131 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Moth_0006  CDS  NC_007644  4494  4745  252  YaaB  YP_428889  hitchhiker  1.8271e-13  unclonable  5.24609e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0007  CDS  NC_007644  4828  6732  1905  DNA gyrase, B subunit  YP_428890  unclonable  3.28066e-10  unclonable  1.30354e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0008  CDS  NC_007644  6840  9284  2445  DNA gyrase, A subunit  YP_428891  hitchhiker  2.66151e-07  unclonable  1.53333e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0009  CDS  NC_007644  9450  10340  891  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  YP_428892  unclonable  2.32044e-13  unclonable  7.88382e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0010  CDS  NC_007644  10357  10923  567  glutamine amidotransferase subunit PdxT  YP_428893  unclonable  2.00223e-14  unclonable  6.68451e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0011  CDS  NC_007644  11247  12023  777  DeoR family transcriptional regulator  YP_428894  hitchhiker  4.25621e-12  unclonable  6.68451e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0012  CDS  NC_007644  12177  13103  927  1-phosphofructokinase  YP_428895  hitchhiker  0.00179205  unclonable  6.7569e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0013  CDS  NC_007644  13155  14543  1389  PTS fructose IIC component  YP_428896  normal  0.991255  unclonable  8.38432e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0081  CDS  NC_007644  80294  83845  3552  transcription-repair coupling factor  YP_428963  unclonable  8.83466e-06  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0151  CDS  NC_007644  145599  146081  483  GreA/GreB family elongation factor  YP_429032  unclonable  4.4733e-14  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0152  CDS  NC_007644  146086  147555  1470  lysyl-tRNA synthetase  YP_429033  unclonable  1.6249e-11  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0320  CDS  NC_007644  323855  324847  993  hypothetical protein  YP_429197  unclonable  1.62998e-12  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0354  CDS  NC_007644  361206  361517  312  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  YP_429231  unclonable  4.96217e-15  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0355  CDS  NC_007644  361600  361989  390  hypothetical protein  YP_429232  unclonable  1.09588e-14  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0356  CDS  NC_007644  362044  362301  258  hypothetical protein  YP_429233  unclonable  4.26443e-15  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0357  CDS  NC_007644  362392  363306  915  hypothetical protein  YP_429234  unclonable  4.11599e-13  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0358  CDS  NC_007644  363360  364346  987  TOPRIM  YP_429235  unclonable  8.14037e-13  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0359  CDS  NC_007644  364346  364771  426  hypothetical protein  YP_429236  unclonable  1.48101e-14  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0368  CDS  NC_007644  373185  374132  948  radical SAM family protein  YP_429245  unclonable  7.43683e-13  normal  0.888767  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0369  CDS  NC_007644  374298  374618  321  hypothetical protein  YP_429246  unclonable  1.1297e-14  normal  0.796638  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0370  CDS  NC_007644  374694  375770  1077  hypothetical protein  YP_429247  unclonable  1.896e-12  normal  0.85834  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0460  CDS  NC_007644  462427  463650  1224  amidohydrolase  YP_429334  unclonable  7.69094e-12  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0545  CDS  NC_007644  567441  567725  285  chaperonin Cpn10  YP_429418  unclonable  5.54341e-15  normal  0.812353  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0636  CDS  NC_007644  660565  661188  624  hypothetical protein  YP_429507  unclonable  8.49999e-14  normal  0.67929  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0637  CDS  NC_007644  661205  661660  456  hypothetical protein  YP_429508  unclonable  4.0867e-14  normal  0.628215  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0677    NC_007644  712122  712657  536      normal  0.0718829  unclonable  9.02023e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0678  CDS  NC_007644  712782  713054  273  hypothetical protein  YP_429545  hitchhiker  0.00905652  unclonable  8.927e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0679  CDS  NC_007644  713026  713502  477  PilT protein-like  YP_429546  hitchhiker  0.000163156  unclonable  1e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0680    NC_007644  713637  714045  409      hitchhiker  1.36443e-05  unclonable  9.49749e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0681  CDS  NC_007644  714122  715036  915  hypothetical protein  YP_429547  decreased coverage  5.73749e-09  unclonable  1.26403e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0682    NC_007644  715166  715396  231      hitchhiker  4.02717e-11  unclonable  7.71875e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0683    NC_007644  715490  715828  339      hitchhiker  4.36933e-10  unclonable  8.83474e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0684    NC_007644  715863  715994  132      hitchhiker  9.67104e-10  unclonable  7.71875e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0685  CDS  NC_007644  716184  716645  462  PilT protein-like  YP_429548  hitchhiker  5.32303e-09  unclonable  8.04933e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0686  CDS  NC_007644  716633  716881  249  AbrB family transcriptional regulator  YP_429549  hitchhiker  1.29659e-09  unclonable  7.33097e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0687  CDS  NC_007644  717360  