121 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
DET0041  CDS  NC_002936  35760  36266  507  quinone methlytransferase  YP_180796  unclonable  1.05816e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0042  CDS  NC_002936  36271  36363  93  hypothetical protein  YP_180797  unclonable  1.26857e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0043  CDS  NC_002936  36374  36568  195  hypothetical protein  YP_180798  unclonable  2.20124e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0044  CDS  NC_002936  36711  37082  372  hypothetical protein  YP_180799  unclonable  3.36906e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0045  CDS  NC_002936  37216  37662  447  redox family protein  YP_180800  unclonable  5.53397e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0046  CDS  NC_002936  37659  38762  1104  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  YP_180801  unclonable  8.60975e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0057  CDS  NC_002936  51068  53542  2475  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  YP_180810  unclonable  0.00724799  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0334  CDS  NC_002936  318432  319913  1482  polyA polymerase family protein  YP_181081  unclonable  7.07313e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0340  CDS  NC_002936  324652  325080  429  MraZ  YP_181087  unclonable  3.20074e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0341  CDS  NC_002936  325087  326136  1050  S-adenosyl-methyltransferase MraW  YP_181088  unclonable  6.42562e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0345  CDS  NC_002936  329593  331878  2286  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  YP_181092  unclonable  0.00309044  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0346  CDS  NC_002936  331885  331992  108  hypothetical protein  YP_181093  unclonable  9.27006e-08  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0347  CDS  NC_002936  332109  332693  585  hypothetical protein  YP_181094  unclonable  1.02624e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0348  CDS  NC_002936  332662  334296  1635  radical SAM domain-containing protein  YP_181095  unclonable  0.000123778  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0349  CDS  NC_002936  334345  334794  450  GatB/YqeY domain-containing protein  YP_181096  unclonable  5.26076e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0350  CDS  NC_002936  334797  334991  195  30S ribosomal protein S21  YP_181097  unclonable  1.44824e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0351  CDS  NC_002936  335166  335396  231  hypothetical protein  YP_181098  unclonable  1.7069e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0352  CDS  NC_002936  335508  336938  1431  hypothetical protein  YP_181099  unclonable  5.16311e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0353  CDS  NC_002936  337146  337487  342  hypothetical protein  YP_181100  unclonable  1.8318e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0354  CDS  NC_002936  337471  338382  912  phage domain-containing protein  YP_181101  unclonable  2.88808e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0364  CDS  NC_002936  344622  345755  1134  carboxyl-terminal protease  YP_181110  unclonable  1.10985e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0377  CDS  NC_002936  358588  359325  738  30S ribosomal protein S2  YP_181123  unclonable  2.47942e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0383  CDS  NC_002936  364790  365560  771  hypothetical protein  YP_181128  unclonable  2.58226e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0384  CDS  NC_002936  365645  366790  1146  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  YP_181129  unclonable  2.05726e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0391  CDS  NC_002936  371093  372919  1827  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_181136  unclonable  0.000322193  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0419  CDS  NC_002936  394234  395016  783  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  YP_181164  unclonable  2.66261e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0420  CDS  NC_002936  395060  395170  111  hypothetical protein  YP_181165  unclonable  9.7573e-08  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0421  CDS  NC_002936  395219  396058  840  degV family protein  YP_181166  unclonable  3.22806e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0428  CDS  NC_002936  400891  401667  777  pantothenate kinase  YP_181172  unclonable  1.88548e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0429  CDS  NC_002936  401769  402950  1182  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  YP_181173  unclonable  1.60974e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0459  CDS  NC_002936  433005  433328  324  hypothetical protein  YP_181203  unclonable  6.07041e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0469  CDS  NC_002936  442098  442214  117  hypothetical protein  YP_181213  unclonable  1.37676e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0470  CDS  NC_002936  442383  442817  435  30S ribosomal protein S12  YP_181214  unclonable  8.14349e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0487  