122 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BCZK0001  CDS  NC_006274  408  1748  1341  chromosomal replication initiation protein  YP_081620  unclonable  4.59109e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0056  CDS  NC_006274  63789  64271  483  hypothetical protein  YP_081673  unclonable  7.9318e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0083  CDS  NC_006274  97315  98772  1458  glutamyl-tRNA synthetase  YP_081699  unclonable  9.37191e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0091  CDS  NC_006274  104961  105386  426  50S ribosomal protein L11  YP_081708  unclonable  2.609e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0092  CDS  NC_006274  105564  106256  693  50S ribosomal protein L1  YP_081709  unclonable  3.39498e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0093  CDS  NC_006274  106489  106989  501  50S ribosomal protein L10  YP_081710  unclonable  3.38487e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0099  CDS  NC_006274  116045  116467  423  30S ribosomal protein S12  YP_081716  unclonable  1.47316e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0102  CDS  NC_006274  119371  120558  1188  elongation factor Tu  YP_081719  unclonable  1.09965e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0103  CDS  NC_006274  120957  121265  309  30S ribosomal protein S10  YP_081720  unclonable  5.04345e-14  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0104  CDS  NC_006274  121300  121932  633  50S ribosomal protein L3  YP_081721  unclonable  1.68091e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0105  CDS  NC_006274  121958  122581  624  50S ribosomal protein L4  YP_081722  unclonable  2.56275e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0106  CDS  NC_006274  122581  122871  291  50S ribosomal protein L23  YP_081723  unclonable  5.63087e-14  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0127  CDS  NC_006274  132957  133175  219  translation initiation factor IF-1  YP_081744  unclonable  1.50239e-14  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0205  CDS  NC_006274  217078  217611  534  invasion protein LagB  YP_081820  unclonable  3.41948e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0430  CDS  NC_006274  497186  498283  1098  A/G-specific adenine glycosylase  YP_082039  unclonable  4.40987e-10  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0451  CDS  NC_006274  523516  524292  777  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  YP_082058  unclonable  1.85121e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0555  CDS  NC_006274  650117  650494  378  OsmC-like protein  YP_082161  unclonable  7.99335e-14  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0556  CDS  NC_006274  650557  650991  435  HIT (histidine triad) family protein  YP_082162  unclonable  1.40034e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0557  CDS  NC_006274  651171  651728  558  RNA polymerase sigma factor  YP_082163  unclonable  4.17875e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0588  CDS  NC_006274  685052  685903  852  phospholipase C  YP_082194  unclonable  2.30796e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0600  CDS  NC_006274  696097  697482  1386  peptide symporter family protein  YP_082206  unclonable  8.22499e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0603  CDS  NC_006274  700927  702474  1548  hypothetical protein  YP_082209  unclonable  2.60984e-08  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0634  CDS  NC_006274  740630  741790  1161  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  YP_082239  unclonable  5.28425e-10  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0683  CDS  NC_006274  784111  785766  1656  sodium-dependent phosphate transporter  YP_082287  unclonable  2.53455e-07  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0800  CDS  NC_006274  917558  919147  1590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_082404  unclonable  3.28713e-08  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0884  CDS  NC_006274  1005195  1006931  1737  S-layer protein  YP_082487  unclonable  1.97101e-07  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0922  CDS  NC_006274  1035302  1036321  1020  hypothetical protein  YP_082524  unclonable  6.36245e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0937  CDS  NC_006274  1047361  1048197  837  glycerol uptake facilitator protein  YP_082539  unclonable  1.81424e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0944  CDS  NC_006274  1054231  1055409  1179  cell cycle protein FtsW  YP_082546  unclonable  8.81234e-10  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK0946  CDS  NC_006274  1055467  1055952  486  MarR family transcriptional regulator  YP_082547  unclonable  3.41948e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1056  CDS  NC_006274  1162797  1164029  1233  ammonium transporter  YP_082657  unclonable  3.226e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1314  CDS  NC_006274  1408158  1409429  1272  proton/sodium-glutamate symport protein  YP_082913  unclonable  2.88738e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1336  CDS  NC_006274  1427489  1429531  2043  penicillin-binding protein 2A  YP_082935  unclonable  6.91863e-06  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1361  CDS  NC_006274  1456100  1456714  615  cell wall endopeptidase  YP_082960  unclonable  2.86273e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1362  