226 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Haur_0001  CDS  NC_009972  77  1495  1419  chromosomal replication initiation protein  YP_001542781  unclonable  3.68077e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0002  CDS  NC_009972  1544  3412  1869  hypothetical protein  YP_001542782  unclonable  2.85538e-05  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0007  CDS  NC_009972  8321  9760  1440  hypothetical protein  YP_001542787  unclonable  4.46047e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0037  CDS  NC_009972  45672  47507  1836  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  YP_001542817  unclonable  2.2588e-05  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0097  CDS  NC_009972  125245  126696  1452  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, B subunit  YP_001542877  unclonable  4.07261e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0098  CDS  NC_009972  126764  127735  972  hypothetical protein  YP_001542878  unclonable  7.01903e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0140  CDS  NC_009972  173699  174223  525  50S ribosomal protein L10  YP_001542920  unclonable  2.36563e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0141  CDS  NC_009972  174309  174701  393  ribosomal protein L7/L12  YP_001542921  unclonable  1.37208e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0154  CDS  NC_009972  184887  185924  1038  histone deacetylase superfamily protein  YP_001542934  unclonable  3.91208e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0174  CDS  NC_009972  203292  204662  1371  cyclic nucleotide-binding protein  YP_001542954  unclonable  2.71627e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0175  CDS  NC_009972  204764  206662  1899  hypothetical protein  YP_001542955  unclonable  5.46306e-05  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0176  CDS  NC_009972  206700  206987  288  hypothetical protein  YP_001542956  unclonable  7.13475e-08  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0177  CDS  NC_009972  207253  207987  735  undecaprenyl diphosphate synthase  YP_001542957  unclonable  3.36524e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0199  CDS  NC_009972  233910  234407  498  DinB family protein  YP_001542979  unclonable  2.48832e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0200  CDS  NC_009972  234770  235246  477  hypothetical protein  YP_001542980  unclonable  2.16161e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0201  CDS  NC_009972  235861  237018  1158  IS605 family transposase OrfB  YP_001542981  unclonable  1.94492e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0217  CDS  NC_009972  250618  251691  1074  adenylate/guanylate cyclase  YP_001542997  unclonable  6.94787e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0226  CDS  NC_009972  262123  262479  357  50S ribosomal protein L19  YP_001543006  unclonable  8.54826e-08  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0289  CDS  NC_009972  340088  342199  2112  small GTP-binding protein  YP_001543069  unclonable  5.74662e-05  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0290  CDS  NC_009972  342409  342630  222  ribosomal protein S20  YP_001543070  unclonable  4.31613e-08  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0313  CDS  NC_009972  372512  374392  1881  chaperone protein DnaK  YP_001543093  unclonable  2.65757e-05  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0342  CDS  NC_009972  408456  409067  612  deoxynucleoside kinase-like  YP_001543122  unclonable  1.04487e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0343  CDS  NC_009972  409107  411299  2193  proprotein convertase P  YP_001543123  unclonable  5.57566e-05  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0347  CDS  NC_009972  418341  419447  1107  2-alkenal reductase  YP_001543126  unclonable  1.81204e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0437  CDS  NC_009972  509661  512714  3054  peptidase M4 thermolysin  YP_001543216  unclonable  0.00224619  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0442  CDS  NC_009972  518317  518709  393  hypothetical protein  YP_001543221  unclonable  6.19685e-08  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0445  CDS  NC_009972  522543  523175  633  HAD family hydrolase  YP_001543224  unclonable  1.6642e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0470  CDS  NC_009972  549987  551285  1299  hypothetical protein  YP_001543249  unclonable  2.00568e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0471  CDS  NC_009972  551367  551957  591  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001543250  unclonable  1.61349e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0472  CDS  NC_009972  552040  552270  231  hypothetical protein  YP_001543251  unclonable  5.06787e-08  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0489  CDS  NC_009972  568929  571535  2607  lysyl endopeptidase  YP_001543268  unclonable  0.000398143  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0498  CDS  NC_009972  578865  579575  711  dTMP kinase  YP_001543277  unclonable  1.63063e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0499  CDS  NC_009972  579618  581315  1698  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  YP_001543278  unclonable  8.61102e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0588  CDS  NC_009972  678026  678808  783  hypothetical protein  YP_001543364  unclonable  