12 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Jann_0404  CDS  NC_007802  406586  408076  1491  hypothetical protein  YP_508346  unclonable  3.36353e-08  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_1099  CDS  NC_007802  1060480  1061223  744  hypothetical protein  YP_509041  unclonable  3.10865e-09  normal  0.0141418  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_1283  CDS  NC_007802  1243620  1244972  1353  extracellular solute-binding protein  YP_509225  unclonable  3.46676e-08  normal  0.943264  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_1425  CDS  NC_007802  1394837  1395787  951  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  YP_509367  unclonable  1.84688e-09  normal  0.493371  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_2888  CDS  NC_007802  2907980  2909005  1026  hypothetical protein  YP_510830  unclonable  5.38932e-09  normal  0.993463  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_3060  CDS  NC_007802  3092469  3093326  858  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  YP_511002  unclonable  2.6744e-09  normal  0.242245  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_3510  CDS  NC_007802  3566035  3566979  945  hypothetical protein  YP_511452  unclonable  6.51854e-09  decreased coverage  5.92213e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_3511  CDS  NC_007802  3567096  3567914  819  IclR family transcriptional regulator  YP_511453  unclonable  2.92695e-09  hitchhiker  0.000232914  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_3701  CDS  NC_007802  3783891  3785234  1344  extracellular solute-binding protein  YP_511643  unclonable  3.75637e-08  normal  0.401469  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_3949  CDS  NC_007802  4048337  4049335  999  taurine ABC transporter, periplasmic taurine-binding protein  YP_511891  unclonable  6.78614e-09  normal  0.176078  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4138  CDS  NC_007802  4248008  4249033  1026  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  YP_512080  unclonable  1.48072e-08  normal  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Jann_4274  CDS  NC_007801  70326  71000  675  hypothetical protein  YP_512214  unclonable  2.40713e-11  normal  0.501804  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>