B  YP_391068  unclonable  3.46497e-14  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0912  CDS  NC_007520  989302  989640  339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  YP_391182  unclonable  4.42242e-16  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_0936  CDS  NC_007520  1012457  1012810  354  hypothetical protein  YP_391206  unclonable  3.9998e-16  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_1010  CDS  NC_007520  1089640  1090245  606  flavoprotein WrbA  YP_391279  unclonable  2.9905e-15  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_1180  CDS  NC_007520  1288095  1288367  273  histone-like DNA-binding protein  YP_391449  unclonable  2.95654e-16  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_1209  CDS  NC_007520  1321005  1322573  1569  exodeoxyribonuclease VII large subunit  YP_391478  unclonable  6.50219e-12  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_1228  CDS  NC_007520  1345752  1346705  954  pseudouridine synthase, Rsu  YP_391497  unclonable  3.79641e-14  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_1251  CDS  NC_007520  1366820  1368136  1317  homoserine dehydrogenase  YP_391520  unclonable  4.53737e-13  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_1282  CDS  NC_007520  1397901  1398458  558  ribosome recycling factor  YP_391551  unclonable  3.66075e-15  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_1495  CDS  NC_007520  1619118  1620131  1014  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  YP_391761  unclonable  6.16027e-14  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_1567  CDS  NC_007520  1716680  1717177  498  hypothetical protein  YP_391833  unclonable  7.98155e-16  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_2004  CDS  NC_007520  2207050  2208825  1776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  YP_392268  unclonable  1.69064e-11  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_2052  CDS  NC_007520  2266197  2267018  822  exonuclease III  YP_392316  unclonable  1.69666e-14  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_2053  CDS  NC_007520  2267051  2267740  690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  YP_392317  unclonable  7.683e-15  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_2054  CDS  NC_007520  2267760  2268359  600  Ham1-like protein  YP_392318  unclonable  4.04757e-15  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_2055  CDS  NC_007520  2268512  2269375  864  hypothetical protein  YP_392319  unclonable  3.29302e-14  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_2060  CDS  NC_007520  2274838  2276316  1479  magnesium transporter  YP_392324  unclonable  4.17993e-12  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_2061  CDS  NC_007520  2276533  2277438  906  S6 modification enzyme RimK  YP_392325  unclonable  5.79629e-14  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_2171  CDS  NC_007520  2392635  2393447  813  F0F1 ATP synthase subunit A  YP_392433  unclonable  8.16174e-15  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_2172  CDS  NC_007520  2393459  2393809  351  hypothetical protein  YP_392434  unclonable  1.90327e-16  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_2173  CDS  NC_007520  2393811  2394113  303  hypothetical protein  YP_392435  unclonable  1.6539e-16  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_2174  CDS  NC_007520  2394347  2395216  870  parB-like partition proteins  YP_392436  unclonable  1.45902e-14  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_2175  CDS  NC_007520  2395229  2395996  768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_392437  unclonable  2.90082e-15  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_R0008  misc_RNA  NC_007520  591784  591898  115  SRP RNA; RNA component of signal recognitionparticle    unclonable  7.72786e-17  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_R0018  tRNA  NC_007520  980488  980563  76  tRNA-Lys    unclonable  3.50415e-17  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Tcr_R0019  tRNA  NC_007520  980611  980686  76  tRNA-Lys    unclonable  3.61246e-17  n/a    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>