94 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
GBAA_0093  CDS  NC_007530  102990  103646  657  RNA polymerase factor sigma-70  YP_016697  unclonable  6.56402e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0094  CDS  NC_007530  103778  103924  147  50S ribosomal protein L33  YP_022517  unclonable  1.5203e-14  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0095  CDS  NC_007530  103957  104136  180  preprotein translocase subunit SecE  YP_016698  unclonable  2.33788e-14  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0096  CDS  NC_007530  104268  104801  534  transcription antitermination protein NusG  YP_016699  unclonable  4.57799e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0097  CDS  NC_007530  104969  105394  426  50S ribosomal protein L11  YP_016700  unclonable  2.83134e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0098  CDS  NC_007530  105572  106264  693  50S ribosomal protein L1  YP_016701  unclonable  2.05875e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0099  CDS  NC_007530  106497  106997  501  50S ribosomal protein L10  YP_016703  unclonable  7.18586e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0107  CDS  NC_007530  117180  119258  2079  elongation factor G  YP_016712  unclonable  3.92838e-08  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0108  CDS  NC_007530  119376  120563  1188  elongation factor Tu  YP_016713  unclonable  5.87402e-11  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0109  CDS  NC_007530  120962  121270  309  30S ribosomal protein S10  YP_016714  unclonable  2.09715e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0110  CDS  NC_007530  121305  121937  633  50S ribosomal protein L3  YP_016715  unclonable  2.46604e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0111  CDS  NC_007530  121963  122586  624  50S ribosomal protein L4  YP_016716  unclonable  1.63463e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0112  CDS  NC_007530  122586  122876  291  50S ribosomal protein L23  YP_016717  unclonable  1.56815e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0113  CDS  NC_007530  122905  123735  831  50S ribosomal protein L2  YP_016718  unclonable  5.12601e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0114  CDS  NC_007530  123796  124074  279  30S ribosomal protein S19  YP_016719  unclonable  1.18397e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0115  CDS  NC_007530  124092  124433  342  50S ribosomal protein L22  YP_016720  unclonable  1.6654e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0116  CDS  NC_007530  124437  125096  660  30S ribosomal protein S3  YP_016721  unclonable  1.65133e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0132  CDS  NC_007530  132147  132893  747  methionine aminopeptidase  YP_016737  unclonable  3.83298e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0133  CDS  NC_007530  132962  133180  219  translation initiation factor IF-1  YP_016738  unclonable  7.69266e-14  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0134  CDS  NC_007530  133216  133329  114  50S ribosomal protein L36  YP_016739  unclonable  3.70464e-14  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0336  CDS  NC_007530  346049  346561  513  hypothetical protein  YP_016952  unclonable  6.56402e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0371  CDS  NC_007530  384056  385720  1665  glycosyl hydrolase family protein  YP_016991  unclonable  2.36448e-09  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0543  CDS  NC_007530  541339  542115  777  penicillin-binding domain-containing protein  YP_017165  unclonable  2.16504e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0677  CDS  NC_007530  695145  695996  852  phospholipase C  YP_017306  unclonable  6.5254e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0689  CDS  NC_007530  706192  707577  1386  proton/peptide symporter family protein  YP_017318  unclonable  1.79263e-10  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0724  CDS  NC_007530  750669  751829  1161  M23/37 family peptidase  YP_017357  unclonable  7.54893e-11  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_0898  CDS  NC_007530  912754  914343  1590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_017533  unclonable  1.40449e-09  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1161  CDS  NC_007530  1132149  1132370  222  hypothetical protein  YP_022562  unclonable  1.03911e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1246  CDS  NC_007530  1200812  1202290  1479  sodium/proline symporter family protein  YP_017861  unclonable  7.09794e-10  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1247  CDS  NC_007530  1202582  1202770  189  hypothetical protein  YP_017862  unclonable  5.10263e-14  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1449  CDS  NC_007530  1371750  1373003  1254  M23/37 family peptidase  YP_018073  unclonable  1.28519e-10  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1450  CDS  NC_007530  1373496  1374767  1272  proton/glutamate symporter family protein  YP_018074  