175 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bcer98_0001  CDS  NC_009674  521  1861  1341  chromosomal replication initiation protein  YP_001373372  unclonable  3.25337e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0013    NC_009674  22027  22554  528      unclonable  1.61769e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0088  CDS  NC_009674  109315  109977  663  RNA polymerase factor sigma-70  YP_001373458  unclonable  9.37894e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0089  CDS  NC_009674  110272  110451  180  preprotein translocase subunit SecE  YP_001373459  unclonable  1.39585e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0090  CDS  NC_009674  110572  111105  534  transcription antitermination protein NusG  YP_001373460  unclonable  9.96375e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0091  CDS  NC_009674  111275  111700  426  50S ribosomal protein L11  YP_001373461  unclonable  5.90069e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0092  CDS  NC_009674  111883  112575  693  50S ribosomal protein L1  YP_001373462  unclonable  1.71982e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0093  CDS  NC_009674  112808  113308  501  50S ribosomal protein L10  YP_001373463  unclonable  7.59135e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0094  CDS  NC_009674  113376  113735  360  50S ribosomal protein L7/L12  YP_001373464  unclonable  3.7425e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0098  CDS  NC_009674  121999  122247  249  hypothetical protein  YP_001373467  unclonable  3.38227e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0099  CDS  NC_009674  122362  122784  423  30S ribosomal protein S12  YP_001373468  unclonable  8.14574e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0100  CDS  NC_009674  122814  123284  471  30S ribosomal protein S7  YP_001373469  unclonable  9.00899e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0101  CDS  NC_009674  123494  125572  2079  elongation factor G  YP_001373470  unclonable  5.83321e-06  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0102  CDS  NC_009674  125691  126878  1188  elongation factor Tu  YP_001373471  unclonable  1.29876e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0103  CDS  NC_009674  127269  127577  309  30S ribosomal protein S10  YP_001373472  unclonable  3.02631e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0104  CDS  NC_009674  127612  128244  633  50S ribosomal protein L3  YP_001373473  unclonable  1.19433e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0105  CDS  NC_009674  128270  128893  624  50S ribosomal protein L4  YP_001373474  unclonable  1.04823e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0106  CDS  NC_009674  128893  129183  291  50S ribosomal protein L23  YP_001373475  unclonable  2.44838e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0107  CDS  NC_009674  129212  130042  831  50S ribosomal protein L2  YP_001373476  unclonable  2.04251e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0108  CDS  NC_009674  130103  130381  279  30S ribosomal protein S19  YP_001373477  unclonable  2.57453e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0109  CDS  NC_009674  130399  130740  342  50S ribosomal protein L22  YP_001373478  unclonable  3.70436e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0110  CDS  NC_009674  130744  131403  660  30S ribosomal protein S3  YP_001373479  unclonable  1.33483e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0111  CDS  NC_009674  131405  131839  435  50S ribosomal protein L16  YP_001373480  unclonable  5.78104e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0112  CDS  NC_009674  131829  132029  201  50S ribosomal protein L29  YP_001373481  unclonable  2.25905e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0113  CDS  NC_009674  132050  132313  264  30S ribosomal protein S17  YP_001373482  unclonable  3.89804e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0114  CDS  NC_009674  132357  132725  369  50S ribosomal protein L14  YP_001373483  unclonable  6.39835e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0115  CDS  NC_009674  132764  133075  312  50S ribosomal protein L24  YP_001373484  unclonable  5.84056e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0116  CDS  NC_009674  133102  133641  540  50S ribosomal protein L5  YP_001373485  unclonable  1.21875e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0125  CDS  NC_009674  137806  138456  651  adenylate kinase  YP_001373494  unclonable  1.66818e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0126  CDS  NC_009674  138456  139202  747  methionine aminopeptidase  YP_001373495  unclonable  3.27766e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0127  CDS  NC_009674  139271  139489  219  translation initiation factor IF-1  YP_001373496  unclonable  4.31634e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0128  CDS  NC_009674  139525  139638  114  50S ribosomal protein L36  YP_001373497  unclonable  2.90625e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0129  CDS  NC_009674  139660  140025  366  30S ribosomal protein S13  YP_001373498  unclonable  8.2296e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0130  CDS  NC_009674  140050  140439  390  30S ribosomal protein S11  YP_001373499  unclonable  1.00663e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0131  