9 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bxe_B1413  CDS  NC_007952  1807808  1808947  1140  OmpC family outer membrane porin  YP_553901  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B1778  CDS  NC_007952  1403487  1404239  753  TetR family transcriptional regulator  YP_553540  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B1779  CDS  NC_007952  1401802  1403364  1563  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  YP_553539  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B1780  CDS  NC_007952  1400131  1401396  1266  hypothetical protein  YP_553538  normal  0.191917  unclonable  0.000000000954447  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B1781  CDS  NC_007952  1398852  1399925  1074  hypothetical protein  YP_553537  normal  0.568147  unclonable  0.000000000964145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B1939  CDS  NC_007952  1226678  1228015  1338  hypothetical protein  YP_553386  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B2569  CDS  NC_007952  536715  538712  1998  sigma 70 (RpoD)  YP_552774  unclonable  0.000000000000108997  normal  0.136917  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B2570  CDS  NC_007952  536002  536478  477  hypothetical protein  YP_552773  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B2633  CDS  NC_007952  448829  449851  1023  ATPase  YP_552710  unclonable  4.839220000000001e-18  decreased coverage  0.0000000173501  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>