38 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CPR_0268  CDS  NC_008262  327007  327246  240  AbrB family transcriptional regulator  YP_697598  unclonable  4.26571e-11  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0291  CDS  NC_008262  347659  348345  687  cell division ATP-binding protein FtsE, putative  YP_697620  unclonable  3.90691e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0352  CDS  NC_008262  426313  426726  414  hypothetical protein  YP_697681  unclonable  1.19615e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0357  CDS  NC_008262  431330  435721  4392  hypothetical protein  YP_697686  unclonable  0.00295654  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0584  CDS  NC_008262  697159  697788  630  glycosyltransferase  YP_697911  unclonable  1.64965e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0611  CDS  NC_008262  729739  730155  417  flavodoxin  YP_697938  unclonable  1.66684e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0621  CDS  NC_008262  740845  741636  792  relA/spoT family protein  YP_697948  unclonable  7.3544e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_0742  CDS  NC_008262  867786  869051  1266  proton/sodium-glutamate symport protein  YP_698068  unclonable  6.16985e-09  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1013  CDS  NC_008262  1154883  1155557  675  hypothetical protein  YP_698336  unclonable  4.40663e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1014  CDS  NC_008262  1155899  1156411  513  acetyltransferase  YP_698337  unclonable  2.48844e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1067  CDS  NC_008262  1215925  1217583  1659  glutamyl-tRNA synthetase  YP_698389  unclonable  5.13816e-08  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1146  CDS  NC_008262  1290948  1291766  819  AP endonuclease  YP_698468  unclonable  1.8522e-09  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1179  CDS  NC_008262  1328050  1329402  1353  site-specific tyrosine recombinase XerC  YP_698501  unclonable  1.42279e-08  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1183  CDS  NC_008262  1333458  1334561  1104  sodium:dicarboxylate symporter family protein  YP_698505  unclonable  8.17553e-09  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1184  CDS  NC_008262  1334711  1335043  333  hypothetical protein  YP_698506  unclonable  1.5844e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1185  CDS  NC_008262  1335320  1335964  645  hypothetical protein  YP_698507  unclonable  5.12351e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1293  CDS  NC_008262  1462261  1462491  231  preprotein translocase subunit SecG  YP_698615  unclonable  5.21204e-11  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1323  CDS  NC_008262  1493784  1495055  1272  CBS domain-containing protein  YP_698643  unclonable  1.11673e-08  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1389  CDS  NC_008262  1560826  1562412  1587  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  YP_698708  unclonable  6.67125e-08  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1480  CDS  NC_008262  1655064  1655942  879  metallo-beta-lactamase family protein  YP_698799  unclonable  9.2664e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1575  CDS  NC_008262  1766560  1767366  807  GTP pyrophosphokinase-like protein  YP_698891  unclonable  1.21431e-09  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1672  CDS  NC_008262  1867793  1868494  702  30S ribosomal protein S2  YP_698987  unclonable  4.87185e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1736  CDS  NC_008262  1932859  1934097  1239  cell division protein FtsA  YP_699051  unclonable  9.70479e-09  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1821  CDS  NC_008262  2012265  2012714  450  hypothetical protein  YP_699136  unclonable  2.25081e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_1877  CDS  NC_008262  2071784  2072440  657  single-stranded DNA-binding protein  YP_699187  unclonable  3.67804e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2105  CDS  NC_008262  2331267  2332064  798  septum site-determining protein MinD  YP_699414  unclonable  5.89774e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2176  CDS  NC_008262  2401653  2402735  1083  peptide chain release factor 1  YP_699476  unclonable  3.28118e-09  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2410  CDS  NC_008262  2632392  2632892  501  50S ribosomal protein L10  YP_699673  unclonable  3.32682e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2411  CDS  NC_008262  2633109  2633798  690  50S ribosomal protein L1  YP_699674  unclonable  5.12351e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2412  CDS  NC_008262  2633856  2634281  426  50S ribosomal protein L11  YP_699675  unclonable  1.28335e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2413  CDS  NC_008262  2634356  2634877  522  transcription antitermination protein NusG  YP_699676  unclonable  1.34964e-10  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2414  CDS  NC_008262  2634915  2635139  225  preprotein translocase subunit SecE  YP_699677  unclonable  3.38556e-11  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2415  CDS  NC_008262  2635193  2635351  159  50S ribosomal protein L33  YP_699678  unclonable  2.82582e-11  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2484  CDS  NC_008262  2699594  2699986  393  cell division protein FtsL, putative  YP_699731  unclonable  7.70087e-11  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2485  CDS  NC_008262  2700251  2700385  135  hypothetical protein  YP_699732  unclonable  1.81927e-11  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2486  CDS  NC_008262  2700395  2700682  288  sporulation protein YabP  YP_699733  unclonable  3.42083e-11  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2487  CDS  NC_008262  2700802  2701062  261  S4 domain-containing protein  YP_699734  unclonable  3.25164e-11  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
CPR_2488  CDS  NC_008262  2701170  2701445  276  DNA-binding protein HU  YP_699735  unclonable  4.05619e-11  n/a    Clostridium perfringens SM101  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>