CDS  NC_002936  451853  452038  186  30S ribosomal protein S14  YP_181231  unclonable  1.60451e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0497  CDS  NC_002936  457298  457519  222  translation initiation factor IF-1  YP_181241  unclonable  1.54065e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0498  CDS  NC_002936  457548  457661  114  50S ribosomal protein L36  YP_181242  unclonable  7.94474e-08  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0499  CDS  NC_002936  457671  458060  390  30S ribosomal protein S13  YP_181243  unclonable  3.23492e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0500  CDS  NC_002936  458086  458478  393  30S ribosomal protein S11  YP_181244  unclonable  2.51151e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0555    NC_002936  513056  513484  429      unclonable  4.38313e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0556  CDS  NC_002936  513481  513648  168  hypothetical protein  YP_181299  unclonable  1.36222e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0557  CDS  NC_002936  513683  513916  234  hypothetical protein  YP_181300  unclonable  2.13486e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0568  CDS  NC_002936  521409  521657  249  30S ribosomal protein S16  YP_181311  unclonable  2.1123e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0569  CDS  NC_002936  521809  522474  666  endonuclease V  YP_181312  unclonable  1.50735e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0589  CDS  NC_002936  539264  540442  1179  tubulin/FtsZ family protein  YP_181331  unclonable  1.57682e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0627  CDS  NC_002936  580984  582333  1350  hypothetical protein  YP_181369  unclonable  3.26555e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0708  CDS  NC_002936  654040  655836  1797  aspartyl-tRNA synthetase  YP_181449  unclonable  0.000309343  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0734  CDS  NC_002936  676613  676999  387  hypothetical protein  YP_181470  unclonable  7.50313e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0766  CDS  NC_002936  703728  705854  2127  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  YP_181498  unclonable  0.0013002  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0767  CDS  NC_002936  706040  706270  231  ATPase, C subunit family protein  YP_181499  unclonable  1.60451e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0768  CDS  NC_002936  706346  706675  330  hypothetical protein  YP_181500  unclonable  2.86376e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0799  CDS  NC_002936  735412  735594  183  hypothetical protein  YP_181531  unclonable  1.63895e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0800  CDS  NC_002936  735677  736009  333  hypothetical protein  YP_181532  unclonable  2.98248e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0834  CDS  NC_002936  762697  764364  1668  dihydroxy-acid dehydratase  YP_181561  unclonable  0.00030605  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0835  CDS  NC_002936  764466  765107  642  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  YP_181562  unclonable  2.00463e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0846  CDS  NC_002936  775743  776981  1239  histidyl-tRNA synthetase, putative  YP_181573  unclonable  1.26725e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0859  CDS  NC_002936  785976  787793  1818  GTP-binding protein LepA  YP_181585  unclonable  0.00045747  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0976  CDS  NC_002936  895517  896788  1272  adenylosuccinate synthetase  YP_181699  unclonable  3.93074e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0992  CDS  NC_002936  909962  910675  714  50S ribosomal protein L1  YP_181715  unclonable  2.82908e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET0997  CDS  NC_002936  912110  913312  1203  elongation factor Tu  YP_181720  unclonable  1.93617e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1036  CDS  NC_002936  940140  940955  816  serine protease  YP_181752  unclonable  4.75095e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1045  CDS  NC_002936  949381  949788  408  single-strand binding protein  YP_181761  unclonable  3.83918e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1101  CDS  NC_002936  1004005  1004577  573  hypothetical protein  YP_181816  unclonable  1.39057e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1102  CDS  NC_002936  1004570  1005709  1140  hypothetical protein  YP_181817  unclonable  1.64334e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1134  CDS  NC_002936  1037633  1038214  582  hypothetical protein  YP_181849  unclonable  7.6644e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1184  CDS  NC_002936  1081773  1082420  648  BioY family protein  YP_181897  unclonable  3.30178e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1185  CDS  NC_002936  1082469  1082705  237  hypothetical protein  YP_181898  unclonable  4.80496e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1186  CDS  NC_002936  1082804  1083100  297  hypothetical protein  YP_181899  unclonable  5.64932e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1207  CDS  