CDS  NC_006274  1456745  1457431  687  hypothetical protein  YP_082961  unclonable  6.58238e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1363  CDS  NC_006274  1457979  1458557  579  hypothetical protein  YP_082962  unclonable  7.46858e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1367  CDS  NC_006274  1461774  1462340  567  CAAX amino terminal protease family protein  YP_082966  unclonable  1.55141e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1483  CDS  NC_006274  1576279  1577442  1164  Na+/H+ exchanger family protein  YP_083078  unclonable  4.97564e-10  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1628  CDS  NC_006274  1713237  1714478  1242  S-layer protein and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion protein  YP_083222  unclonable  1.59428e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1703  CDS  NC_006274  1802501  1803172  672  deoxyribose-phosphate aldolase  YP_083298  unclonable  4.27517e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1727  CDS  NC_006274  1850132  1851097  966  arsenical-resistance protein  YP_083322  unclonable  7.32374e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1728  CDS  NC_006274  1851458  1852084  627  azoreductase  YP_083323  unclonable  2.41266e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1744  CDS  NC_006274  1868710  1869708  999  S-layer protein  YP_083339  unclonable  1.39139e-10  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1767  CDS  NC_006274  1891407  1892360  954  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  YP_083362  unclonable  5.63802e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1791  CDS  NC_006274  1917951  1918772  822  polysaccharide deacetylase  YP_083386  unclonable  9.07429e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1807  CDS  NC_006274  1934940  1936100  1161  murein endopeptidase  YP_083402  unclonable  4.40987e-10  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK1965  CDS  NC_006274  2078271  2079002  732  hypothetical protein  YP_083557  unclonable  2.19502e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2023  CDS  NC_006274  2146746  2147381  636  azoreductase  YP_083615  unclonable  2.34094e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2231  CDS  NC_006274  2360389  2360796  408  hypothetical protein  YP_083822  unclonable  2.13459e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2250  CDS  NC_006274  2379425  2380705  1281  alpha-ketoglutarate permease  YP_083840  unclonable  2.07173e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2268  CDS  NC_006274  2400534  2401766  1233  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_083858  unclonable  1.38501e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2464  CDS  NC_006274  2599187  2600890  1704  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  YP_084053  unclonable  3.99034e-07  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2539  CDS  NC_006274  2661507  2663576  2070  UvrD/Rep helicase family protein  YP_084128  unclonable  7.8955e-06  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2661  CDS  NC_006274  2768799  2769626  828  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  YP_084248  unclonable  1.38252e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2666  CDS  NC_006274  2774398  2776371  1974  phosphoglycerol transferase  YP_084253  unclonable  3.21801e-06  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2716  CDS  NC_006274  2834536  2835960  1425  amino acid permease; arginine permease  YP_084303  unclonable  1.34476e-08  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2985  CDS  NC_006274  3116127  3116708  582  TetR family transcriptional regulator  YP_084572  unclonable  2.07551e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK2986  CDS  NC_006274  3116933  3118177  1245  major facilitator superfamily permease  YP_084573  unclonable  1.5466e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3182  CDS  NC_006274  3305977  3306357  381  group-specific protein  YP_084768  unclonable  1.30545e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3248  CDS  NC_006274  3371355  3371555  201  cold shock protein  YP_084834  unclonable  2.22014e-14  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3249  CDS  NC_006274  3371772  3372662  891  hypothetical protein  YP_084835  unclonable  4.21279e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3250  CDS  NC_006274  3372688  3373152  465  flavodoxin  YP_084836  unclonable  2.45665e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3386  CDS  NC_006274  3522232  3522453  222  hypothetical protein  YP_084970  unclonable  1.05781e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3387  CDS  NC_006274  3522532  3522972  441  hypothetical protein  YP_084971  unclonable  1.12597e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3407  CDS  NC_006274  3542072  3543127  1056  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_084991  unclonable  1.73531e-10  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3435  CDS  NC_006274  3565989  3566990  1002  hypothetical protein  YP_085018  unclonable  1.06103e-10  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3436  CDS  NC_006274  3567182  3568930  1749  hypothetical protein  YP_085019  unclonable  3.71646e-07  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3486  CDS  NC_006274  3611973  3612245  273  DNA-binding protein