38 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CPR_0268  CDS  NC_008262  327007  327246  -  240  AbrB family transcriptional regulator  YP_697598  unclonable  0.0000000000426571  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0291  CDS  NC_008262  347659  348345  +  687  cell division ATP-binding protein FtsE, putative  YP_697620  unclonable  0.000000000390691  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0352  CDS  NC_008262  426313  426726  +  414  hypothetical protein  YP_697681  unclonable  0.000000000119615  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0357  CDS  NC_008262  431330  435721  +  4392  hypothetical protein  YP_697686  unclonable  0.00295654  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0584  CDS  NC_008262  697159  697788  +  630  glycosyltransferase  YP_697911  unclonable  0.000000000164965  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0611  CDS  NC_008262  729739  730155  -  417  flavodoxin  YP_697938  unclonable  0.000000000166684  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0621  CDS  NC_008262  740845  741636  +  792  relA/spoT family protein  YP_697948  unclonable  0.00000000073544  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0742  CDS  NC_008262  867786  869051  -  1266  proton/sodium-glutamate symport protein  YP_698068  unclonable  0.00000000616985  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1013  CDS  NC_008262  1154883  1155557  +  675  hypothetical protein  YP_698336  unclonable  0.000000000440663  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1014  CDS  NC_008262  1155899  1156411  +  513  acetyltransferase  YP_698337  unclonable  0.000000000248844  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1067  CDS  NC_008262  1215925  1217583  +  1659  glutamyl-tRNA synthetase  YP_698389  unclonable  0.0000000513816  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1146  CDS  NC_008262  1290948  1291766  -  819  AP endonuclease  YP_698468  unclonable  0.0000000018522  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1179  CDS  NC_008262  1328050  1329402  -  1353  site-specific tyrosine recombinase XerC  YP_698501  unclonable  0.0000000142279  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1183  CDS  NC_008262  1333458  1334561  +  1104  sodium:dicarboxylate symporter family protein  YP_698505  unclonable  0.00000000817553  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1184  CDS  NC_008262  1334711  1335043  -  333  hypothetical protein  YP_698506  unclonable  0.00000000015844  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1185  CDS  NC_008262  1335320  1335964  +  645  hypothetical protein  YP_698507  unclonable  0.000000000512351  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1293  CDS  NC_008262  1462261  1462491  -  231  preprotein translocase subunit SecG  YP_698615  unclonable  0.0000000000521204  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1323  CDS  NC_008262  1493784  1495055  -  1272  CBS domain-containing protein  YP_698643  unclonable  0.0000000111673  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1389  CDS  NC_008262  1560826  1562412  +  1587  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  YP_698708  unclonable  0.0000000667125  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1480  CDS  NC_008262  1655064  1655942  -  879  metallo-beta-lactamase family protein  YP_698799  unclonable  0.00000000092664  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1575  CDS  NC_008262  1766560  1767366  -  807  GTP pyrophosphokinase-like protein  YP_698891  unclonable  0.00000000121431  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1672  CDS  NC_008262  1867793  1868494  -  702  30S ribosomal protein S2  YP_698987  unclonable  0.000000000487185  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1736  CDS  NC_008262  1932859  1934097  -  1239  cell division protein FtsA  YP_699051  unclonable  0.00000000970479  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1821  CDS  NC_008262  2012265  2012714  -  450  hypothetical protein  YP_699136  unclonable  0.000000000225081  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1877  CDS  NC_008262  2071784  2072440  -  657  single-stranded DNA-binding protein  YP_699187  unclonable  0.000000000367804  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2105  CDS  NC_008262  2331267  2332064  -  798  septum site-determining protein MinD  YP_699414  unclonable  0.000000000589774  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2176  CDS  NC_008262  2401653  2402735  -  1083  peptide chain release factor 1  YP_699476  unclonable  0.00000000328118  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2410  CDS  NC_008262  2632392  2632892  -  501  50S ribosomal protein L10  YP_699673  unclonable  0.000000000332682  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2411  CDS  NC_008262  2633109  2633798  -  690  50S ribosomal protein L1  YP_699674  unclonable  0.000000000512351  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2412  CDS  NC_008262  2633856  2634281  -  426  50S ribosomal protein L11  YP_699675  unclonable  0.000000000128335  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2413  CDS  NC_008262  2634356  2634877  -  522  transcription antitermination protein NusG  YP_699676  unclonable  0.000000000134964  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2414  CDS  NC_008262  2634915  2635139  -  225  preprotein translocase subunit SecE  YP_699677  unclonable  0.0000000000338556  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2415  CDS  NC_008262  2635193  2635351  -  159  50S ribosomal protein L33  YP_699678  unclonable  0.0000000000282582  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2484  CDS  NC_008262  2699594  2699986  -  393  cell division protein FtsL, putative  YP_699731  unclonable  0.0000000000770087  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2485  CDS  NC_008262  2700251  2700385  -  135  hypothetical protein  YP_699732  unclonable  0.0000000000181927  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2486  CDS  NC_008262  2700395  2700682  -  288  sporulation protein YabP  YP_699733  unclonable  0.0000000000342083  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2487  CDS  NC_008262  2700802  2701062  -  261  S4 domain-containing protein  YP_699734  unclonable  0.0000000000325164  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2488  CDS  NC_008262  2701170  2701445  -  276  DNA-binding protein HU  YP_699735  unclonable  0.0000000000405619  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>