unclonable  2.73308e-10  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1500  CDS  NC_007530  1420974  1421588  615  M23/37 family peptidase  YP_018123  unclonable  1.18576e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1503  CDS  NC_007530  1423689  1423937  249  ferredoxin  YP_018126  unclonable  8.00797e-14  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1506  CDS  NC_007530  1426816  1427379  564  CAAX amino terminal protease family protein  YP_018129  unclonable  1.77137e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1507  CDS  NC_007530  1427402  1427881  480  lysm domain-containing protein  YP_018130  unclonable  1.23436e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1817  CDS  NC_007530  1700956  1702200  1245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_018454  unclonable  7.25042e-11  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1897  CDS  NC_007530  1781019  1781249  231  hypothetical protein  YP_018540  unclonable  6.17246e-14  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1898  CDS  NC_007530  1781497  1782414  918  hypothetical protein  YP_018541  unclonable  1.29159e-11  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1903  CDS  NC_007530  1788067  1789761  1695  M23/37 family peptidase  YP_018546  unclonable  4.02629e-09  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_1995  CDS  NC_007530  1877117  1878277  1161  protease  YP_018641  unclonable  7.62612e-11  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2165  CDS  NC_007530  2017833  2018564  732  hypothetical protein  YP_018808  unclonable  6.08319e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2186  CDS  NC_007530  2039610  2040908  1299  aspartyl-tRNA synthetase  YP_018827  unclonable  1.72174e-10  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2251  CDS  NC_007530  2099601  2101502  1902  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  YP_018897  unclonable  1.60892e-08  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2484  CDS  NC_007530  2311483  2311890  408  hypothetical protein  YP_019123  unclonable  9.39903e-14  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2528  CDS  NC_007530  2351179  2352411  1233  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_019166  unclonable  5.64272e-11  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2814  CDS  NC_007530  2607908  2609977  2070  uvrD/Rep helicase family protein  YP_019456  unclonable  1.83326e-08  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2944  CDS  NC_007530  2708767  2709594  828  polysaccharide deacetylase  YP_019585  unclonable  5.17931e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2997  CDS  NC_007530  2764500  2765249  750  IclR family transcriptional regulator  YP_019640  unclonable  5.12601e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_2998  CDS  NC_007530  2765517  2766941  1425  amino acid permease family protein  YP_019641  unclonable  3.37351e-10  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3595  CDS  NC_007530  3299990  3300880  891  BNR repeat-containing protein  YP_020230  unclonable  2.8959e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3596  CDS  NC_007530  3300906  3301349  444  flavodoxin  YP_020231  unclonable  2.03482e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3597  CDS  NC_007530  3301491  3302111  621  hypothetical protein  YP_020232  unclonable  1.13907e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3742  CDS  NC_007530  3442945  3443166  222  hypothetical protein  YP_020380  unclonable  9.39903e-14  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3766  CDS  NC_007530  3460577  3460801  225  hypothetical protein  YP_022656  unclonable  1.41795e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3767  CDS  NC_007530  3460862  3461794  933  prophage lambdaba01, n-acetylmuramoyl-l-alanine amidase family protein 2  YP_020403  unclonable  1.74527e-11  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3799  CDS  NC_007530  3484566  3485549  984  hypothetical protein  YP_020431  unclonable  1.57836e-11  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3858  CDS  NC_007530  3530610  3530882  273  DNA-binding protein HU  YP_020495  unclonable  5.87043e-14  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3915  intron  NC_007530  3590395  3591753  1359      unclonable  1.62036e-10  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3936  CDS  NC_007530  3612602  3613834  1233  aspartate kinase I  YP_020576  unclonable  1.18555e-10  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3966  CDS  NC_007530  3643254  3644033  780  transcriptional repressor CodY  YP_020605  unclonable  2.07979e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3977  CDS  NC_007530  3655622  3656173  552  signal peptidase I S  YP_020616  unclonable  8.43557e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3978  CDS  NC_007530  3656275  3656619  345  50S ribosomal protein L19  YP_020617  unclonable  1.47607e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3979  CDS  NC_007530  3656766  3657500  