107 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BAS0087  CDS  NC_005945  97324  98781  +  1458  glutamyl-tRNA synthetase  YP_026373  unclonable  0.0000000457939  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0093  CDS  NC_005945  102991  103647  +  657  RNA polymerase factor sigma-70  YP_026379  unclonable  0.00000000000966245  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0104  CDS  NC_005945  115655  115936  +  282  hypothetical protein  YP_026390  unclonable  0.000000000000573275  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0105  CDS  NC_005945  116051  116473  +  423  30S ribosomal protein S12  YP_026391  unclonable  0.00000000000228293  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0107  CDS  NC_005945  117181  119259  +  2079  elongation factor G  YP_026393  unclonable  0.0000647757  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0108  CDS  NC_005945  119377  120564  +  1188  elongation factor Tu  YP_026394  unclonable  0.00000000780653  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0109  CDS  NC_005945  120963  121271  +  309  30S ribosomal protein S10  YP_026395  unclonable  0.000000000000428723  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0110  CDS  NC_005945  121306  121938  +  633  50S ribosomal protein L3  YP_026396  unclonable  0.00000000000986131  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0111  CDS  NC_005945  121964  122587  +  624  50S ribosomal protein L4  YP_026397  unclonable  0.00000000000900585  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0112  CDS  NC_005945  122587  122877  +  291  50S ribosomal protein L23  YP_026398  unclonable  0.00000000000031737  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0113  CDS  NC_005945  122906  123736  +  831  50S ribosomal protein L2  YP_026399  unclonable  0.000000000138046  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0114  CDS  NC_005945  123797  124075  +  279  30S ribosomal protein S19  YP_026400  unclonable  0.000000000000383993  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0115  CDS  NC_005945  124093  124434  +  342  50S ribosomal protein L22  YP_026401  unclonable  0.000000000000621136  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0116  CDS  NC_005945  124438  125097  +  660  30S ribosomal protein S3  YP_026402  unclonable  0.0000000000111227  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0132  CDS  NC_005945  132148  132894  +  747  methionine aminopeptidase  YP_026418  unclonable  0.000000000101117  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0133  CDS  NC_005945  132963  133181  +  219  translation initiation factor IF-1  YP_026419  unclonable  0.000000000000219097  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0252  CDS  NC_005945  258556  258840  +  285  co-chaperonin GroES  YP_026536  unclonable  0.000000000000529101  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0321  CDS  NC_005945  346056  346574  +  519  hypothetical protein  YP_026601  unclonable  0.00000000000361969  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0358  CDS  NC_005945  385906  387543  +  1638  PTS system transporter subunit IIBC  YP_026638  unclonable  0.000000198407  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0420  CDS  NC_005945  452552  453304  +  753  hypothetical protein  YP_026700  unclonable  0.0000000000377873  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0472  CDS  NC_005945  494259  495752  +  1494  PTS system N-acetylglucosamine-specific transporter subunit IIBC  YP_026752  unclonable  0.000000118981  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0491  CDS  NC_005945  515026  516123  +  1098  A/G-specific adenine glycosylase  YP_026771  unclonable  0.00000000144393  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0512  CDS  NC_005945  541382  542158  +  777  penicillin-binding domain-containing protein  YP_026790  unclonable  0.0000000000617961  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0582  CDS  NC_005945  630295  631317  +  1023  iron compound ABC transporter permease  YP_026859  unclonable  0.000000000513454  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0613  CDS  NC_005945  662916  663473  +  558  RNA polymerase sigma factor  YP_026890  unclonable  0.0000000000144308  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0628  CDS  NC_005945  678284  679633  -  1350  glycerol-3-phosphate transporter  YP_026905  unclonable  0.0000000215527  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0655  CDS  NC_005945  706087  707472  -  1386  proton/peptide symporter family protein  YP_026932  unclonable  0.000000039773  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0690  CDS  NC_005945  750564  751724  -  1161  M24/M37 family peptidase  YP_026966  unclonable  0.00000000234103  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0842  CDS  NC_005945  899809  902397  +  2589  S-layer protein EA1  YP_027118  unclonable  0.00698001  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0851  CDS  NC_005945  912648  914237  +  1590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_027127  unclonable  0.000000657012  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1077  CDS  NC_005945  1131975  1132262  +  288  hypothetical protein  YP_027350  unclonable  0.000000000000232689  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1106  CDS  NC_005945  1159241  1160635  -  1395  MATE efflux family protein  YP_027378  unclonable  0.0000000560081  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1139  CDS  NC_005945  1190361  1191131  +  771  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  YP_027411  unclonable  0.0000000000599586  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1154  CDS  NC_005945  1200758  1202236  -  