717638  279  AbrB family transcriptional regulator  YP_429550  hitchhiker  6.8736e-07  unclonable  7.33097e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0688  CDS  NC_007644  717626  718024  399  PilT protein-like  YP_429551  hitchhiker  3.01762e-05  unclonable  7.41036e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0689  CDS  NC_007644  718273  720783  2511  putative PAS/PAC sensor protein  YP_429552  normal  unclonable  2.35898e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0690  CDS  NC_007644  720787  721917  1131  hypothetical protein  YP_429553  normal  unclonable  8.47515e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0691    NC_007644  722267  722485  219      normal  unclonable  5.4623e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0692  CDS  NC_007644  722654  723466  813  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  YP_429554  normal  0.370043  unclonable  8.38432e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0693  CDS  NC_007644  723477  723749  273  hypothetical protein  YP_429555  normal  0.0259681  unclonable  6.47947e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0694  CDS  NC_007644  723881  724798  918  copper amine oxidase-like  YP_429556  hitchhiker  3.51561e-09  unclonable  8.47515e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0695  CDS  NC_007644  724996  725544  549  hypothetical protein  YP_429557  unclonable  4.04448e-14  unclonable  6.54962e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0712  CDS  NC_007644  744737  745060  324  hypothetical protein  YP_429573  unclonable  2.06479e-14  normal  0.0234563  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0713  CDS  NC_007644  745291  745521  231  hypothetical protein  YP_429574  unclonable  1.5115e-14  normal  0.0462479  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0728  CDS  NC_007644  760006  761391  1386  gluconate transporter  YP_429589  unclonable  1.79796e-11  normal  0.654044  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0730  CDS  NC_007644  763200  763928  729  hypothetical protein  YP_429591  unclonable  1.95615e-13  normal  0.756936  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0731  CDS  NC_007644  763971  764642  672  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold  YP_429592  unclonable  1.73292e-13  normal  0.767242  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0732  CDS  NC_007644  764782  765186  405  CopG family transcriptional regulator  YP_429593  unclonable  2.57489e-14  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0818  CDS  NC_007644  847469  848473  1005  Sodium/calcium exchanger membrane region  YP_429678  unclonable  1.51799e-12  hitchhiker  0.00227124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0828  CDS  NC_007644  858289  860103  1815  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_429688  unclonable  1.97924e-10  normal  0.403449  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0829  CDS  NC_007644  860096  860341  246  hypothetical protein  YP_429689  unclonable  2.74329e-15  normal  0.31982  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0863  CDS  NC_007644  893177  895969  2793  isoleucyl-tRNA synthetase  YP_429723  unclonable  1.47898e-07  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0895  CDS  NC_007644  928760  930145  1386  gluconate transporter  YP_429755  unclonable  9.13428e-12  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_0970  CDS  NC_007644  1000589  1001341  753  tRNA (Guanine37-N1) methyltransferase  YP_429828  unclonable  4.32871e-13  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1015  CDS  NC_007644  1044323  1044577  255  hypothetical protein  YP_429872  normal  0.0488798  unclonable  2.81238e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1016  CDS  NC_007644  1044869  1045555  687  catalase  YP_429873  hitchhiker  0.00169796  unclonable  3.43768e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1017  CDS  NC_007644  1046255  1046518  264  plasmid stabilization system protein  YP_429874  unclonable  5.94765e-15  unclonable  2.72717e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1018  CDS  NC_007644  1047209  1047505  297  hypothetical protein  YP_429875  hitchhiker  2.0687e-09  unclonable  2.75563e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1019  CDS  NC_007644  1047621  1049006  1386  hypothetical protein  YP_429876  hitchhiker  5.06367e-06  unclonable  5.14024e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1020  CDS  NC_007644  1049293  1049538  246  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  YP_429877  hitchhiker  3.68524e-05  unclonable  2.95771e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1021  CDS  NC_007644  1049532  1049879  348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  YP_429878  hitchhiker  3.10459e-05  unclonable  3.57935e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1022  CDS  NC_007644  1050230  1051759  1530  Mg chelatase-related protein  YP_429879  hitchhiker  0.00111662  unclonable  7.80236e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1023  CDS  NC_007644  1051913  1052437  525  hypothetical protein  YP_429880  hitchhiker  0.00017517  unclonable  4.37518e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1024  CDS  NC_007644  1052627  1053727  1101  Iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_429881  hitchhiker  0.00115837  unclonable  6.47947e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1025  CDS  NC_007644  1053899  1054984  1086  DNA processing protein DprA, putative  YP_429882  hitchhiker  0.00128425  unclonable  6.96536e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1026  CDS  NC_007644  1054994  1057087  2094  DNA topoisomerase I  YP_429883  hitchhiker  0.00786254  unclonable  1.08626e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1027  