735  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_020618  unclonable  2.80936e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3980  CDS  NC_007530  3657500  3658015  516  16S rRNA-processing protein RimM  YP_020619  unclonable  7.4804e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3981  CDS  NC_007530  3658136  3658363  228  kh domain-containing protein  YP_020620  unclonable  1.03911e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3982  CDS  NC_007530  3658378  3658650  273  30S ribosomal protein S16  YP_020621  unclonable  1.52128e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3983  CDS  NC_007530  3658751  3660100  1350  signal recognition particle protein  YP_020622  unclonable  4.08298e-10  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3995  CDS  NC_007530  3673805  3674167  363  hypothetical protein  YP_020635  unclonable  1.07112e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_3996  CDS  NC_007530  3674546  3674734  189  50S ribosomal protein L28  YP_020636  unclonable  3.59454e-14  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4042  CDS  NC_007530  3720723  3721502  780  sporulation sigma factor SigG  YP_020684  unclonable  3.07551e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4376  CDS  NC_007530  3991199  3991978  780  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  YP_021021  unclonable  1.39221e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4399  CDS  NC_007530  4014176  4015015  840  hemolysin A  YP_021043  unclonable  7.82309e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4469  CDS  NC_007530  4063442  4064836  1395  sodium:dicarboxylate symporter family protein  YP_021112  unclonable  1.72174e-10  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4509  CDS  NC_007530  4102271  4103581  1311  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  YP_021153  unclonable  1.63692e-10  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4515  CDS  NC_007530  4108345  4109466  1122  RNA polymerase sigma factor RpoD  YP_021160  unclonable  3.15443e-11  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4538  CDS  NC_007530  4126334  4127449  1116  chaperone protein DnaJ  YP_021184  unclonable  3.45209e-11  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4630  CDS  NC_007530  4206590  4207357  768  hesA/moeB/thiF family protein  YP_021278  unclonable  4.45557e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4819  CDS  NC_007530  4380762  4381322  561  translation initiation factor IF-3  YP_021465  unclonable  6.90292e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4825  CDS  NC_007530  4388318  4388710  393  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  YP_021471  unclonable  1.34857e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4826  CDS  NC_007530  4388865  4388999  135  hypothetical protein  YP_022703  unclonable  2.11504e-14  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_4827  CDS  NC_007530  4389091  4390119  1029  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  YP_021472  unclonable  2.7958e-11  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_5298  CDS  NC_007530  4799621  4800802  1182  NupC family nucleoside transporter  YP_021956  unclonable  7.10562e-11  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_5301  CDS  NC_007530  4804400  4805830  1431  sodium/alanine symporter family protein  YP_021959  unclonable  2.12742e-10  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_5345  CDS  NC_007530  4844804  4845433  630  hypothetical protein  YP_022003  unclonable  1.40645e-12  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_5508  CDS  NC_007530  4995230  4995664  435  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  YP_022174  unclonable  4.39699e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_5564  CDS  NC_007530  5050590  5050976  387  hypothetical protein  YP_022232  unclonable  1.97435e-13  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_5668  CDS  NC_007530  5152193  5153392  1200  major facilitator family transporter  YP_022348  unclonable  4.80591e-11  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_5716  CDS  NC_007530  5207311  5208600  1290  adenylosuccinate synthetase  YP_022402  unclonable  1.88586e-10  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_5717  CDS  NC_007530  5208816  5210177  1362  replicative DNA helicase  YP_022403  unclonable  2.93177e-10  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
GBAA_pXO1_0199  CDS  NC_007322  166698  167747  1050  hypothetical protein  YP_022460  unclonable  1.32696e-32  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
tRNA-Arg-3  tRNA  NC_007530  4287628  4287704  77  tRNA-Arg    unclonable  1.37515e-14  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
tRNA-Gln-2  tRNA  NC_007530  245551  245625  75  tRNA-Gln    unclonable  1.06014e-14  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
tRNA-Gly-6  tRNA  NC_007530  4287706  4287779  74  tRNA-Gly    unclonable  1.46044e-14  n/a    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>