1479  sodium/proline symporter family protein  YP_027425  unclonable  0.000000094389  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1339  CDS  NC_005945  1371696  1372949  -  1254  M24/M37 family peptidase  YP_027608  unclonable  0.00000000501622  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1363  CDS  NC_005945  1392753  1394774  +  2022  penicillin-binding protein  YP_027632  unclonable  0.0000333103  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1389  CDS  NC_005945  1420920  1421534  +  615  M24/M37 family peptidase  YP_027658  unclonable  0.00000000000798303  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1390  CDS  NC_005945  1421699  1422385  -  687  hypothetical protein  YP_027659  unclonable  0.0000000000198989  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1391  CDS  NC_005945  1422935  1423513  +  579  hypothetical protein  YP_027660  unclonable  0.0000000000115789  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1392  CDS  NC_005945  1423635  1423883  -  249  ferredoxin  YP_027661  unclonable  0.00000000000036513  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1395  CDS  NC_005945  1426762  1427325  +  564  CAAX amino terminal protease family protein  YP_027664  unclonable  0.00000000000488789  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1521  CDS  NC_005945  1551467  1552630  -  1164  germination protein gerN  YP_027788  unclonable  0.00000000601236  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1626  CDS  NC_005945  1643309  1643875  +  567  RNA polymerase factor sigma-70  YP_027892  unclonable  0.0000000000238323  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1682  CDS  NC_005945  1700901  1702145  +  1245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_027948  unclonable  0.00000000845994  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1760  CDS  NC_005945  1781408  1782358  +  951  hypothetical protein  YP_028024  unclonable  0.000000000249314  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1770  CDS  NC_005945  1795811  1796503  +  693  azoreductase  YP_028034  unclonable  0.0000000000243182  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1852  CDS  NC_005945  1877061  1878221  +  1161  protease  YP_028116  unclonable  0.00000000203248  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1997  CDS  NC_005945  2002256  2004661  -  2406  nitrite reductase  YP_028260  unclonable  0.00110354  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2010  CDS  NC_005945  2015766  2017661  +  1896  ABC transporter ATP-binding protein  YP_028273  unclonable  0.00000675061  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2011  CDS  NC_005945  2017737  2018468  +  732  hypothetical protein  YP_028274  unclonable  0.0000000000505565  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2085  CDS  NC_005945  2091743  2092378  +  636  azoreductase  YP_028348  unclonable  0.0000000000156385  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2086  CDS  NC_005945  2092490  2093209  +  720  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  YP_028349  unclonable  0.0000000000321882  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2087  CDS  NC_005945  2093250  2093906  -  657  hemolysin III  YP_028350  unclonable  0.0000000000145785  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2095  CDS  NC_005945  2099505  2101406  +  1902  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  YP_028358  unclonable  0.00000747097  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2099  CDS  NC_005945  2102671  2103633  +  963  substrate-binding family protein  YP_028362  unclonable  0.000000000270129  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2351  CDS  NC_005945  2351108  2352340  +  1233  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_028612  unclonable  0.00000000872091  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2734  CDS  NC_005945  2709102  2709929  +  828  polysaccharide deacetylase  YP_028992  unclonable  0.000000000154127  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2786  CDS  NC_005945  2765843  2767279  +  1437  amino acid permease family protein  YP_029044  unclonable  0.0000000595058  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3189  CDS  NC_005945  3164247  3165944  -  1698  neutral protease  YP_029446  unclonable  0.000000741792  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3262  CDS  NC_005945  3228185  3229603  -  1419  amino acid permease family protein  YP_029519  unclonable  0.0000000532253  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3278  CDS  NC_005945  3243396  3244160  +  765  hypothetical protein  YP_029535  unclonable  0.000000000124839  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3332  CDS  NC_005945  3299105  3299950  -  846  exonuclease  YP_029589  unclonable  0.000000000115219  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3333  CDS  NC_005945  3300140  3300340  -  201  cold shock protein CspB  YP_029590  unclonable  0.0000000000000736097  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3334  CDS  NC_005945  3300557  3301456  -  900  BNR repeat-containing protein  YP_029591  unclonable  0.000000000104235  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3335  CDS  NC_005945  3301473  3301916  -  444  flavodoxin  YP_029592  unclonable  0.000000000000659666  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3336  CDS  NC_005945  3302058  3302678  -  621  hypothetical protein  YP_029593  unclonable  0.00000000000909805  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3467  CDS  NC_005945  3441636  3443387  -  1752  ABC transporter ATP-binding/permease  YP_029722  unclonable  0.00000139825  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3468  CDS  NC_005945  3443511  