44 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Psyc_0001  CDS  NC_007204  520  1965  1446  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_263309  hitchhiker  1.68448e-08  unclonable  2.04804e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0002  CDS  NC_007204  2125  3300  1176  DNA polymerase III, beta subunit  YP_263310  hitchhiker  1.04576e-11  unclonable  1.79673e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0003  CDS  NC_007204  3463  4677  1215  DNA replication and repair protein RecF  YP_263311  hitchhiker  0.00736355  unclonable  1.72391e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0162  CDS  NC_007204  187480  189006  1527  exopolyphosphatase  YP_263469  normal  unclonable  2.21963e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0163  CDS  NC_007204  189235  190038  804  acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  YP_263470  normal  unclonable  1.43666e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0164  CDS  NC_007204  190316  191893  1578  hypothetical protein  YP_263471  normal  0.156481  unclonable  1.74204e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0402  CDS  NC_007204  502506  503840  1335  hypothetical protein  YP_263703  unclonable  1.18923e-12  unclonable  8.57241e-07  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0573  CDS  NC_007204  677216  678583  1368  macrolide secretion protein MacA  YP_263868  unclonable  1.23833e-12  normal  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0984  CDS  NC_007204  1179272  1179640  369  hypothetical protein  YP_264271  hitchhiker  1.0147e-12  unclonable  1.39166e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0985  CDS  NC_007204  1180570  1180917  348  DNA binding protein  YP_264272  hitchhiker  1.23712e-11  unclonable  1.2964e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0986  CDS  NC_007204  1180939  1181484  546  neutral zinc metallopeptidase  YP_264273  hitchhiker  8.37307e-07  unclonable  1.39166e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0987  CDS  NC_007204  1181960  1182868  909  hypothetical protein  YP_264274  hitchhiker  0.0025318  unclonable  1.5741e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0988  CDS  NC_007204  1182865  1183734  870  hypothetical protein  YP_264275  normal  0.140861  unclonable  1.55773e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_0989  CDS  NC_007204  1184381  1185100  720  S24 family peptidase  YP_264276  normal  unclonable  1.25637e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1203  CDS  NC_007204  1444480  1446306  1827  aspartyl-tRNA synthetase  YP_264488  unclonable  1.20939e-10  decreased coverage  0.0042207  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1270  CDS  NC_007204  1527217  1528545  1329  serine protease  YP_264554  unclonable  4.78038e-13  normal  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1308  CDS  NC_007204  1576097  1577014  918  hypothetical protein  YP_264592  unclonable  2.75009e-14  normal  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1329  CDS  NC_007204  1605538  1606278  741  TetR family transcriptional regulator  YP_264613  unclonable  7.04239e-15  normal  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1403  CDS  NC_007204  1697731  1698927  1197  aromatic amino acid aminotransferase  YP_264685  unclonable  4.15206e-13  normal  0.0752089  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1466  CDS  NC_007204  1779392  1780114  723  hypothetical protein  YP_264748  unclonable  2.05564e-15  hitchhiker  2.76724e-05  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1468  CDS  NC_007204  1783417  1785900  2484  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  YP_264750  normal  0.614381  unclonable  2.4056e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1469  CDS  NC_007204  1786000  1786875  876  hypothetical protein  YP_264751  normal  unclonable  1.25637e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1470  CDS  NC_007204  1786992  1787918  927  ribosomal protein L11 methyltransferase  YP_264752  normal  0.456616  unclonable  1.18267e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1471  CDS  NC_007204  1788227  1788586  360  Fis-type transcriptional activator  YP_264753  normal  0.161075  unclonable  8.48327e-07  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1472  CDS  NC_007204  1788784  1790364  1581  bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  YP_264754  normal  0.255919  unclonable  1.32318e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1473  CDS  NC_007204  1790558  1792432  1875  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_264755  hitchhiker  1.82317e-10  unclonable  1.48108e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1633  CDS  NC_007204  2019038  2019757  720  ribonuclease T  YP_264915  unclonable  3.60038e-15  hitchhiker  0.000696557  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1634  CDS  NC_007204  2020398  2021243  846  nucleotidylyl transferase, pyrophosphorylase  YP_264916  unclonable  1.37687e-14  hitchhiker  0.000684892  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1635  CDS  NC_007204  2021356  2021664  309  cell division protein FtsB  YP_264917  unclonable  9.0689e-17  hitchhiker  0.000571859  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1642  CDS  NC_007204  2030108  2031205  1098  porin  YP_264924  unclonable  8.69717e-14  unclonable  1.25637e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1643  CDS  NC_007204  2031762  2033966  2205  malate synthase G  YP_264925  hitchhiker  0.0049939  unclonable  1.83387e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1744  CDS  NC_007204  2147782  2148744  963  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_265026  unclonable  4.8167e-14  normal  0.132089  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1745  CDS  NC_007204  2149177  2150373  1197  cell division protein FtsZ  YP_265027  unclonable  1.3123e-13  normal  0.221257  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1894  CDS  NC_007204  2338442  2339632  1191  elongation factor Tu  YP_265176  unclonable  3.75523e-13  normal  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1910  CDS  NC_007204  2358027  2359046  1020  carbohydrate kinase  YP_265192  unclonable  7.04659e-14  hitchhiker  0.00127543  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1970  CDS  NC_007204  2429332  2430543  1212  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_265251  normal  0.362658  unclonable  1.74204e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1971  CDS  NC_007204  2430663  2432063  1401  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  YP_265252  hitchhiker  3.01173e-05  unclonable  1.39166e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_1972  CDS  NC_007204  2432160  2433575  1416  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  YP_265253  decreased coverage  1.16517e-10  unclonable  1.39166e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_2047  CDS  NC_007204  2516655  2517563  909  DNA/RNA non-specific endonuclease (Mg-dependent)  YP_265328  unclonable  1.9362e-14  normal  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_2144  CDS  NC_007204  2647569  2649266  1698  putative inner membrane protein translocase component YidC  YP_265425  hitchhiker  0.00651842  unclonable  1.65557e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_2145  CDS  NC_007204  2649484  2649858  375  hypothetical protein  YP_265426  hitchhiker  1.65245e-08  unclonable  1.11229e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_2146  CDS  NC_007204  2649860  2650231  372  ribonuclease P protein component  YP_265427  hitchhiker  1.64935e-11  unclonable  1.1472e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_2147  CDS  NC_007204  2650418  2650552  135  50S ribosomal protein L34  YP_265428  unclonable  2.00251e-17  unclonable  1.11229e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Psyc_R0043  tRNA  NC_007204  2019984  2020059  76  tRNA-Glu    unclonable  7.66398e-18  hitchhiker  0.000611065  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>