CDS  NC_007644  1057108  1058421  1314  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase Gid  YP_429884  normal  0.395957  unclonable  7.25242e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1028  CDS  NC_007644  1058475  1059416  942  tyrosine recombinase XerD subunit  YP_429885  hitchhiker  0.00856798  unclonable  6.34873e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1029  CDS  NC_007644  1059426  1059950  525  ATP-dependent protease peptidase subunit  YP_429886  hitchhiker  2.58699e-05  unclonable  4.8858e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1030  CDS  NC_007644  1059970  1061355  1386  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  YP_429887  unclonable  2.55655e-11  unclonable  9.59668e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1031  CDS  NC_007644  1061371  1062159  789  transcriptional repressor CodY  YP_429888  unclonable  4.37393e-13  unclonable  9.3058e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1032  CDS  NC_007644  1062353  1063069  717  SSU ribosomal protein S2P  YP_429889  unclonable  2.05725e-13  unclonable  1.05333e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1033  CDS  NC_007644  1063160  1063771  612  elongation factor Ts  YP_429890  hitchhiker  4.8083e-11  unclonable  9.11443e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1034  CDS  NC_007644  1063877  1064599  723  uridylate kinase  YP_429891  hitchhiker  1.15262e-06  unclonable  1e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1035  CDS  NC_007644  1064599  1065156  558  ribosome recycling factor  YP_429892  hitchhiker  4.62528e-05  unclonable  1.05333e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1036  CDS  NC_007644  1065159  1065368  210  hypothetical protein  YP_429893  hitchhiker  6.78641e-05  unclonable  8.04933e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1037  CDS  NC_007644  1065386  1065556  171  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  YP_429894  hitchhiker  0.000342317  unclonable  7.88382e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1038  CDS  NC_007644  1065620  1066399  780  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  YP_429895  hitchhiker  0.000636163  unclonable  1.15387e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1039  CDS  NC_007644  1066418  1067206  789  phosphatidate cytidylyltransferase  YP_429896  hitchhiker  0.00281126  unclonable  1.16593e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1040  CDS  NC_007644  1067225  1068325  1101  hypothetical protein  YP_429897  hitchhiker  0.00428171  unclonable  1.29007e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1041  CDS  NC_007644  1068326  1069483  1158  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  YP_429898  normal  unclonable  1.3997e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1042  CDS  NC_007644  1069558  1070568  1011  peptidase RseP  YP_429899  normal  unclonable  1.3997e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1043  CDS  NC_007644  1070579  1071658  1080  4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl diphosphate synthase  YP_429900  normal  unclonable  1.30354e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1044  CDS  NC_007644  1071961  1073682  1722  prolyl-tRNA synthetase  YP_429901  normal  unclonable  1.9894e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1045  CDS  NC_007644  1073699  1077343  3645  DNA polymerase III, alpha subunit  YP_429902  normal  0.0186954  unclonable  5.41415e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1046  CDS  NC_007644  1077532  1078008  477  hypothetical protein  YP_429903  hitchhiker  7.08313e-08  unclonable  8.57031e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1047  CDS  NC_007644  1078015  1079103  1089  NusA antitermination factor  YP_429904  unclonable  1.54988e-12  unclonable  1.37146e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1048  CDS  NC_007644  1079106  1079387  282  hypothetical protein  YP_429905  unclonable  4.86204e-15  unclonable  9.11443e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1049  CDS  NC_007644  1079380  1079688  309  50S ribosomal protein L7AE  YP_429906  unclonable  6.77595e-15  unclonable  1.01124e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1050  CDS  NC_007644  1079707  1082418  2712  translation initiation factor 2  YP_429907  unclonable  1.07022e-07  unclonable  3.03018e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1116  CDS  NC_007644  1145222  1145476  255  RNA-binding protein Hfq  YP_429973  unclonable  5.43156e-15  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1180  CDS  NC_007644  1211436  1212239  804  IclR family transcriptional regulator  YP_430037  unclonable  2.86827e-13  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1209  CDS  NC_007644  1247606  1249036  1431  methanol:corrinoid methyltransferase  YP_430066  unclonable  5.96998e-11  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1262  CDS  NC_007644  1306526  1307569  1044  LacI family transcription regulator  YP_430119  unclonable  3.50604e-12  unclonable  1.18995e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1263  CDS  NC_007644  1307674  1308066  393  hypothetical protein  YP_430120  hitchhiker  1.91336e-12  unclonable  9.79436e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1332  CDS  NC_007644  1378015  1379322  1308  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  YP_430188  unclonable  3.20048e-12  normal  0.085361  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1413  CDS  NC_007644  1457799  1458191  393  hypothetical protein  YP_430269  unclonable  2.02313e-14  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Moth_1414  CDS  NC_007644  1458303  1459580  1278  hypothetical protein  YP_430270  unclonable  9.41621e-12  normal  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>