107 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BAS0087  CDS  NC_005945  97324  98781  1458  glutamyl-tRNA synthetase  YP_026373  unclonable  4.57939e-08  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0093  CDS  NC_005945  102991  103647  657  RNA polymerase factor sigma-70  YP_026379  unclonable  9.66245e-12  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0104  CDS  NC_005945  115655  115936  282  hypothetical protein  YP_026390  unclonable  5.73275e-13  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0105  CDS  NC_005945  116051  116473  423  30S ribosomal protein S12  YP_026391  unclonable  2.28293e-12  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0107  CDS  NC_005945  117181  119259  2079  elongation factor G  YP_026393  unclonable  6.47757e-05  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0108  CDS  NC_005945  119377  120564  1188  elongation factor Tu  YP_026394  unclonable  7.80653e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0109  CDS  NC_005945  120963  121271  309  30S ribosomal protein S10  YP_026395  unclonable  4.28723e-13  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0110  CDS  NC_005945  121306  121938  633  50S ribosomal protein L3  YP_026396  unclonable  9.86131e-12  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0111  CDS  NC_005945  121964  122587  624  50S ribosomal protein L4  YP_026397  unclonable  9.00585e-12  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0112  CDS  NC_005945  122587  122877  291  50S ribosomal protein L23  YP_026398  unclonable  3.1737e-13  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0113  CDS  NC_005945  122906  123736  831  50S ribosomal protein L2  YP_026399  unclonable  1.38046e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0114  CDS  NC_005945  123797  124075  279  30S ribosomal protein S19  YP_026400  unclonable  3.83993e-13  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0115  CDS  NC_005945  124093  124434  342  50S ribosomal protein L22  YP_026401  unclonable  6.21136e-13  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0116  CDS  NC_005945  124438  125097  660  30S ribosomal protein S3  YP_026402  unclonable  1.11227e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0132  CDS  NC_005945  132148  132894  747  methionine aminopeptidase  YP_026418  unclonable  1.01117e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0133  CDS  NC_005945  132963  133181  219  translation initiation factor IF-1  YP_026419  unclonable  2.19097e-13  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0252  CDS  NC_005945  258556  258840  285  co-chaperonin GroES  YP_026536  unclonable  5.29101e-13  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0321  CDS  NC_005945  346056  346574  519  hypothetical protein  YP_026601  unclonable  3.61969e-12  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0358  CDS  NC_005945  385906  387543  1638  PTS system transporter subunit IIBC  YP_026638  unclonable  1.98407e-07  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0420  CDS  NC_005945  452552  453304  753  hypothetical protein  YP_026700  unclonable  3.77873e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0472  CDS  NC_005945  494259  495752  1494  PTS system N-acetylglucosamine-specific transporter subunit IIBC  YP_026752  unclonable  1.18981e-07  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0491  CDS  NC_005945  515026  516123  1098  A/G-specific adenine glycosylase  YP_026771  unclonable  1.44393e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0512  CDS  NC_005945  541382  542158  777  penicillin-binding domain-containing protein  YP_026790  unclonable  6.17961e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0582  CDS  NC_005945  630295  631317  1023  iron compound ABC transporter permease  YP_026859  unclonable  5.13454e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0613  CDS  NC_005945  662916  663473  558  RNA polymerase sigma factor  YP_026890  unclonable  1.44308e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0628  CDS  NC_005945  678284  679633  1350  glycerol-3-phosphate transporter  YP_026905  unclonable  2.15527e-08  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0655  CDS  NC_005945  706087  707472  1386  proton/peptide symporter family protein  YP_026932  unclonable  3.9773e-08  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0690  CDS  NC_005945  750564  751724  1161  M24/M37 family peptidase  YP_026966  unclonable  2.34103e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0842  CDS  NC_005945  899809  902397  2589  S-layer protein EA1  YP_027118  unclonable  0.00698001  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS0851  CDS  NC_005945  912648  914237  1590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_027127  unclonable  6.57012e-07  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1077  CDS  NC_005945  1131975  1132262  288  hypothetical protein  YP_027350  unclonable  2.32689e-13  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1106  CDS  NC_005945  1159241  1160635  1395  MATE efflux family protein  YP_027378  unclonable  5.60081e-08  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1139  CDS  NC_005945  1190361  1191131  771  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  YP_027411  unclonable  5.99586e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1154  CDS  NC_005945  1200758  1202236  