CDS  NC_009674  140620  141564  945  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  YP_001373500  unclonable  9.50428e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0132  CDS  NC_009674  141600  141962  363  50S ribosomal protein L17  YP_001373501  unclonable  8.31433e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0133  CDS  NC_009674  142071  142913  843  cobalt transporter ATP-binding subunit  YP_001373502  unclonable  4.21792e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0134  CDS  NC_009674  142889  143770  882  cobalt transporter ATP-binding subunit  YP_001373503  unclonable  4.30525e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0135  CDS  NC_009674  143758  144552  795  cobalt transport protein  YP_001373504  unclonable  2.81903e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0136  CDS  NC_009674  144567  145310  744  tRNA pseudouridine synthase A  YP_001373505  unclonable  2.96429e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0137  CDS  NC_009674  145466  145903  438  50S ribosomal protein L13  YP_001373506  unclonable  7.51399e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0138  CDS  NC_009674  145925  146317  393  30S ribosomal protein S9  YP_001373507  unclonable  5.90069e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0254  CDS  NC_009674  273250  274575  1326  xanthine/uracil/vitamin C permease  YP_001373615  unclonable  3.90188e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0330  CDS  NC_009674  376778  377695  918  periplasmic binding protein  YP_001373686  unclonable  1.56949e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0379  CDS  NC_009674  436440  437723  1284  major facilitator transporter  YP_001373731  unclonable  5.50837e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0426  CDS  NC_009674  479213  480142  930  glutaminase  YP_001373776  unclonable  6.93628e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0466  CDS  NC_009674  527437  528258  822  glycosyl transferase family protein  YP_001373816  unclonable  3.21197e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0484  CDS  NC_009674  544553  546313  1761  S-layer domain-containing protein  YP_001373834  unclonable  1.24996e-06  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0485  CDS  NC_009674  546601  548151  1551  choline/carnitine/betaine transporter  YP_001373835  unclonable  5.02789e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0556  CDS  NC_009674  635601  636950  1350  glycerol-3-phosphate transporter  YP_001373900  unclonable  3.67094e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0557  CDS  NC_009674  637216  637674  459  MarR family transcriptional regulator  YP_001373901  unclonable  1.49259e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0558  CDS  NC_009674  637694  639310  1617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_001373902  unclonable  2.22683e-06  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0559  CDS  NC_009674  639447  640418  972  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  YP_001373903  unclonable  1.1059e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0560  CDS  NC_009674  640432  641328  897  ribokinase  YP_001373904  unclonable  6.79387e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0567  CDS  NC_009674  648117  648968  852  phospholipase C  YP_001373911  unclonable  1.96147e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0631  CDS  NC_009674  722152  723453  1302  xanthine/uracil/vitamin C permease  YP_001373973  unclonable  1.26006e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0724  CDS  NC_009674  831350  832933  1584  cell wall hydrolase/autolysin  YP_001374064  unclonable  3.86208e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0753  CDS  NC_009674  861887  863512  1626  hypothetical protein  YP_001374090  unclonable  1.49955e-06  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0806  CDS  NC_009674  921843  922664  822  MIP family channel protein  YP_001374139  unclonable  1.86398e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0807  CDS  NC_009674  922678  924168  1491  glycerol kinase  YP_001374140  unclonable  3.15642e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0873  CDS  NC_009674  990814  991770  957  ferrochelatase  YP_001374203  unclonable  3.48204e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0949  CDS  NC_009674  1063276  1064742  1467  sodium/proline symporter  YP_001374276  unclonable  4.19009e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0982  CDS  NC_009674  1101199  1101456  258  extracellular protein  YP_001374306  unclonable  1.74017e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1120  CDS  NC_009674  1232165  1233865  1701  acetolactate synthase catalytic subunit  YP_001374441  unclonable  1.46949e-06  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1152  CDS  NC_009674  1262995  1264239  1245  peptidase M23B  YP_001374472  unclonable  2.91008e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1181  CDS  NC_009674  1294455  1294886  432  hypothetical protein  YP_001374498  unclonable  1.21875e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1203  CDS  NC_009674  1317880  1318494  615  peptidase M23B  YP_001374520  unclonable  1.941e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1204  CDS  NC_009674  1318525  1319208  