14 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Mbar_A0026  CDS  NC_007355  31258  32436  1179  hypothetical protein  YP_303597  unclonable  1.12198e-09  hitchhiker  0.00859577  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
 
Mbar_A0027  CDS  NC_007355  32530  34323  1794  hypothetical protein  YP_303598  unclonable  1.39812e-08  decreased coverage  0.00503722  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0776  CDS  NC_007355  938251  938676  426  hypothetical protein  YP_304333  normal  unclonable  4.33123e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0777  CDS  NC_007355  938846  939616  771  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  YP_304334  normal  unclonable  6.02932e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0778  CDS  NC_007355  940292  940717  426  nodulation protein L  YP_304335  normal  unclonable  4.3759e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A0779  CDS  NC_007355  941070  942176  1107  hypothetical protein  YP_304336  normal  unclonable  5.90838e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A1797  CDS  NC_007355  2227623  2228840  1218  hypothetical protein  YP_305318  unclonable  7.82574e-10  normal  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
 
Mbar_A1820  CDS  NC_007355  2274639  2275865  1227  acetate kinase  YP_305341  unclonable  1.79563e-09  normal  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A1995  CDS  NC_007355  2511422  2517070  5649  cell surface protein  YP_305509  unclonable  0.00993075  normal  0.508368  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A2007  CDS  NC_007355  2531886  2532218  333  hypothetical protein  YP_305521  unclonable  1.52037e-11  normal  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
 
Mbar_A2689  CDS  NC_007355  3406638  3408377  1740  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  YP_306173  unclonable  8.64453e-09  normal  0.0786508  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A3040  CDS  NC_007355  3918973  3919725  753  hypothetical protein  YP_306512  unclonable  1.31903e-10  normal  0.41258  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
 
Mbar_A3387  CDS  NC_007355  4345690  4345911  222  30S ribosomal protein S28e  YP_306840  unclonable  2.5371e-12  normal  0.0615713  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Mbar_A3388  CDS  NC_007355  4345936  4346298  363  50S ribosomal protein L7Ae  YP_306841  unclonable  7.32492e-12  normal  0.0682764  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>