HU  YP_085068  unclonable  1.48823e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3487  CDS  NC_006274  3612393  3614810  2418  heavy metal-transporting ATPase  YP_085069  unclonable  0.000442964  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3559  CDS  NC_006274  3693029  3694261  1233  aspartate kinase I  YP_085141  unclonable  1.59428e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3587  CDS  NC_006274  3723682  3724461  780  transcriptional repressor CodY  YP_085169  unclonable  1.52873e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3600  CDS  NC_006274  3737194  3737928  735  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_085182  unclonable  4.82276e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3601  CDS  NC_006274  3737928  3738443  516  16S rRNA-processing protein RimM  YP_085183  unclonable  4.01419e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3602  CDS  NC_006274  3738565  3738792  228  hypothetical protein  YP_085184  unclonable  1.83566e-14  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3603  CDS  NC_006274  3738807  3739079  273  30S ribosomal protein S16  YP_085185  unclonable  3.51748e-14  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3604  CDS  NC_006274  3739180  3740529  1350  signal recognition particle protein  YP_085186  unclonable  4.32061e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3617  CDS  NC_006274  3754976  3755164  189  50S ribosomal protein L28  YP_085199  unclonable  9.96715e-15  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3618  CDS  NC_006274  3755385  3756026  642  thiamine pyrophosphokinase  YP_085200  unclonable  1.7674e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3648  CDS  NC_006274  3788502  3789416  915  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  YP_085230  unclonable  5.63802e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3662  CDS  NC_006274  3801032  3801901  870  sporulation sigma factor SigG  YP_085244  unclonable  1.67357e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3718  CDS  NC_006274  3856563  3857354  792  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  YP_085299  unclonable  2.37867e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3906  CDS  NC_006274  4029389  4029595  207  group-specific protein  YP_085486  unclonable  6.54327e-14  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3922  CDS  NC_006274  4045370  4046896  1527  hemagglutinin  YP_085502  unclonable  3.56284e-08  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3929  CDS  NC_006274  4054953  4055792  840  hemolysin A  YP_085509  unclonable  2.68336e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK3977  CDS  NC_006274  4089896  4090120  225  hypothetical protein  YP_085557  unclonable  1.2422e-14  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4035  CDS  NC_006274  4144314  4145624  1311  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  YP_085615  unclonable  4.92575e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4042  CDS  NC_006274  4150370  4151491  1122  RNA polymerase sigma factor RpoD  YP_085621  unclonable  1.02439e-09  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4047  CDS  NC_006274  4156883  4157788  906  GTP-binding protein Era  YP_085626  unclonable  6.69103e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4096  CDS  NC_006274  4202585  4203085  501  hypothetical protein  YP_085675  unclonable  5.75667e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4130  CDS  NC_006274  4235354  4235767  414  Holliday junction resolvase-like protein  YP_085709  unclonable  2.38321e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4161  CDS  NC_006274  4268777  4269916  1140  queuine tRNA-ribosyltransferase  YP_085740  unclonable  3.10592e-10  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4162  CDS  NC_006274  4269929  4270981  1053  S-adenosylmethionine:tRNA ribosyltransferase-isomerase  YP_085741  unclonable  1.19694e-10  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4165  CDS  NC_006274  4272205  4272822  618  Holliday junction DNA helicase RuvA  YP_085744  unclonable  4.36229e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4214  CDS  NC_006274  4321271  4323601  2331  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  YP_085793  unclonable  0.000107008  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4317  CDS  NC_006274  4428890  4429477  588  translation initiation factor IF-3  YP_085896  unclonable  1.17232e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4323  CDS  NC_006274  4436447  4436839  393  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  YP_085902  unclonable  1.66185e-13  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4324  CDS  NC_006274  4437221  4438249  1029  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  YP_085903  unclonable  1.23361e-10  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4612  CDS  NC_006274  4701491  4702444  954  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  YP_086187  unclonable  5.69669e-11  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4613  CDS  NC_006274  4702554  4703285  732  DnaK suppressor protein  YP_086188  unclonable  6.78403e-12  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
BCZK4614  CDS  NC_006274  4703330  4703530  201  cold shock protein  YP_086189  unclonable  1.69422e-14  n/a    Bacillus cereus E33L  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>