14 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
MCA0749  CDS  NC_002977  786655  787848  1194  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_113252  unclonable  5.0083e-06  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA1217  CDS  NC_002977  1281500  1284019  2520  metalloprotease, putative  YP_113681  unclonable  0.000727805  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA1509  CDS  NC_002977  1607847  1609946  2100  TPR domain-containing protein  YP_113965  unclonable  0.000367862  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA1510  CDS  NC_002977  1609935  1610351  417  fimbrial protein  YP_113966  unclonable  6.90325e-08  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA1738  CDS  NC_002977  1855211  1856134  924  hypothetical protein  YP_114177  unclonable  8.86142e-07  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA1798  CDS  NC_002977  1928445  1929227  783  methane monooxygenase, C subunit  YP_114236  unclonable  3.78128e-07  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA1799  CDS  NC_002977  1929583  1929882  300  cytochrome c family protein  YP_114237  unclonable  5.99943e-08  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA1863  CDS  NC_002977  2001965  2002303  339  regulator protein, putative  YP_114300  unclonable  3.71113e-08  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA2244  CDS  NC_002977  2435546  2435677  132  hypothetical protein  YP_114662  unclonable  1.09492e-08  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA2245  CDS  NC_002977  2435927  2436049  123  hypothetical protein  YP_114663  unclonable  1.1865e-08  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA2724  CDS  NC_002977  2917848  2919680  1833  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  YP_115124  unclonable  4.62044e-05  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA2855  CDS  NC_002977  3048914  3049696  783  ammonia monooxygenase/methane monooxygenase, subunit C family protein  YP_115249  unclonable  3.59569e-07  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA2857  CDS  NC_002977  3050056  3050868  813  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  YP_115250  unclonable  5.05673e-07  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
MCA3103  CDS  NC_002977  3289936  3290982  1047  outer membrane protein MopB  YP_115490  unclonable  3.00647e-06  n/a    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>