78 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BT9727_0095  CDS  NC_005957  112226  112726  501  50S ribosomal protein L10  YP_034451  unclonable  8.69083e-23  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0104  CDS  NC_005957  125108  126295  1188  elongation factor Tu  YP_034460  unclonable  3.21711e-18  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0105  CDS  NC_005957  126694  127002  309  30S ribosomal protein S10  YP_034461  unclonable  8.60274e-23  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0106  CDS  NC_005957  127037  127669  633  50S ribosomal protein L3  YP_034462  unclonable  2.67077e-21  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0107  CDS  NC_005957  127695  128318  624  50S ribosomal protein L4  YP_034463  unclonable  2.56557e-21  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0108  CDS  NC_005957  128318  128608  291  50S ribosomal protein L23  YP_034464  unclonable  2.29551e-23  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0129  CDS  NC_005957  138694  138912  219  translation initiation factor IF-1  YP_034485  unclonable  3.60601e-24  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0237  CDS  NC_005957  263329  264090  762  CAAX amino protease  YP_034591  unclonable  1.43871e-20  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0370  CDS  NC_005957  435774  437057  1284  major facilitator superfamily permease  YP_034720  unclonable  6.90283e-18  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0415  CDS  NC_005957  482300  483802  1503  PTS system, N-acetylglucosamine-specific EIIBC component  YP_034765  unclonable  8.28899e-17  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0455  CDS  NC_005957  530359  531135  777  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  YP_034803  unclonable  8.97841e-21  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0521  CDS  NC_005957  614527  616146  1620  L-lactate permease  YP_034868  unclonable  1.74068e-16  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0525  CDS  NC_005957  619409  620374  966  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  YP_034872  unclonable  3.33829e-20  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0558  CDS  NC_005957  653735  654292  558  RNA polymerase sigma factor  YP_034904  unclonable  8.52234e-22  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0600  CDS  NC_005957  698714  700015  1302  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  YP_034946  unclonable  2.73934e-18  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0634  CDS  NC_005957  741616  742776  1161  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  YP_034979  unclonable  1.20419e-18  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0696  CDS  NC_005957  799465  801120  1656  sodium-dependent phosphate transporter  YP_035041  unclonable  2.23681e-16  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0713  CDS  NC_005957  817523  818839  1317  branched-chain amino acid transport protein  YP_035057  unclonable  2.39316e-17  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0735  CDS  NC_005957  835931  836335  405  hypothetical protein  YP_035079  unclonable  2.74926e-23  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0788  CDS  NC_005957  892662  894509  1848  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  YP_035132  unclonable  3.56588e-15  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0796  CDS  NC_005957  902781  904403  1623  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_035139  unclonable  1.06495e-16  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0842  CDS  NC_005957  949033  950139  1107  type II restriction enzyme HpaII (endonuclease HpaII)  YP_035185  unclonable  7.90153e-19  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0948  CDS  NC_005957  1045727  1047409  1683  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  YP_035287  unclonable  7.99901e-16  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_0956  CDS  NC_005957  1051801  1052286  486  MarR family transcriptional regulator  YP_035295  unclonable  2.251e-22  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_1059  CDS  NC_005957  1153148  1154380  1233  ammonium transporter  YP_035395  unclonable  6.49834e-18  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_1362  CDS  NC_005957  1445482  1446096  615  cell wall endopeptidase  YP_035696  unclonable  3.83171e-21  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_1363  CDS  NC_005957  1446127  1446813  687  hypothetical protein  YP_035697  unclonable  8.8874e-21  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_1364  CDS  NC_005957  1447361  1447939  579  hypothetical protein  YP_035698  unclonable  9.70731e-22  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_1365  CDS  NC_005957  1448063  1448311  249  ferredoxin  YP_035699  unclonable  2.36587e-23  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_1587  CDS  NC_005957  1661070  1661636  567  RNA polymerase factor sigma-70  YP_035919  unclonable  4.40147e-22  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_1750  CDS  NC_005957  1836568  1837194  627  azoreductase  YP_036082  unclonable  1.24715e-21  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_1751  CDS  NC_005957  1837434  1838792  1359  branched-chain amino acid transport system carrier protein  YP_036083  unclonable  1.04073e-17  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_1823  CDS  NC_005957  1914176  1915336  1161  murein endopeptidase  YP_036155  unclonable  1.57805e-18  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_1983  CDS  NC_005957  2062291  2063022  732  hypothetical protein  YP_036312  unclonable  8.45076e-21  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_2025  CDS  NC_005957  2111373  2112008  636  azoreductase  YP_036354  unclonable  1.08402e-21  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_2026  CDS  NC_005957  2112120  2112839  720  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  YP_036355  unclonable  5.7184e-21  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_2214  CDS  NC_005957  2301976  2302527  552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  YP_036541  unclonable  2.09842e-22  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_2215  CDS  NC_005957  2302567  2302752  186  hypothetical protein  YP_036542  unclonable  1.02248e-24  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_2216  CDS  NC_005957  2302839  2303042  204  cold shock protein  YP_036543  unclonable  9.62754e-25  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_2294  