13 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
RPC_1235  CDS  NC_007925  1352093  1353304  1212  NnrS  YP_531117  hitchhiker  0.00575591  unclonable  3.01222e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_1236  CDS  NC_007925  1353328  1353585  258  hypothetical protein  YP_531118  hitchhiker  0.000489654  unclonable  1.65083e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_1237    NC_007925  1353574  1353798  225      hitchhiker  0.000103856  unclonable  1.63408e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_1238  CDS  NC_007925  1354751  1354906  156  antenna complex, alpha/beta subunit  YP_531119  decreased coverage  5.3381e-08  unclonable  1.60108e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_1239  CDS  NC_007925  1354919  1355098  180  antenna complex, alpha/beta subunit  YP_531120  hitchhiker  6.66416e-07  unclonable  1.60108e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_1240  CDS  NC_007925  1355294  1356748  1455  PUCC protein  YP_531121  hitchhiker  0.000359132  unclonable  2.83623e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_1241  CDS  NC_007925  1356745  1357401  657  hypothetical protein  YP_531122  hitchhiker  0.00985067  unclonable  2.32118e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_1242  CDS  NC_007925  1357411  1357680  270  hypothetical protein  YP_531123  normal  0.0176057  unclonable  1.75361e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_1243  CDS  NC_007925  1358012  1358461  450  hypothetical protein  YP_531124  hitchhiker  0.00583677  unclonable  1.65083e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_1244  CDS  NC_007925  1358691  1359149  459  hypothetical protein  YP_531125  normal  0.0835823  unclonable  1.77159e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_1245  CDS  NC_007925  1359263  1360492  1230  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  YP_531126  normal  0.491733  unclonable  2.41639e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_1554  CDS  NC_007925  1685954  1686793  840  hypothetical protein  YP_531435  unclonable  6.76039e-08  normal  0.0395238  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
RPC_R0027  tRNA  NC_007925  1685576  1685651  76  tRNA-OTHER    unclonable  1.77405e-09  normal  0.0351044  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>