25 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Mbur_0004  CDS  NC_007955  2416  3129  714  50S ribosomal protein L2P  YP_564778  unclonable  4.54303e-15  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
 
Mbur_0005  CDS  NC_007955  3146  3559  414  30S ribosomal protein S19P  YP_564779  unclonable  1.96004e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0014  CDS  NC_007955  7254  7763  510  50S ribosomal protein L5P  YP_564788  unclonable  5.43993e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0015  CDS  NC_007955  7763  7915  153  30S ribosomal protein S14P  YP_564789  unclonable  1.67188e-17  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0016  CDS  NC_007955  7927  8319  393  30S ribosomal protein S8P  YP_564790  unclonable  1.66957e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0017  CDS  NC_007955  8338  8871  534  50S ribosomal protein L6P  YP_564791  unclonable  4.87132e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0080  CDS  NC_007955  69320  70567  1248  hypothetical protein  YP_564851  unclonable  4.12436e-13  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0081  CDS  NC_007955  70587  71309  723  ABC transporter, ATPase subunit  YP_564852  unclonable  3.60668e-15  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0248  CDS  NC_007955  222529  224283  1755  peptidase M50  YP_565005  unclonable  5.40477e-11  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0686  CDS  NC_007955  705960  706865  906  SSU ribosomal protein S6P modification protein  YP_565402  unclonable  2.59145e-14  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0858  CDS  NC_007955  901941  904349  2409  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  YP_565559  unclonable  7.64937e-09  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0859  CDS  NC_007955  904352  904867  516  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit epsilon  YP_565560  unclonable  8.36594e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0906  CDS  NC_007955  972825  974111  1287  putative pseudouridylate synthase  YP_565603  unclonable  1.79406e-13  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1039  CDS  NC_007955  1121191  1122660  1470  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) / cobyrinate a,c-diamide synthase  YP_565724  unclonable  8.25855e-12  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1092  CDS  NC_007955  1171625  1172239  615  hypothetical protein  YP_565772  unclonable  3.32806e-15  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1177  CDS  NC_007955  1264769  1267420  2652  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  YP_565850  unclonable  1.30646e-07  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1289  CDS  NC_007955  1378083  1380080  1998  F420H2 dehydrogenase subunit L  YP_565958  unclonable  1.32103e-10  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1290  CDS  NC_007955  1380083  1380385  303  F420H2 dehydrogenase subunit K  YP_565959  unclonable  7.20191e-17  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1291    NC_007955  1380385  1380997  613      unclonable  9.15748e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1367  CDS  NC_007955  1458143  1459189  1047  transmembrane protein MttP  YP_566034  unclonable  3.13497e-14  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1877  CDS  NC_007955  1973691  1974539  849  ribose-phosphate pyrophosphokinase  YP_566510  unclonable  9.2442e-15  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1942  CDS  NC_007955  2039998  2041104  1107  cell division protein FtsZ  YP_566573  unclonable  1.84944e-13  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1976  CDS  NC_007955  2074844  2078947  4104  hypothetical protein  YP_566605  unclonable  0.000800417  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_2045  CDS  NC_007955  2153122  2154162  1041  phosphate transporter  YP_566671  unclonable  9.73225e-14  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_2049  CDS  NC_007955  2156988  2157296  309  translation initiation factor Sui1  YP_566675  unclonable  9.06796e-17  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>