35 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bxe_A0271  CDS  NC_007951  4571480  4572349  870  oxidoreductase  YP_560714  hitchhiker  0.00375643  unclonable  7.1713e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0272  CDS  NC_007951  4570681  4571316  636  amino acid efflux pump, RhtB family protein  YP_560713  hitchhiker  3.37597e-11  unclonable  6.35897e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0273  CDS  NC_007951  4569585  4570409  825  OmpW family outer membrane porin  YP_560712  decreased coverage  1.2547e-12  unclonable  7.09917e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0274  CDS  NC_007951  4568168  4569412  1245  putative lipoprotein  YP_560711  hitchhiker  3.83725e-06  unclonable  8.93699e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0275  CDS  NC_007951  4566637  4568070  1434  putative lipoprotein  YP_560710  normal  0.108025  unclonable  1.13662e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A0606  CDS  NC_007951  4208590  4209015  426  hypothetical protein  YP_560380  unclonable  9.51223e-16  normal  0.258453  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A1062  CDS  NC_007951  3716209  3719499  3291  ribonuclease E  YP_559937  unclonable  5.80995e-06  normal  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A2407  CDS  NC_007951  2248903  2249211  309  hypothetical protein  YP_558614  unclonable  1.45083e-16  normal  0.247033  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A3034  CDS  NC_007951  1553335  1556124  2790  putative diguanylate cyclase (GGDEF)/ phosphodiesterase (EAL) with PAS/PAC and Chase sensors  YP_557997  normal  0.124331  unclonable  3.56382e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A3035  CDS  NC_007951  1552535  1553329  795  hypothetical protein  YP_557996  decreased coverage  0.000133593  unclonable  2.11782e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A3036  CDS  NC_007951  1552178  1552492  315  hypothetical protein  YP_557995  decreased coverage  7.33888e-06  unclonable  1.68193e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A3037  CDS  NC_007951  1551606  1551917  312  hypothetical protein  YP_557994  hitchhiker  0.00050413  unclonable  1.68193e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A3038  CDS  NC_007951  1550785  1551609  825  putative exported phospholipase, patatin-like  YP_557993  hitchhiker  0.000229451  unclonable  1.99426e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A3039  CDS  NC_007951  1550339  1550788  450  hypothetical protein  YP_557992  hitchhiker  0.000469034  unclonable  1.5212e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A3040  CDS  NC_007951  1548988  1549551  564  hypothetical protein  YP_557991  hitchhiker  0.00105479  unclonable  1.5212e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A3041  CDS  NC_007951  1548524  1548919  396  hypothetical protein  YP_557990  hitchhiker  0.000456255  unclonable  1.37568e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A3042  CDS  NC_007951  1547326  1548378  1053  hypothetical protein  YP_557989  hitchhiker  0.000432068  unclonable  1.93512e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A4477  CDS  NC_007951  4880137  4880679  543  putative acetyltransferase  YP_561006  normal  unclonable  1.38966e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A4478  CDS  NC_007951  4879346  4879684  339  hypothetical protein  YP_561005  normal  unclonable  1.14817e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A4479  CDS  NC_007951  4877338  4879071  1734  dihydroxy-acid dehydratase  YP_561004  normal  0.261735  unclonable  2.11782e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A4480  CDS  NC_007951  4876168  4876722  555  hypothetical protein  YP_561003  hitchhiker  1.79703e-11  unclonable  1.43245e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A4481  CDS  NC_007951  4875694  4876119  426  putative lactoylglutathione lyase  YP_561002  hitchhiker  2.98655e-14  unclonable  1.33457e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A4482  CDS  NC_007951  4874081  4875286  1206  AraC family transcriptional regulator  YP_561001  hitchhiker  2.21745e-09  unclonable  1.5212e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A4483    NC_007951  4873167  4873820  654      hitchhiker  0.000465476  unclonable  1.09181e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A4484  CDS  NC_007951  4871281  4872897  1617  glutamate--cysteine ligase  YP_561000  normal  0.0203665  unclonable  1.38966e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_A4485  CDS  NC_007951  4870559  4871188  630  hypothetical protein  YP_560999  hitchhiker  0.00287296  unclonable  9.02781e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B1413  CDS  NC_007952  1807808  1808947  1140  OmpC family outer membrane porin  YP_553901  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B1778  CDS  NC_007952  1403487  1404239  753  TetR family transcriptional regulator  YP_553540  normal  0.677686  unclonable  6.27047e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B1779  CDS  NC_007952  1401802  1403364  1563  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  YP_553539  normal  0.38448  unclonable  1.16602e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B1780  CDS  NC_007952  1400131  1401396  1266  hypothetical protein  YP_553538  normal  0.191917  unclonable  9.54447e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B1781  CDS  NC_007952  1398852  1399925  1074  hypothetical protein  YP_553537  normal  0.568147  unclonable  9.64145e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B1939  CDS  NC_007952  1226678  1228015  1338  hypothetical protein  YP_553386  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B2569  CDS  NC_007952  536715  538712  1998  sigma 70 (RpoD)  YP_552774  unclonable  1.08997e-13  normal  0.136917  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B2570  CDS  NC_007952  536002  536478  477  hypothetical protein  YP_552773  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Bxe_B2633  CDS  NC_007952  448829  449851  1023  ATPase  YP_552710  unclonable  4.83922e-18  decreased coverage  1.73501e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>