19 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Rxyl_0002  CDS  NC_008148  1853  2980  1128  DNA polymerase III, beta subunit  YP_642795  unclonable  4.18991e-07  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0399  CDS  NC_008148  427722  428930  1209  ROK domain-containing protein  YP_643186  unclonable  1.18651e-06  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0403  CDS  NC_008148  432980  434635  1656  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  YP_643190  unclonable  4.92986e-06  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
 
Rxyl_0575  CDS  NC_008148  604020  605459  1440  Na+/solute symporter  YP_643359  unclonable  2.27559e-06  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0576  CDS  NC_008148  605484  607013  1530  histidine ammonia-lyase  YP_643360  unclonable  2.03792e-06  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0676  CDS  NC_008148  708568  711228  2661  ATPase AAA-2  YP_643458  unclonable  0.000220966  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_0814  CDS  NC_008148  847856  849478  1623  chaperonin GroEL  YP_643594  unclonable  3.01367e-06  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_1008  CDS  NC_008148  1044367  1045236  870  RNA polymerase, sigma 28 subunit  YP_643786  unclonable  1.00967e-07  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_1028  CDS  NC_008148  1062650  1063342  693  GntR family transcriptional regulator  YP_643806  unclonable  1.04073e-07  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_1398  CDS  NC_008148  1421168  1422088  921  SSU ribosomal protein S2P  YP_644172  unclonable  1.84086e-07  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_1619  CDS  NC_008148  1643340  1644779  1440  beta-lactamase-like protein  YP_644392  unclonable  1.99695e-06  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_1756  CDS  NC_008148  1782856  1783803  948  phenylacetic acid catabolic  YP_644527  unclonable  3.67689e-07  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_2230  CDS  NC_008148  2239015  2240640  1626  hypothetical protein  YP_644981  unclonable  3.61135e-06  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_2698  CDS  NC_008148  2713179  2713667  489  hypothetical protein  YP_645427  unclonable  1.76947e-08  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_2699  CDS  NC_008148  2713901  2714449  549  hypothetical protein  YP_645428  unclonable  2.77762e-08  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_2700  CDS  NC_008148  2714618  2715130  513  hypothetical protein  YP_645429  unclonable  1.8428e-08  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
 
Rxyl_3031    NC_008148  3038739  3040011  1273      unclonable  1.7706e-06  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_3183  CDS  NC_008148  3195659  3196039  381  glycine cleavage system protein H  YP_645900  unclonable  1.82392e-08  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Rxyl_3190  CDS  NC_008148  3202639  3203247  609  TetR family transcriptional regulator  YP_645907  unclonable  5.48437e-08  n/a    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>