1479  sodium/proline symporter family protein  YP_027425  unclonable  9.4389e-08  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1339  CDS  NC_005945  1371696  1372949  1254  M24/M37 family peptidase  YP_027608  unclonable  5.01622e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1363  CDS  NC_005945  1392753  1394774  2022  penicillin-binding protein  YP_027632  unclonable  3.33103e-05  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1389  CDS  NC_005945  1420920  1421534  615  M24/M37 family peptidase  YP_027658  unclonable  7.98303e-12  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1390  CDS  NC_005945  1421699  1422385  687  hypothetical protein  YP_027659  unclonable  1.98989e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1391  CDS  NC_005945  1422935  1423513  579  hypothetical protein  YP_027660  unclonable  1.15789e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1392  CDS  NC_005945  1423635  1423883  249  ferredoxin  YP_027661  unclonable  3.6513e-13  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1395  CDS  NC_005945  1426762  1427325  564  CAAX amino terminal protease family protein  YP_027664  unclonable  4.88789e-12  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1521  CDS  NC_005945  1551467  1552630  1164  germination protein gerN  YP_027788  unclonable  6.01236e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1626  CDS  NC_005945  1643309  1643875  567  RNA polymerase factor sigma-70  YP_027892  unclonable  2.38323e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1682  CDS  NC_005945  1700901  1702145  1245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_027948  unclonable  8.45994e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1760  CDS  NC_005945  1781408  1782358  951  hypothetical protein  YP_028024  unclonable  2.49314e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1770  CDS  NC_005945  1795811  1796503  693  azoreductase  YP_028034  unclonable  2.43182e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1852  CDS  NC_005945  1877061  1878221  1161  protease  YP_028116  unclonable  2.03248e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS1997  CDS  NC_005945  2002256  2004661  2406  nitrite reductase  YP_028260  unclonable  0.00110354  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2010  CDS  NC_005945  2015766  2017661  1896  ABC transporter ATP-binding protein  YP_028273  unclonable  6.75061e-06  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2011  CDS  NC_005945  2017737  2018468  732  hypothetical protein  YP_028274  unclonable  5.05565e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2085  CDS  NC_005945  2091743  2092378  636  azoreductase  YP_028348  unclonable  1.56385e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2086  CDS  NC_005945  2092490  2093209  720  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  YP_028349  unclonable  3.21882e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2087  CDS  NC_005945  2093250  2093906  657  hemolysin III  YP_028350  unclonable  1.45785e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2095  CDS  NC_005945  2099505  2101406  1902  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  YP_028358  unclonable  7.47097e-06  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2099  CDS  NC_005945  2102671  2103633  963  substrate-binding family protein  YP_028362  unclonable  2.70129e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2351  CDS  NC_005945  2351108  2352340  1233  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_028612  unclonable  8.72091e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2734  CDS  NC_005945  2709102  2709929  828  polysaccharide deacetylase  YP_028992  unclonable  1.54127e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS2786  CDS  NC_005945  2765843  2767279  1437  amino acid permease family protein  YP_029044  unclonable  5.95058e-08  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3189  CDS  NC_005945  3164247  3165944  1698  neutral protease  YP_029446  unclonable  7.41792e-07  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3262  CDS  NC_005945  3228185  3229603  1419  amino acid permease family protein  YP_029519  unclonable  5.32253e-08  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3278  CDS  NC_005945  3243396  3244160  765  hypothetical protein  YP_029535  unclonable  1.24839e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3332  CDS  NC_005945  3299105  3299950  846  exonuclease  YP_029589  unclonable  1.15219e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3333  CDS  NC_005945  3300140  3300340  201  cold shock protein CspB  YP_029590  unclonable  7.36097e-14  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3334  CDS  NC_005945  3300557  3301456  900  BNR repeat-containing protein  YP_029591  unclonable  1.04235e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3335  CDS  NC_005945  3301473  3301916  444  flavodoxin  YP_029592  unclonable  6.59666e-13  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3336  CDS  NC_005945  3302058  3302678  621  hypothetical protein  YP_029593  unclonable  9.09805e-12  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3467  CDS  NC_005945  3441636  3443387  1752  ABC transporter ATP-binding/permease  YP_029722  unclonable  1.39825e-06  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3468  CDS  NC_005945  3443511  3443732  