3443732  -  222  hypothetical protein  YP_029723  unclonable  0.000000000000142472  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3489  CDS  NC_005945  3461152  3461376  -  225  hypothetical protein  YP_029744  unclonable  0.000000000000141028  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3490  CDS  NC_005945  3461437  3462369  -  933  prophage LambdaBa01, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family protein 2  YP_029745  unclonable  0.000000000347114  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3491  CDS  NC_005945  3462369  3462794  -  426  prophage LambdaBa01, holin  YP_029746  unclonable  0.00000000000160757  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3517  CDS  NC_005945  3485142  3486125  -  984  hypothetical protein  YP_029771  unclonable  0.000000000550891  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3518  CDS  NC_005945  3486158  3486490  -  333  hypothetical protein  YP_029772  unclonable  0.000000000000729179  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3519  CDS  NC_005945  3486631  3487266  +  636  hypothetical protein  YP_029773  unclonable  0.0000000000195013  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3520  CDS  NC_005945  3487305  3487517  -  213  hypothetical protein  YP_029774  unclonable  0.000000000000290001  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3521  CDS  NC_005945  3487586  3488725  -  1140  hypothetical protein  YP_029775  unclonable  0.00000000274826  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3645  CDS  NC_005945  3606197  3608578  -  2382  stage III sporulation protein E  YP_029896  unclonable  0.00104928  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3651  CDS  NC_005945  3613170  3614402  -  1233  aspartate kinase I  YP_029902  unclonable  0.00000000595141  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3679  CDS  NC_005945  3643822  3644601  -  780  transcriptional repressor CodY  YP_029930  unclonable  0.0000000000500442  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3692  CDS  NC_005945  3657334  3658068  -  735  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_029943  unclonable  0.0000000000413535  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3693  CDS  NC_005945  3658068  3658583  -  516  16S rRNA-processing protein RimM  YP_029944  unclonable  0.00000000000284682  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3694  CDS  NC_005945  3658704  3658931  -  228  KH domain-containing protein  YP_029945  unclonable  0.000000000000170601  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3695  CDS  NC_005945  3658946  3659218  -  273  30S ribosomal protein S16  YP_029946  unclonable  0.00000000000036513  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3698  CDS  NC_005945  3661146  3662135  -  990  signal recognition particle-docking protein FtsY  YP_029949  unclonable  0.000000000493228  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3754  CDS  NC_005945  3721291  3722160  -  870  sporulation sigma factor SigG  YP_030005  unclonable  0.000000000419985  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3929  CDS  NC_005945  3879270  3880034  -  765  putative lipoprotein  YP_030179  unclonable  0.0000000000869341  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4194  CDS  NC_005945  4108719  4109840  -  1122  RNA polymerase sigma factor RpoD  YP_030442  unclonable  0.00000000145872  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4327  CDS  NC_005945  4237819  4239348  -  1530  L-aspartate oxidase  YP_030574  unclonable  0.000000167292  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4367  CDS  NC_005945  4277325  4279655  -  2331  ATP-dependent protease La 1  YP_030614  unclonable  0.000611183  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4424  CDS  NC_005945  4333916  4334890  +  975  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  YP_030671  unclonable  0.000000000518711  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4476  CDS  NC_005945  4388133  4388594  -  462  transcriptional regulator NrdR  YP_030723  unclonable  0.00000000000265338  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4477  CDS  NC_005945  4388880  4389272  -  393  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  YP_030724  unclonable  0.00000000000115529  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4886  CDS  NC_005945  4768821  4770137  -  1317  amino acid permease family protein  YP_031128  unclonable  0.0000000145673  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4922  CDS  NC_005945  4800830  4802011  -  1182  NupC family nucleoside transporter  YP_031163  unclonable  0.00000000367634  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4923  CDS  NC_005945  4802357  4803538  -  1182  NupC family nucleoside transporter  YP_031164  unclonable  0.00000000248626  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4924  CDS  NC_005945  4803835  4805274  -  1440  sodium/alanine symporter family protein  YP_031165  unclonable  0.0000000393697  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4925  CDS  NC_005945  4805609  4807039  -  1431  sodium/alanine symporter family protein  YP_031166  unclonable  0.0000000331766  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4926  CDS  NC_005945  4807322  4807960  +  639  hypothetical protein  YP_031167  unclonable  0.00000000000966245  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4966  CDS  NC_005945  4846015  4846644  -  630  hypothetical protein  YP_031206  unclonable  0.00000000000400112  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS5080  CDS  NC_005945  4957790  4958155  -  366  hypothetical protein  YP_031319  unclonable  0.000000000000473899  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>