2.61739e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0638  CDS  NC_009972  735840  736532  693  hypothetical protein  YP_001543414  unclonable  1.58125e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0646  CDS  NC_009972  744697  746262  1566  hypothetical protein  YP_001543422  unclonable  7.86066e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0701  CDS  NC_009972  806248  807750  1503  serine/threonine kinase protein  YP_001543477  unclonable  4.1573e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0717  CDS  NC_009972  823087  825672  2586  serine/threonine protein kinase  YP_001543493  unclonable  0.000196708  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0749  CDS  NC_009972  853715  855082  1368  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  YP_001543525  unclonable  6.29358e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0787  CDS  NC_009972  886965  889151  2187  pseudouridine synthase  YP_001543563  unclonable  9.26536e-05  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0816  CDS  NC_009972  924392  924958  567  hypothetical protein  YP_001543592  unclonable  1.61349e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0850  CDS  NC_009972  959741  960688  948  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_001543626  unclonable  7.45875e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0855  CDS  NC_009972  967459  968565  1107  fatty acid/phospholipid synthesis protein PlsX  YP_001543631  unclonable  1.24756e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0863  CDS  NC_009972  976275  978704  2430  peptidase M23B  YP_001543639  unclonable  0.000213309  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0899  CDS  NC_009972  1030185  1031684  1500  serine/threonine protein kinase  YP_001543675  unclonable  8.18625e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0938  CDS  NC_009972  1073141  1074901  1761  hypothetical protein  YP_001543714  unclonable  9.15423e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0954  CDS  NC_009972  1094068  1094538  471  hypothetical protein  YP_001543730  unclonable  1.09947e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0990  CDS  NC_009972  1134878  1136338  1461  serine/threonine protein kinase  YP_001543766  unclonable  4.07261e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0999  CDS  NC_009972  1142940  1143614  675  cell wall anchor domain-containing protein  YP_001543775  unclonable  3.53845e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1047  CDS  NC_009972  1194894  1196210  1317  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  YP_001543823  unclonable  3.12807e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1082  CDS  NC_009972  1238833  1239141  309  hypothetical protein  YP_001543858  unclonable  5.27568e-08  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1101  CDS  NC_009972  1261589  1262593  1005  homoserine dehydrogenase  YP_001543877  unclonable  8.77297e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1139  CDS  NC_009972  1302340  1303527  1188  major facilitator transporter  YP_001543915  unclonable  1.65449e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1140  CDS  NC_009972  1303658  1304479  822  rare lipoprotein A  YP_001543916  unclonable  2.89484e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1191  CDS  NC_009972  1369675  1371558  1884  amino acid permease-associated region  YP_001543967  unclonable  3.00657e-05  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1192  CDS  NC_009972  1371697  1373736  2040  hypothetical protein  YP_001543968  unclonable  4.50505e-05  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1357  CDS  NC_009972  1571165  1571467  303  hypothetical protein  YP_001544130  unclonable  5.38326e-08  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1358  CDS  NC_009972  1571768  1572706  939  hypothetical protein  YP_001544131  unclonable  7.53514e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1390  CDS  NC_009972  1604613  1604963  351  hypothetical protein  YP_001544163  unclonable  1.05557e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1432  CDS  NC_009972  1659600  1660535  936  hypothetical protein  YP_001544204  unclonable  7.84864e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1454  CDS  NC_009972  1692575  1693954  1380  hypothetical protein  YP_001544226  unclonable  9.63301e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1455  CDS  NC_009972  1694190  1695449  1260  cysteine desulfurase family protein  YP_001544227  unclonable  3.06553e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1456  CDS  NC_009972  1695525  1696250  726  glycosyl transferase family protein  YP_001544228  unclonable  4.11499e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1462  CDS  NC_009972  1704971  1706143  1173  monooxygenase FAD-binding  YP_001544234  unclonable  1.589e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1494  CDS  NC_009972  1743105  1743659  555  hypothetical protein  YP_001544266  unclonable  1.42862e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1502  CDS  NC_009972  1750568  1752253  1686  adenylate/guanylate cyclase  YP_001544274  unclonable  7.70351e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1515  CDS  NC_009972  1766952  1768712  1761  hypothetical protein  YP_001544287  unclonable  1.61589e-05  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1626  CDS  NC_009972  1884988  1886508  1521  glycoside hydrolase family protein  