181 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Dhaf_0043  CDS  NC_011830  41158  41901  744  ABC transporter related  YP_002456548  unclonable  1.6055e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0044  CDS  NC_011830  41873  42706  834  ABC-3 protein  YP_002456549  unclonable  3.63337e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0045  CDS  NC_011830  42774  43187  414  ferric uptake regulator, Fur family  YP_002456550  unclonable  3.4921e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0065  CDS  NC_011830  65222  65491  270  transcriptional regulator, AbrB family  YP_002456570  unclonable  1.25498e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0066  CDS  NC_011830  66076  66294  219  hypothetical protein  YP_002456571  unclonable  1.15826e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0067  CDS  NC_011830  66426  68369  1944  methionyl-tRNA synthetase  YP_002456572  unclonable  2.5899e-10  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0161  CDS  NC_011830  168140  169105  966  TIM-barrel protein, nifR3 family  YP_002456665  unclonable  1.41339e-14  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0162  CDS  NC_011830  169304  169774  471  transcription elongation factor GreA  YP_002456666  unclonable  7.34558e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0163  CDS  NC_011830  169967  171433  1467  lysyl-tRNA synthetase  YP_002456667  unclonable  1.42799e-12  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0215  CDS  NC_011830  235271  235867  597  translation initiation factor IF-3  YP_002456719  unclonable  2.62616e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0231  CDS  NC_011830  254000  254245  246  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  YP_002456735  unclonable  4.74798e-18  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0238  CDS  NC_011830  271662  272438  777  protein of unknown function DUF81  YP_002456742  unclonable  8.69353e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0239  CDS  NC_011830  272435  273190  756  hypothetical protein  YP_002456743  unclonable  1.1533e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0240  CDS  NC_011830  273225  274124  900  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002456744  unclonable  5.82767e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0241  CDS  NC_011830  274255  274578  324  Thioredoxin domain protein  YP_002456745  unclonable  1.83806e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0242  CDS  NC_011830  274679  275131  453  transcriptional regulator, XRE family  YP_002456746  unclonable  4.3549e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0268  CDS  NC_011830  301676  303172  1497  L-lactate permease  YP_002456772  unclonable  2.16096e-12  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0281  CDS  NC_011830  313031  313330  300  hypothetical protein  YP_002456785  unclonable  1.62891e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0292  CDS  NC_011830  325811  328165  2355  ferrous iron transport protein B  YP_002456796  unclonable  4.54012e-09  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0332  CDS  NC_011830  368378  368758  381  Protein of unknown function CGGC region  YP_002456835  unclonable  1.19999e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0333  CDS  NC_011830  368949  369242  294  protein of unknown function DUF156  YP_002456836  unclonable  4.14085e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0381  CDS  NC_011830  422931  424154  1224  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002456884  unclonable  1.07075e-13  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0402  CDS  NC_011830  444130  444783  654  RNA polymerase factor sigma-70  YP_002456905  unclonable  3.38021e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0407  CDS  NC_011830  446907  447599  693  50S ribosomal protein L1  YP_002456910  unclonable  4.3464e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0408  CDS  NC_011830  447828  448352  525  50S ribosomal protein L10  YP_002456911  unclonable  1.79305e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0411  CDS  NC_011830  450151  453207  3057  signal transduction histidine kinase, LytS  YP_002456914  unclonable  4.11039e-06  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0494  CDS  NC_011830  542910  544847  1938  signal transduction histidine kinase, LytS  YP_002456997  unclonable  2.48497e-10  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0527  CDS  NC_011830  578552  579133  582  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  YP_002457030  unclonable  3.05731e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0528  CDS  NC_011830  579433  580887  1455  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002457031  unclonable  1.87583e-12  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0681  CDS  NC_011830  765997  766872  876  transcriptional regulator, LysR family  YP_002457181  unclonable  3.25091e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0742  CDS  NC_011830  827623  828171  549  hypothetical protein  YP_002457242  unclonable  1.03243e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0760  CDS  NC_011830  845152  848649  3498  SMC domain protein  YP_002457260  unclonable  2.89262e-05  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0851  CDS  NC_011830  945957  947177  1221  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_002457350  unclonable  1.13815e-13  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0916  CDS  NC_011830  1007586  1009385  1800  