CDS  NC_005957  2379833  2381113  1281  alpha-ketoglutarate permease  YP_036620  unclonable  5.05412e-18  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_2310  CDS  NC_005957  2399362  2400594  1233  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_036636  unclonable  2.21919e-18  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_2499  CDS  NC_005957  2586495  2588198  1704  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  YP_036825  unclonable  1.44667e-15  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_2685  CDS  NC_005957  2747962  2748789  828  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  YP_037009  unclonable  8.97841e-21  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_2735  CDS  NC_005957  2810087  2811523  1437  amino acid permease; arginine permease  YP_037059  unclonable  4.73019e-17  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3240  CDS  NC_005957  3305627  3306007  381  hypothetical protein  YP_037562  unclonable  5.82236e-23  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3296  CDS  NC_005957  3366478  3367323  846  exonuclease  YP_037618  unclonable  5.13376e-20  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3297  CDS  NC_005957  3367514  3367714  201  cold shock protein  YP_037619  unclonable  1.03106e-23  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3298  CDS  NC_005957  3367931  3368623  693  hypothetical protein  YP_037620  unclonable  3.10358e-21  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3299  CDS  NC_005957  3368559  3368897  339  BNR repeat-containing protein  YP_037621  unclonable  3.06951e-23  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3300  CDS  NC_005957  3368848  3369291  444  flavodoxin  YP_037622  unclonable  1.31078e-22  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3301  CDS  NC_005957  3369433  3370053  621  GPR1/FUN34/yaaH family protein  YP_037623  unclonable  6.83805e-22  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3381  CDS  NC_005957  3460716  3461291  576  bioY family protein  YP_037703  unclonable  4.96357e-22  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3406  CDS  NC_005957  3487406  3487846  441  anti-terminator HutP  YP_037728  unclonable  6.30847e-23  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3434  CDS  NC_005957  3518791  3519012  222  hypothetical protein  YP_037755  unclonable  3.07227e-24  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3459  CDS  NC_005957  3543991  3544944  954  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  YP_037779  unclonable  1.63919e-19  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3503  CDS  NC_005957  3586918  3587715  798  cell wall hydrolase  YP_037823  unclonable  9.35014e-21  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3541  CDS  NC_005957  3634146  3635378  1233  aspartate kinase I  YP_037861  unclonable  4.21914e-18  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3569  CDS  NC_005957  3664800  3665579  780  transcriptional repressor CodY  YP_037889  unclonable  1.96382e-20  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3582  CDS  NC_005957  3678312  3679046  735  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_037902  unclonable  3.71776e-21  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3583  CDS  NC_005957  3679046  3679561  516  16S rRNA-processing protein RimM  YP_037903  unclonable  3.00886e-22  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3584  CDS  NC_005957  3679682  3679909  228  hypothetical protein  YP_037904  unclonable  7.1205e-24  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3585  CDS  NC_005957  3679924  3680196  273  30S ribosomal protein S16  YP_037905  unclonable  1.24703e-23  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3599  CDS  NC_005957  3696093  3696281  189  50S ribosomal protein L28  YP_037919  unclonable  6.44169e-24  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3645  CDS  NC_005957  3742791  3743660  870  sporulation sigma factor SigG  YP_037965  unclonable  1.74076e-20  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3898  CDS  NC_005957  3977672  3978451  780  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  YP_038217  unclonable  1.38178e-20  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3913  CDS  NC_005957  3993730  3995256  1527  hypothetical protein  YP_038232  unclonable  1.80663e-17  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3917  CDS  NC_005957  4000048  4000497  450  arginine repressor  YP_038236  unclonable  9.90108e-23  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3918  CDS  NC_005957  4000640  4001479  840  hemolysin A  YP_038237  unclonable  1.38178e-20  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_3988  CDS  NC_005957  4051729  4053123  1395  sodium:dicarboxylate symporter family protein  YP_038307  unclonable  1.04073e-17  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_4032  CDS  NC_005957  4096154  4097275  1122  RNA polymerase sigma factor RpoD  YP_038350  unclonable  1.92398e-19  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_4151  CDS  NC_005957  4214973  4216025  1053  S-adenosylmethionine:tRNA ribosyltransferase-isomerase  YP_038468  unclonable  3.54566e-19  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_4312  CDS  NC_005957  4379043  4379435  393  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  YP_038627  unclonable  8.86807e-23  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_4766  CDS  NC_005957  4812812  4813993  1182  NupC family nucleoside transporter  YP_039075  unclonable  3.81544e-18  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_4961  CDS  NC_005957  5015977  5016411  435  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  YP_039270  unclonable  1.28459e-22  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_4962  CDS  NC_005957  5016969  5017970  1002  rod shape-determining protein Mbl  YP_039271  unclonable  1.96321e-19  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_5004  CDS  NC_005957  5055292  5055678  387  hypothetical protein  YP_039313  unclonable  1.91746e-22  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_5085  CDS  NC_005957  5144883  5146178  1296  homoserine dehydrogenase  YP_039395  unclonable  5.21004e-18  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
BT9727_5099  CDS  NC_005957  5160599  5161339  741  N-acetylglucosaminyldiphosphoundecaprenol N-acetyl-beta-D-mannosaminyltransferase  YP_039409  unclonable  8.28185e-21  n/a    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>