YP_001544397  unclonable  1.0667e-05  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1651  CDS  NC_009972  1918183  1919148  966  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  YP_001544422  unclonable  1.37982e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1676  CDS  NC_009972  1942562  1943029  468  transcription elongation factor GreA  YP_001544447  unclonable  1.27836e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1712  CDS  NC_009972  1992230  1992766  537  inorganic diphosphatase  YP_001544483  unclonable  2.78082e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1752  CDS  NC_009972  2038634  2040031  1398  hypothetical protein  YP_001544523  unclonable  2.33386e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1813  CDS  NC_009972  2106410  2108857  2448  ankyrin repeat-containing protein  YP_001544584  unclonable  0.000177587  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1814  CDS  NC_009972  2109001  2110665  1665  FG-GAP repeat-containing protein  YP_001544585  unclonable  1.22942e-05  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1817  CDS  NC_009972  2113344  2115137  1794  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  YP_001544588  unclonable  2.37555e-05  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1818  CDS  NC_009972  2115342  2116775  1434  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  YP_001544589  unclonable  5.35261e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1911  CDS  NC_009972  2305139  2305708  570  rhodanese domain-containing protein  YP_001544682  unclonable  1.93462e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1933  CDS  NC_009972  2342291  2342710  420  hypothetical protein  YP_001544704  unclonable  1.61349e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1934  CDS  NC_009972  2343020  2344264  1245  transposase IS4 family protein  YP_001544705  unclonable  3.87173e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_1935  CDS  NC_009972  2344483  2345148  666  peptidase S51 dipeptidase E  YP_001544706  unclonable  4.28456e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2113  CDS  NC_009972  2653451  2654392  942  CRP/FNR family transcriptional regulator  YP_001544881  unclonable  5.56838e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2153  CDS  NC_009972  2711482  2712441  960  peptidoglycan binding domain-containing protein  YP_001544921  unclonable  7.38312e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2174  CDS  NC_009972  2754472  2755365  894  hypothetical protein  YP_001544942  unclonable  6.09974e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2175  CDS  NC_009972  2755548  2756843  1296  chitinase  YP_001544943  unclonable  2.88646e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2192  CDS  NC_009972  2776447  2778759  2313  hypothetical protein  YP_001544960  unclonable  0.000184948  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2197  CDS  NC_009972  2788317  2790902  2586  lipid transport protein  YP_001544965  unclonable  0.000284103  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2240  CDS  NC_009972  2856893  2857792  900  PhzF family phenazine biosynthesis protein  YP_001545008  unclonable  5.08525e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2270  CDS  NC_009972  2903915  2906161  2247  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  YP_001545038  unclonable  0.000172268  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2299  CDS  NC_009972  2939849  2940124  276  iojap-like protein  YP_001545067  unclonable  5.54928e-08  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2300  CDS  NC_009972  2940421  2941014  594  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001545068  unclonable  1.53423e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2339  CDS  NC_009972  2986817  2987983  1167  monooxygenase FAD-binding  YP_001545107  unclonable  1.67175e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2344  CDS  NC_009972  2991499  2991924  426  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  YP_001545112  unclonable  8.89878e-08  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2345  CDS  NC_009972  2992099  2993079  981  polyprenyl synthetase  YP_001545113  unclonable  5.29379e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2364  CDS  NC_009972  3011643  3012374  732  hypothetical protein  YP_001545132  unclonable  3.23268e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2365  CDS  NC_009972  3012903  3013769  867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001545133  unclonable  7.84864e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2402  CDS  NC_009972  3061064  3061732  669  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  YP_001545170  unclonable  1.42862e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2403  CDS  NC_009972  3061786  3063765  1980  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  YP_001545171  unclonable  4.36928e-05  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2404  CDS  NC_009972  3063964  3064566  603  hypothetical protein  YP_001545172  unclonable  2.1397e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2405  CDS  NC_009972  3064638  3066443  1806  hypothetical protein  YP_001545173  unclonable  1.40285e-05  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_2422  CDS  NC_009972  3105018  3106442  1425  Beta-glucosidase  YP_001545190  unclonable  2.77167e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>