684  hypothetical protein  YP_001374521  unclonable  4.01025e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1205  CDS  NC_009674  1319754  1320332  579  hypothetical protein  YP_001374522  unclonable  2.16988e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1206  CDS  NC_009674  1320530  1320778  249  ferredoxin  YP_001374523  unclonable  6.27013e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1209  CDS  NC_009674  1323724  1324290  567  abortive infection protein  YP_001374526  unclonable  1.61769e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1210  CDS  NC_009674  1324313  1324795  483  peptidoglycan-binding LysM  YP_001374527  unclonable  1.46268e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1214  CDS  NC_009674  1327665  1328948  1284  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  YP_001374531  unclonable  3.00096e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1215  CDS  NC_009674  1329266  1329499  234  hypothetical protein  YP_001374532  unclonable  5.2271e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1216  CDS  NC_009674  1329576  1330106  531  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_001374533  unclonable  1.34857e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1217  CDS  NC_009674  1330216  1331199  984  hypothetical protein  YP_001374534  unclonable  5.00941e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1218  CDS  NC_009674  1331226  1332200  975  L-asparaginase  YP_001374535  unclonable  4.85776e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1219  CDS  NC_009674  1332389  1332562  174  hypothetical protein  YP_001374536  unclonable  2.10481e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1220  CDS  NC_009674  1332693  1333370  678  cytidylate kinase  YP_001374537  unclonable  1.30808e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1221  CDS  NC_009674  1333694  1334842  1149  30S ribosomal protein S1  YP_001374538  unclonable  7.30459e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1323  CDS  NC_009674  1428669  1429157  489  hypothetical protein  YP_001374639  unclonable  1.37615e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1369  CDS  NC_009674  1468309  1469217  909  putative CheW protein  YP_001374685  unclonable  7.15462e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1370  CDS  NC_009674  1469695  1470642  948  hypothetical protein  YP_001374686  unclonable  4.90779e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1375  CDS  NC_009674  1477858  1478673  816  flagellin  YP_001374691  unclonable  3.44656e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1490  CDS  NC_009674  1598380  1599399  1020  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  YP_001374801  unclonable  5.60019e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1499  CDS  NC_009674  1608118  1609107  990  cell envelope-related transcriptional attenuator  YP_001374809  unclonable  1.86761e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1500  CDS  NC_009674  1609424  1610245  822  polysaccharide deacetylase  YP_001374810  unclonable  7.68102e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1509  CDS  NC_009674  1616260  1617420  1161  transglutaminase domain-containing protein  YP_001374817  unclonable  2.10837e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1599  CDS  NC_009674  1703778  1705448  1671  peptidase M4 thermolysin  YP_001374904  unclonable  9.90098e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1618  CDS  NC_009674  1720469  1720903  435  hypothetical protein  YP_001374922  unclonable  1.00663e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1641  CDS  NC_009674  1745785  1747770  1986  peptidoglycan glycosyltransferase  YP_001374945  unclonable  1.95033e-06  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1642  CDS  NC_009674  1748010  1748645  636  azoreductase  YP_001374946  unclonable  1.15875e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1643  CDS  NC_009674  1748757  1749482  726  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  YP_001374947  unclonable  2.54888e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1644  CDS  NC_009674  1749520  1750176  657  hemolysin III family channel protein  YP_001374948  unclonable  1.92122e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1645  CDS  NC_009674  1750386  1750562  177  twin arginine translocase protein A  YP_001374949  unclonable  2.68087e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_1774  CDS  NC_009674  1889482  1890882  1401  protoporphyrinogen oxidase  YP_001375068  unclonable  3.00096e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_2008  CDS  NC_009674  2107164  2107991  828  polysaccharide deacetylase  YP_001375276  unclonable  2.44714e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_2009  CDS  NC_009674  2108050  2109309  1260  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  YP_001375277  unclonable  1.39362e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_2010  CDS  NC_009674  2109389  2109658  270  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  YP_001375278  unclonable  3.12148e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_2011  CDS  NC_009674  2109671  2111776  2106  transcriptional antiterminator, BglG  YP_001375279  unclonable  5.95417e-06  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>