222  hypothetical protein  YP_029723  unclonable  1.42472e-13  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3489  CDS  NC_005945  3461152  3461376  225  hypothetical protein  YP_029744  unclonable  1.41028e-13  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3490  CDS  NC_005945  3461437  3462369  933  prophage LambdaBa01, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family protein 2  YP_029745  unclonable  3.47114e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3491  CDS  NC_005945  3462369  3462794  426  prophage LambdaBa01, holin  YP_029746  unclonable  1.60757e-12  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3517  CDS  NC_005945  3485142  3486125  984  hypothetical protein  YP_029771  unclonable  5.50891e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3518  CDS  NC_005945  3486158  3486490  333  hypothetical protein  YP_029772  unclonable  7.29179e-13  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3519  CDS  NC_005945  3486631  3487266  636  hypothetical protein  YP_029773  unclonable  1.95013e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3520  CDS  NC_005945  3487305  3487517  213  hypothetical protein  YP_029774  unclonable  2.90001e-13  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3521  CDS  NC_005945  3487586  3488725  1140  hypothetical protein  YP_029775  unclonable  2.74826e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3645  CDS  NC_005945  3606197  3608578  2382  stage III sporulation protein E  YP_029896  unclonable  0.00104928  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3651  CDS  NC_005945  3613170  3614402  1233  aspartate kinase I  YP_029902  unclonable  5.95141e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3679  CDS  NC_005945  3643822  3644601  780  transcriptional repressor CodY  YP_029930  unclonable  5.00442e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3692  CDS  NC_005945  3657334  3658068  735  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_029943  unclonable  4.13535e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3693  CDS  NC_005945  3658068  3658583  516  16S rRNA-processing protein RimM  YP_029944  unclonable  2.84682e-12  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3694  CDS  NC_005945  3658704  3658931  228  KH domain-containing protein  YP_029945  unclonable  1.70601e-13  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3695  CDS  NC_005945  3658946  3659218  273  30S ribosomal protein S16  YP_029946  unclonable  3.6513e-13  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3698  CDS  NC_005945  3661146  3662135  990  signal recognition particle-docking protein FtsY  YP_029949  unclonable  4.93228e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3754  CDS  NC_005945  3721291  3722160  870  sporulation sigma factor SigG  YP_030005  unclonable  4.19985e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS3929  CDS  NC_005945  3879270  3880034  765  putative lipoprotein  YP_030179  unclonable  8.69341e-11  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4194  CDS  NC_005945  4108719  4109840  1122  RNA polymerase sigma factor RpoD  YP_030442  unclonable  1.45872e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4327  CDS  NC_005945  4237819  4239348  1530  L-aspartate oxidase  YP_030574  unclonable  1.67292e-07  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4367  CDS  NC_005945  4277325  4279655  2331  ATP-dependent protease La 1  YP_030614  unclonable  0.000611183  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4424  CDS  NC_005945  4333916  4334890  975  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  YP_030671  unclonable  5.18711e-10  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4476  CDS  NC_005945  4388133  4388594  462  transcriptional regulator NrdR  YP_030723  unclonable  2.65338e-12  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4477  CDS  NC_005945  4388880  4389272  393  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  YP_030724  unclonable  1.15529e-12  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4886  CDS  NC_005945  4768821  4770137  1317  amino acid permease family protein  YP_031128  unclonable  1.45673e-08  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4922  CDS  NC_005945  4800830  4802011  1182  NupC family nucleoside transporter  YP_031163  unclonable  3.67634e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4923  CDS  NC_005945  4802357  4803538  1182  NupC family nucleoside transporter  YP_031164  unclonable  2.48626e-09  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4924  CDS  NC_005945  4803835  4805274  1440  sodium/alanine symporter family protein  YP_031165  unclonable  3.93697e-08  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4925  CDS  NC_005945  4805609  4807039  1431  sodium/alanine symporter family protein  YP_031166  unclonable  3.31766e-08  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4926  CDS  NC_005945  4807322  4807960  639  hypothetical protein  YP_031167  unclonable  9.66245e-12  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS4966  CDS  NC_005945  4846015  4846644  630  hypothetical protein  YP_031206  unclonable  4.00112e-12  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
BAS5080  CDS  NC_005945  4957790  4958155  366  hypothetical protein  YP_031319  unclonable  4.73899e-13  n/a    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>