38 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Clim_0038  CDS  NC_010803  45263  45499  237  SirA family protein  YP_001942125  unclonable  6.89982e-15  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0132  CDS  NC_010803  145571  146662  1092  permease  YP_001942211  unclonable  1.60751e-12  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0133  CDS  NC_010803  146807  147508  702  PHP domain protein  YP_001942212  unclonable  1.41938e-13  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0134  CDS  NC_010803  147556  149754  2199  catalase/peroxidase HPI  YP_001942213  unclonable  8.54212e-10  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0135  CDS  NC_010803  149922  150341  420  ferric uptake regulator, Fur family  YP_001942214  unclonable  2.97915e-14  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0136  CDS  NC_010803  150641  150868  228  hypothetical protein  YP_001942215  unclonable  6.24078e-15  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0199  CDS  NC_010803  224173  224658  486  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxyl carrier protein  YP_001942277  unclonable  2.83274e-14  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0349  CDS  NC_010803  385593  387353  1761  30S ribosomal protein S1  YP_001942421  unclonable  1.35822e-10  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0362  CDS  NC_010803  400457  401746  1290  Cytochrome b/b6 domain  YP_001942434  unclonable  2.96669e-12  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0386  CDS  NC_010803  423547  425667  2121  ATP-dependent DNA helicase RecG  YP_001942458  unclonable  8.98372e-10  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0387  CDS  NC_010803  425704  426660  957  ribosome small subunit-dependent GTPase A  YP_001942459  unclonable  1.79584e-12  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0388  CDS  NC_010803  426706  428082  1377  Aldehyde Dehydrogenase_  YP_001942460  unclonable  2.27501e-11  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0389  CDS  NC_010803  428162  429376  1215  hypothetical protein  YP_001942461  unclonable  5.87209e-12  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0498  CDS  NC_010803  564527  566170  1644  chaperonin GroEL  YP_001942570  unclonable  6.58221e-11  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0521  CDS  NC_010803  588243  589517  1275  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  YP_001942592  unclonable  2.04597e-12  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0747  CDS  NC_010803  818838  820172  1335  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  YP_001942807  unclonable  2.57607e-12  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_0748  CDS  NC_010803  820208  820669  462  peptidoglycan-associated lipoprotein  YP_001942808  unclonable  6.05399e-15  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1167  CDS  NC_010803  1261160  1262176  1017  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  YP_001943214  unclonable  4.44503e-13  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1168  CDS  NC_010803  1262287  1262709  423  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_001943215  unclonable  1.43232e-14  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1399  CDS  NC_010803  1504017  1505366  1350  signal recognition particle protein  YP_001943438  unclonable  2.93601e-12  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1448  CDS  NC_010803  1554224  1555216  993  hypothetical protein  YP_001943486  unclonable  1.02298e-12  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1519  CDS  NC_010803  1638755  1640572  1818  aspartyl-tRNA synthetase  YP_001943549  unclonable  4.63103e-11  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1634  CDS  NC_010803  1766733  1767026  294  hypothetical protein  YP_001943657  unclonable  1.71547e-14  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1635  CDS  NC_010803  1767040  1769454  2415  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_001943658  unclonable  5.74827e-09  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1659  CDS  NC_010803  1794370  1797411  3042  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  YP_001943681  unclonable  1.23584e-07  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1705  CDS  NC_010803  1875452  1875853  402  transcriptional regulator, MerR family  YP_001943726  unclonable  3.10194e-14  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1868  CDS  NC_010803  2053636  2054931  1296  hypothetical protein  YP_001943883  unclonable  4.89897e-12  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1956  CDS  NC_010803  2172696  2172908  213  hypothetical protein  YP_001943967  unclonable  1.89663e-14  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_1968  CDS  NC_010803  2184910  2185446  537  hypothetical protein  YP_001943979  unclonable  2.18249e-14  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_2452  CDS  NC_010803  2685811  2686695  885  hypothetical protein  YP_001944451  unclonable  3.8613e-13  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_2453  CDS  NC_010803  2686706  2687626  921  protein of unknown function DUF89  YP_001944452  unclonable  8.20322e-13  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_2487  CDS  NC_010803  2727359  2727841  483  hypothetical protein  YP_001944485  unclonable  2.74795e-14  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_2488  CDS  NC_010803  2728315  2728860  546  F0F1 ATP synthase subunit delta  YP_001944486  unclonable  4.02457e-14  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_R0043  tRNA  NC_010803  1769606  1769677  72  tRNA-Glu    unclonable  3.74465e-15  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_R0044  tRNA  NC_010803  1769685  1769758  74  tRNA-His    unclonable  3.42103e-15  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_R0045  tRNA  NC_010803  1769782  1769857  76  tRNA-Arg    unclonable  3.00165e-15  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_R0046  tRNA  NC_010803  1769886  1769958  73  tRNA-Pro    unclonable  3.033e-15  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Clim_R0054  tRNA  NC_010803  2728125  2728200  76  tRNA-Ala    unclonable  2.29051e-15  n/a    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>