21 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bcep18194_A3195  CDS  NC_007510  28180  28710  531  cytochrome B561  YP_367441  unclonable  3.8673e-12  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3409  CDS  NC_007510  267347  268276  930  LysR family transcriptional regulator  YP_367655  unclonable  2.05674e-11  normal  0.256095  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3410  CDS  NC_007510  268461  269294  834  OmpW family protein  YP_367656  unclonable  1.36478e-11  normal  0.438926  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3430  CDS  NC_007510  291501  292772  1272  lipolytic protein  YP_367676  unclonable  1.3234e-10  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3447  CDS  NC_007510  322381  323034  654  50S ribosomal protein L3  YP_367693  unclonable  1.08395e-11  normal  0.0130308  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A3448  CDS  NC_007510  323034  323654  621  50S ribosomal protein L4  YP_367694  unclonable  7.41082e-12  normal  0.0132127  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
 
Bcep18194_A3449  CDS  NC_007510  323651  323965  315  50S ribosomal protein L23  YP_367695  unclonable  2.44074e-12  normal  0.012759  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A5257  CDS  NC_007510  2312524  2313543  1020  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  YP_369495  unclonable  3.6392e-11  normal  0.697863  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A5258  CDS  NC_007510  2313590  2314120  531  hypothetical protein  YP_369496  unclonable  5.11759e-12  normal  0.636992  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
 
Bcep18194_A5546  CDS  NC_007510  2644652  2645869  1218  hypothetical protein  YP_369784  unclonable  8.95674e-11  normal  0.329436  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A5640  CDS  NC_007510  2735850  2738135  2286  virulence-associated E family protein  YP_369878  unclonable  8.85028e-09  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
 
Bcep18194_A5709  CDS  NC_007510  2817018  2818067  1050  hypothetical protein  YP_369947  unclonable  3.25929e-11  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_A6509  CDS  NC_007510  3682151  3682564  414  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_370747  unclonable  1.78969e-12  normal  0.161023  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_AR0065  tRNA  NC_007510  2425912  2425984  73  tRNA-Glu    unclonable  2.08338e-13  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_AR0066  tRNA  NC_007510  2426126  2426198  73  tRNA-Ala    unclonable  2.1471e-13  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0516  CDS  NC_007511  580572  581657  1086  hypothetical protein  YP_371274  unclonable  1.63544e-12  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
 
Bcep18194_B1048  CDS  NC_007511  1174908  1175375  468  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_371806  unclonable  3.37431e-14  normal  0.172075  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B1049  CDS  NC_007511  1175573  1176337  765  hypothetical protein  YP_371807  unclonable  1.46795e-13  normal  0.176851  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
 
Bcep18194_B1050  CDS  NC_007511  1176389  1176997  609  autoinducer synthesis protein  YP_371808  unclonable  8.30053e-14  normal  0.1745  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B1194  CDS  NC_007511  1344565  1347708  3144  hydrophobe/amphiphile efflux pump protein  YP_371952  unclonable  1.51988e-08  normal  0.324447  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
 
Bcep18194_C6941  CDS  NC_007509  497394  498515  1122  outer membrane protein (porin)  YP_366631  unclonable  3.10318e-12  normal  0.643054  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>