30 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CHU_0040  CDS  NC_008255  50518  53673  3156  DNA repair ATPase  YP_676674  unclonable  5.7692e-07  hitchhiker  0.00102482  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_1522  CDS  NC_008255  1760942  1763860  2919  hypothetical protein  YP_678133  unclonable  1.06004e-07  normal  0.087723  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_1523  CDS  NC_008255  1764007  1764573  567  hypothetical protein  YP_678134  unclonable  1.02654e-14  normal  0.135541  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_1524  CDS  NC_008255  1764585  1769444  4860  hypothetical protein  YP_678135  unclonable  6.11783e-05  normal  0.152369  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2149  CDS  NC_008255  2497450  2500776  3327  glycoside hydrolase family 5 protein  YP_678754  unclonable  5.32282e-07  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2206  CDS  NC_008255  2562575  2564404  1830  cytochrome c oxidase, subunit I  YP_678811  unclonable  5.15262e-10  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2379  CDS  NC_008255  2741518  2745000  3483  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  YP_678979  unclonable  6.00941e-07  normal  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2895  CDS  NC_008255  3311131  3315105  3975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_679483  unclonable  3.43468e-06  normal  0.0609683  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2924  CDS  NC_008255  3340823  3344017  3195  hypothetical protein  YP_679508  unclonable  5.94804e-07  normal  0.19757  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2925  CDS  NC_008255  3344068  3345753  1686  hypothetical protein  YP_679509  unclonable  1.82074e-10  normal  0.28317  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2948  CDS  NC_008255  3373410  3375995  2586  hypothetical protein  YP_679532  unclonable  7.54112e-08  unclonable  1.01752e-05  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2949  CDS  NC_008255  3376047  3377486  1440  site-specific recombinase  YP_679533  hitchhiker  7.64647e-09  unclonable  6.28307e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2950  CDS  NC_008255  3377518  3377706  189  hypothetical protein  YP_679534  hitchhiker  9.4216e-09  unclonable  4.11859e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2951  CDS  NC_008255  3377725  3378129  405  hypothetical protein  YP_679535  hitchhiker  9.7185e-09  unclonable  4.28891e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2952  CDS  NC_008255  3378335  3378670  336  hypothetical protein  YP_679536  hitchhiker  1.12801e-09  unclonable  4.24513e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2953  CDS  NC_008255  3378667  3379038  372  hypothetical protein  YP_679537  hitchhiker  1.51184e-10  unclonable  4.42068e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2954  CDS  NC_008255  3379035  3379442  408  hypothetical protein  YP_679538  decreased coverage  1.7576e-10  unclonable  4.51115e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2955  CDS  NC_008255  3379892  3381943  2052  hypothetical protein  YP_679539  decreased coverage  2.96771e-06  unclonable  9.29698e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2956  CDS  NC_008255  3381945  3382997  1053  hypothetical protein  YP_679540  hitchhiker  1.11336e-07  unclonable  6.87657e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2957  CDS  NC_008255  3383113  3388779  5667  hypothetical protein  YP_679541  unclonable  0.000786902  unclonable  3.38005e-05  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2958  CDS  NC_008255  3388772  3391078  2307  GTPase  YP_679542  unclonable  1.6463e-08  unclonable  1.21851e-05  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2959  CDS  NC_008255  3391105  3392247  1143  hypothetical protein  YP_679543  hitchhiker  8.13097e-10  unclonable  7.16096e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2960  CDS  NC_008255  3392683  3393336  654  DNA resolvase  YP_679544  decreased coverage  1.68825e-12  unclonable  5.91562e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2961  CDS  NC_008255  3393346  3393774  429  hypothetical protein  YP_679545  hitchhiker  7.14757e-08  unclonable  5.14012e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2962  CDS  NC_008255  3393810  3394640  831  hypothetical protein  YP_679546  hitchhiker  4.74154e-06  unclonable  5.51426e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2963  CDS  NC_008255  3394692  3395003  312  hypothetical protein  YP_679547  hitchhiker  2.01554e-05  unclonable  4.79136e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2964  CDS  NC_008255  3395024  3396406  1383  hypothetical protein  YP_679548  hitchhiker  9.89535e-06  unclonable  9.20206e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2965  CDS  NC_008255  3396476  3397087  612  sigma 24 related  YP_679549  hitchhiker  0.00314986  unclonable  7.99779e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2966  CDS  NC_008255  3397448  3397879  432  hypothetical protein  YP_679550  normal  0.548269  unclonable  7.30752e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
CHU_2967  CDS  NC_008255  3398002  3398190  189  hypothetical protein  YP_679551  normal  0.243732  unclonable  6.87657e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>