16 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
RS01507  tRNA  NC_003295  2335078  2335154  77  tRNA-Arg    unclonable  1.47856e-08  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS02992  CDS  NC_003296  150518  152083  1566  hypothetical protein  NP_521691  unclonable  7.18056e-07  normal  0.615169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04000  tRNA  NC_003295  1170259  1170334  76  tRNA-Asn    unclonable  2.34259e-08  normal  0.180711  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS04529  tRNA  NC_003295  1241575  1241650  76  tRNA-Ala    unclonable  9.42406e-09  normal  0.305986  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS05580  rRNA  NC_003295  3277704  3279237  1534  16S ribosomal RNA    unclonable  3.56691e-06  normal  0.21036  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RS05737  rRNA  NC_003295  1532714  1534226  1513  16S ribosomal RNA    unclonable  2.27304e-06  normal  0.62291  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc1071  CDS  NC_003295  1123491  1125455  1965  excinuclease ABC subunit C  NP_519192  unclonable  5.38512e-06  normal  0.216036  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc1072  CDS  NC_003295  1125524  1126099  576  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase transmembrane protein  NP_519193  unclonable  7.40122e-08  normal  0.224002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc1777  CDS  NC_003295  1912903  1913730  828  putative lipoprotein transmembrane  NP_519898  unclonable  2.94533e-07  normal  0.702706  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc1779  CDS  NC_003295  1914456  1916150  1695  activation/secretion signal peptide protein  NP_519900  unclonable  3.46081e-06  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc2153  CDS  NC_003295  2335348  2337555  2208  bifunctional (P)ppGpp synthetase II/guanosine-3',5'-bisdiphosphate 3'-pyrophosphohydrolase  NP_520274  unclonable  5.22394e-06  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc2872  CDS  NC_003295  3101636  3102412  777  enoyl-CoA hydratase  NP_520993  unclonable  3.38858e-07  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc3012  CDS  NC_003295  3235554  3235970  417  50S ribosomal protein L16  NP_521133  unclonable  5.99816e-08  normal  0.0124022  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc3016  CDS  NC_003295  3237414  3238244  831  50S ribosomal protein L2  NP_521137  unclonable  2.36322e-07  decreased coverage  0.00250234  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSc3021  CDS  NC_003295  3240561  3241751  1191  elongation factor Tu  NP_521142  unclonable  5.42381e-07  hitchhiker  0.00818484  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
RSp0002  CDS  NC_003296  3120  3323  204  cold shock-like transcription regulator protein  NP_521563  unclonable  1.06276e-08  normal  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>