NC_002936  1104646  1105911  1266  protein export protein, putative  YP_181920  unclonable  2.85401e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1226  CDS  NC_002936  1124972  1125571  600  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  YP_181939  unclonable  1.13561e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1227  CDS  NC_002936  1125734  1126870  1137  DNA polymerase III, beta subunit  YP_181940  unclonable  1.28167e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1260  CDS  NC_002936  1146867  1148087  1221  argininosuccinate synthase  YP_181972  unclonable  1.84052e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1261  CDS  NC_002936  1148088  1149473  1386  argininosuccinate lyase  YP_181973  unclonable  4.76291e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1262  CDS  NC_002936  1149483  1149671  189  50S ribosomal protein L28  YP_181974  unclonable  2.02821e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1263  CDS  NC_002936  1149800  1151434  1635  DAK2 domain-containing protein  YP_181975  unclonable  0.000174743  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1285  CDS  NC_002936  1171954  1173138  1185  serine protease  YP_181997  unclonable  2.07933e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1286  CDS  NC_002936  1173221  1174039  819  serine protease  YP_181998  unclonable  3.22806e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1294  CDS  NC_002936  1179908  1180450  543  DNA-binding response regulator  YP_182006  unclonable  1.25664e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1325  CDS  NC_002936  1203133  1203531  399  50S ribosomal protein L21  YP_182036  unclonable  2.43577e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1360  CDS  NC_002936  1231137  1231481  345  general secretion family protein  YP_182071  unclonable  3.88019e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1361  CDS  NC_002936  1231597  1231695  99  hypothetical protein  YP_182072  unclonable  1.52437e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1362  CDS  NC_002936  1231704  1232471  768  type IV prepilin leader peptidase family protein  YP_182073  unclonable  2.97795e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1363  CDS  NC_002936  1232590  1234674  2085  bifunctional mannosyl-3-phosphoglycerate synthase/mannosyl-3 phosphoglycerate phosphatase  YP_182074  unclonable  0.0011007  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1371  CDS  NC_002936  1239268  1239840  573  NADPH-dependent FMN reductase  YP_182082  unclonable  8.14349e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1375  CDS  NC_002936  1241981  1242883  903  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  YP_182086  unclonable  4.47138e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1383    NC_002936  1249670  1251218  1549      unclonable  0.000117498  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1384  CDS  NC_002936  1251240  1251518  279  preprotein translocase, YajC subunit  YP_182094  unclonable  3.96106e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1385  CDS  NC_002936  1251529  1252785  1257  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  YP_182095  unclonable  3.58756e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1404  CDS  NC_002936  1272059  1272556  498  hypothetical protein  YP_182113  unclonable  5.94645e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1405  CDS  NC_002936  1272585  1272734  150  hypothetical protein  YP_182114  unclonable  1.22956e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1406  CDS  NC_002936  1272745  1272846  102  hypothetical protein  YP_182115  unclonable  8.36227e-08  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1408    NC_002936  1276341  1277616  1276      unclonable  1.73103e-05  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1437  CDS  NC_002936  1307586  1307816  231  hypothetical protein  YP_182145  unclonable  2.41003e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1438  CDS  NC_002936  1307826  1308149  324  hypothetical protein  YP_182146  unclonable  2.64193e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1443  CDS  NC_002936  1308641  1308799  159  hypothetical protein  YP_182147  unclonable  9.46312e-08  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1445  CDS  NC_002936  1309438  1309995  558  hypothetical protein  YP_182148  unclonable  6.32214e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1448  CDS  NC_002936  1310633  1310773  141  hypothetical protein  YP_182151  unclonable  8.71419e-08  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1449  CDS  NC_002936  1310864  1311475  612  MarC membrane protein  YP_182152  unclonable  7.27679e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1456  CDS  NC_002936  1315300  1315881  582  2'-5' RNA ligase family protein  YP_182159  unclonable  7.58334e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1457  CDS  NC_002936  1315953  1316156  204  hypothetical protein  YP_182160  unclonable  1.07901e-07  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
DET1458  CDS  NC_002936  1316196  1316897  702  comF family protein, putative  YP_182161  unclonable  1.15929e-06  n/a    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>