56 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
DhcVS_1008  CDS  NC_013552  943338  943937  600  hypothetical protein  YP_003330453  unclonable  3.37741e-13  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1009  CDS  NC_013552  944100  945236  1137  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003330454  unclonable  5.12645e-11  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1025  CDS  NC_013552  955970  956599  630  peptidylprolyl isomerase  YP_003330470  unclonable  3.66369e-13  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1043  CDS  NC_013552  969154  970374  1221  argininosuccinate synthase  YP_003330488  unclonable  1.73868e-10  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1068  CDS  NC_013552  994237  995421  1185  serine protease, DegP/HtrA family  YP_003330513  unclonable  1.37948e-10  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1078  CDS  NC_013552  1002493  1003035  543  DNA-binding response regulator  YP_003330523  unclonable  6.3084e-13  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1079  CDS  NC_013552  1003412  1004521  1110  hypothetical protein  YP_003330524  unclonable  1.22089e-10  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1138  CDS  NC_013552  1050047  1051663  1617  hypothetical protein  YP_003330580  unclonable  7.1313e-09  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1166  CDS  NC_013552  1075899  1077155  1257  tRNA I(6) A37 thitransferase miaB family  YP_003330607  unclonable  2.28736e-10  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1189  CDS  NC_013552  1099904  1101178  1275  transcription termination factor  YP_003330629  unclonable  1.72016e-10  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1228  CDS  NC_013552  1134960  1135571  612  membrane transporter, MarC family  YP_003330663  unclonable  4.52598e-13  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1304  CDS  NC_013552  1200659  1201375  717  hypothetical protein  YP_003330731  unclonable  9.71089e-13  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_131  CDS  NC_013552  131346  133379  2034  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase protein  YP_003329632  unclonable  1.74101e-07  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1390  CDS  NC_013552  1285616  1286140  525  hypothetical protein  YP_003330817  unclonable  2.65316e-13  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1464  CDS  NC_013552  1362791  1363795  1005  hypothetical protein  YP_003330889  unclonable  2.38574e-11  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1513  CDS  NC_013552  1404951  1405757  807  TPR repeat-containing protein  YP_003330937  unclonable  1.8853e-12  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1514  CDS  NC_013552  1405971  1406189  219  NifU domain protein  YP_003330938  unclonable  1.20627e-14  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_1515  CDS  NC_013552  1406247  1407464  1218  aspartate kinase, monofunctional class  YP_003330939  unclonable  1.10315e-10  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_172  CDS  NC_013552  169213  170898  1686  hypothetical protein  YP_003329671  unclonable  1.14775e-08  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_256  CDS  NC_013552  240106  243024  2919  UvrD/REP helicase  YP_003329746  unclonable  7.53871e-05  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_275  CDS  NC_013552  267712  269061  1350  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  YP_003329764  unclonable  4.78055e-10  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_276  CDS  NC_013552  269075  270580  1506  polymerase  YP_003329765  unclonable  4.57601e-09  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_283  CDS  NC_013552  276872  278098  1227  cell division protein FtsA  YP_003329772  unclonable  7.52805e-11  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_286  CDS  NC_013552  280260  282545  2286  ribonucleotide reductase  YP_003329775  unclonable  1.68014e-06  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_291  CDS  NC_013552  285831  287603  1773  hypothetical protein  YP_003329780  unclonable  2.23386e-08  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_292  CDS  NC_013552  287790  288152  363  hypothetical protein  YP_003329781  unclonable  2.20389e-14  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_308  CDS  NC_013552  298821  299954  1134  carboxyl-terminal protease  YP_003329795  unclonable  1.03744e-10  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_321  CDS  NC_013552  312780  313517  738  ribosomal protein S2  YP_003329808  unclonable  2.06427e-12  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_333  CDS  NC_013552  325106  326605  1500  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  YP_003329819  unclonable  2.28185e-09  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_334  CDS  NC_013552  326992  327744  753  hypothetical protein  YP_003329820  unclonable  2.60704e-12  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_335  CDS  NC_013552  327936  328286  351  hypothetical protein  YP_003329821  unclonable  5.06445e-14  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_336  CDS  NC_013552  328287  328715  429  nucleoside diphosphate kinase  YP_003329822  unclonable  5.06445e-14  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_362  CDS  NC_013552  348229  349011  783  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  YP_003329847  unclonable  7.33431e-13  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_41  CDS  NC_013552  35065  35673  609  SAM dependent methyltransferase, UbiE family  YP_003329546  unclonable  5.7615e-13  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_42  CDS  NC_013552  35684  35878  195  hypothetical protein  YP_003329547  unclonable  1.33403e-14  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_438  CDS  NC_013552  410924  411679  756  methionine aminopeptidase  YP_003329921  unclonable  2.26178e-12  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_440  CDS  NC_013552  411689  411910  222  translation initiation factor 1 (IF-1)  YP_003329922  unclonable  1.38941e-14  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_446  CDS  NC_013552  414935  415675  741  pseudouridylate synthase  YP_003329928  unclonable  3.32106e-12  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_47  CDS  NC_013552  38232  39491  1260  DNA polymerase III, delta subunit  YP_003329551  unclonable  2.02582e-10  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_490  CDS  NC_013552  457715  460294  2580  DNA repair ATPase  YP_003329972  unclonable  1.09294e-05  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_494  CDS  NC_013552  464839  467115  2277  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  YP_003329976  unclonable  9.5153e-07  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_495  CDS  NC_013552  467416  467985  570  hypothetical protein  YP_003329977  unclonable  1.00237e-13  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_496  CDS  NC_013552  468043  468276  234  hypothetical protein  YP_003329978  unclonable  5.69038e-15  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_506  CDS  NC_013552  475526  475753  228  hypothetical protein  YP_003329988  unclonable  2.51154e-14  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_507  CDS  NC_013552  475769  476017  249  ribosomal protein S16  YP_003329989  unclonable  3.94154e-14  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_508  CDS  NC_013552  476163  476834  672  nfi endonuclease V  YP_003329990  unclonable  2.19342e-12  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_529  CDS  NC_013552  494054  495232  1179  GTPase domain, tubulin/FtsZ  YP_003330010  unclonable  1.14898e-10  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_659  CDS  NC_013552  616171  617919  1749  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  YP_003330126  unclonable  3.28118e-08  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_673  CDS  NC_013552  629995  630225  231  ATPase C subunit  YP_003330138  unclonable  7.16672e-15  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_674  CDS  NC_013552  630294  630623  330  hypothetical protein  YP_003330139  unclonable  1.47632e-14  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_703  CDS  NC_013552  658431  659228  798  stationary-phase survival protein  YP_003330168  unclonable  1.77307e-12  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_704  CDS  NC_013552  659361  659915  555  hypothetical protein  YP_003330169  unclonable  2.62498e-13  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_849  CDS  NC_013552  790291  791589  1299  adenylosuccinate synthase  YP_003330305  unclonable  1.04861e-10  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_906  CDS  NC_013552  840339  841094  756  serine protease, DegP/HtrA family  YP_003330354  unclonable  4.53115e-12  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_908  CDS  NC_013552  842249  845293  3045  isoleucyl-tRNA synthetase  YP_003330356  unclonable  0.0001157  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
DhcVS_952  CDS  NC_013552  887228  887809  582  hypothetical protein  YP_003330399  unclonable  5.42228e-13  n/a    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>