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  YP_002457415  unclonable  9.47728e-11  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0917  CDS  NC_011830  1009459  1010541  1083  quinolinate synthetase  YP_002457416  unclonable  4.24051e-14  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_0944  CDS  NC_011830  1035866  1036573  708  AzlC family protein  YP_002457443  unclonable  3.77629e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1002  CDS  NC_011830  1089129  1089716  588  protein of unknown function DUF820  YP_002457498  unclonable  3.62603e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1003  CDS  NC_011830  1089893  1091140  1248  threonine dehydratase  YP_002457499  unclonable  1.80707e-13  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1071  CDS  NC_011830  1166346  1166546  201  Domain of unknown function DUF1858  YP_002457567  unclonable  4.89355e-18  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1072  CDS  NC_011830  1166739  1167029  291  hypothetical protein  YP_002457568  unclonable  1.33285e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1073  CDS  NC_011830  1167329  1167670  342  small multidrug resistance protein  YP_002457569  unclonable  2.15784e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1137  CDS  NC_011830  1230579  1231985  1407  Peptidase M23  YP_002457633  unclonable  1.09731e-12  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1145  CDS  NC_011830  1238679  1239122  444  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  YP_002457640  unclonable  4.39954e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1146  CDS  NC_011830  1239337  1240626  1290  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  YP_002457641  unclonable  1.63408e-13  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1148  CDS  NC_011830  1241924  1242835  912  transcriptional regulator, LysR family  YP_002457643  unclonable  2.19344e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1149  CDS  NC_011830  1242964  1243899  936  cysteine synthase A  YP_002457644  unclonable  2.5777e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1150  CDS  NC_011830  1244208  1244882  675  SNARE associated Golgi protein  YP_002457645  unclonable  3.66321e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1169  CDS  NC_011830  1263202  1263417  216  hypothetical protein  YP_002457664  unclonable  2.74534e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1184  CDS  NC_011830  1281051  1281383  333  hypothetical protein  YP_002457678  unclonable  2.45839e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1185  CDS  NC_011830  1281553  1282287  735  polysaccharide deacetylase  YP_002457679  unclonable  2.23866e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1186  CDS  NC_011830  1282360  1283001  642  hypothetical protein  YP_002457680  unclonable  7.39916e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1187  CDS  NC_011830  1283136  1284326  1191  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  YP_002457681  unclonable  1.11538e-13  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1188  CDS  NC_011830  1284427  1285071  645  channel protein, hemolysin III family  YP_002457682  unclonable  4.30229e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1235  CDS  NC_011830  1329722  1330552  831  S-adenosylmethionine decarboxylase  YP_002457728  unclonable  2.12775e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1241  CDS  NC_011830  1336030  1337187  1158  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  YP_002457734  unclonable  4.59944e-14  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1282  CDS  NC_011830  1380116  1380934  819  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  YP_002457774  unclonable  4.67203e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1310  CDS  NC_011830  1410187  1411575  1389  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  YP_002457802  unclonable  1.27707e-12  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1344  CDS  NC_011830  1451818  1452834  1017  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  YP_002457836  unclonable  9.16966e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1345  CDS  NC_011830  1452939  1454369  1431  domain of unknown function DUF1727  YP_002457837  unclonable  6.49333e-13  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1350  CDS  NC_011830  1457199  1459334  2136  molybdopterin oxidoreductase  YP_002457842  unclonable  1.09078e-09  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1382  CDS  NC_011830  1487701  1488369  669  protein of unknown function DUF161  YP_002457874  unclonable  1.2123e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1394  CDS  NC_011830  1500491  1501417  927  protein of unknown function DUF340 membrane  YP_002457886  unclonable  7.34675e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1437  CDS  NC_011830  1534004  1534549  546  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  YP_002457927  unclonable  1.55755e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1487  CDS  NC_011830  1582555  1583577  1023  ABC transporter related  YP_002457975  unclonable  1.7469e-14  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1577  CDS  NC_011830  1685776  1686468  693  LrgB family protein  YP_002458063  unclonable  4.4351e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1648  CDS  NC_011830  1762108  1762650  543  hypothetical protein  YP_002458130  unclonable  1.65453e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1649  CDS  NC_011830  1762716  1763318  603  Methyltransferase type 12  YP_002458131  unclonable  2.70723e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1650  CDS  NC_011830  1763375  1764028  654  3-methyladenine DNA glycosylase  YP_002458132  unclonable  4.9528e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1651  CDS  NC_011830  1764154  1764576  423  transcriptional regulator, MarR family  YP_002458133  unclonable  8.20136e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1652  CDS  NC_011830  1764619  1765983  1365  MATE efflux family protein  YP_002458134  unclonable  7.78713e-13  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1718  CDS  NC_011830  1841522  1842379  858  AAA ATPase  YP_002458200  unclonable  6.84443e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_1810  CDS  NC_011830  1936075  1937061  987  periplasmic binding protein  YP_002458290  unclonable  9.8406e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2038  CDS  NC_011830  2197702  2198622  921  transcriptional regulator, LysR family  YP_002458511  unclonable  3.67064e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2049  CDS  NC_011830  2210942  2212399  1458  sodium/sulphate symporter  YP_002458522  unclonable  5.25782e-13  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2095  CDS  NC_011830  2256017  2257357  1341  hypothetical protein  YP_002458567  unclonable  3.6195e-13  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2127  CDS  NC_011830  2293629  2295422  1794  ABC transporter related  YP_002458599  unclonable  1.26664e-11  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2156  CDS  NC_011830  2321865  2322593  729  prevent-host-death family protein  YP_002458626  unclonable  2.23866e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2190  CDS  NC_011830  2365975  2367000  1026  hypothetical protein  YP_002458660  unclonable  1.57839e-14  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2225  CDS  NC_011830  2404728  2405774  1047  periplasmic binding protein  YP_002458694  unclonable  2.31713e-14  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2226  CDS  NC_011830  2405926  2406723  798  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  YP_002458695  unclonable  7.78167e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2269  CDS  NC_011830  2452304  2452660  357  arsenate reductase and related  YP_002458736  unclonable  1.81941e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2281  CDS  NC_011830  2464857  2466095  1239  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  YP_002458748  unclonable  8.1602e-14  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2287  CDS  NC_011830  2470585  2471031  447  hypothetical protein  YP_002458754  unclonable  2.24635e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2288  CDS  NC_011830  2471130  2471801  672  uracil-DNA glycosylase  YP_002458755  unclonable  1.4813e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2296  CDS  NC_011830  2480082  2480930  849  extracellular solute-binding protein family 3  YP_002458763  unclonable  2.5777e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2299  CDS  NC_011830  2482666  2484501  1836  ABC transporter related  YP_002458766  unclonable  4.26406e-11  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2382  CDS  NC_011830  2574359  2575258  900  hypothetical protein  YP_002458847  unclonable  5.43034e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2388  CDS  NC_011830  2580005  2581630  1626  aminotransferase class V  YP_002458853  unclonable  2.69735e-12  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2461  CDS  NC_011830  2658260  2658733  474  transcriptional regulator, MarR family  YP_002458925  unclonable  6.6439e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2462  CDS  NC_011830  2658898  2660133  1236  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002458926  unclonable  1.09307e-13  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2472  CDS  NC_011830  2670388  2670990  603  dephospho-CoA kinase  YP_002458936  unclonable  3.73797e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2473  CDS  NC_011830  2671172  2671771  600  Lytic transglycosylase catalytic  YP_002458937  unclonable  2.84832e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2474  CDS  NC_011830  2671800  2672171  372  Ion transport 2 domain protein  YP_002458938  unclonable  1.87557e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2558  CDS  NC_011830  2760972  2762894  1923  hypothetical protein  YP_002459021  unclonable  1.98927e-10  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2559  CDS  NC_011830  2762919  2763287  369  YdfQ  YP_002459022  unclonable  5.5439e-17  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2560  CDS  NC_011830  2763395  2763601  207  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  YP_002459023  unclonable  7.83587e-18  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2561  CDS  NC_011830  2763805  2764632  828  beta-lactamase domain protein  YP_002459024  unclonable  2.65837e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2625  CDS  NC_011830  2826527  2827372  846  ketose-bisphosphate aldolase  YP_002459087  unclonable  2.85286e-15  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2662  CDS  NC_011830  2865085  2865603  519  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_002459124  unclonable  2.81941e-16  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Dhaf_2666  CDS  NC_011830  2868661  2869833  1173  TraB family protein  YP_002459128  unclonable  8.1602e-14  n/a    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>