20 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
TC0025  CDS  NC_002620  31534  32343  810  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  NP_296409  unclonable  7.83531e-05  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0026  CDS  NC_002620  32584  32907  324  hypothetical protein  NP_296410  unclonable  5.53875e-06  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0224  CDS  NC_002620  262345  263370  1026  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  NP_296603  unclonable  0.000290569  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0290  CDS  NC_002620  348825  349568  744  hypothetical protein  NP_296669  unclonable  3.40579e-05  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0291  CDS  NC_002620  349644  349970  327  50S ribosomal protein L31 type B  NP_296670  unclonable  3.93408e-06  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0335  CDS  NC_002620  397808  399397  1590  ADP, ATP carrier protein  NP_296714  unclonable  0.00666368  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0341  CDS  NC_002620  402602  403945  1344  ABC transporter, permease protein, putative  NP_296719  unclonable  0.00122144  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0342  CDS  NC_002620  403947  404897  951  ABC transporter, permease protein, putative  NP_296720  unclonable  5.62705e-05  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0343  CDS  NC_002620  404923  406062  1140  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  NP_296721  unclonable  0.000311971  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0387  CDS  NC_002620  448832  449140  309  co-chaperonin GroES  NP_296765  unclonable  2.82535e-06  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0457  CDS  NC_002620  554920  556443  1524  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  NP_296834  unclonable  0.00414605  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0496  CDS  NC_002620  602654  603370  717  hypothetical protein  NP_296873  unclonable  3.65659e-05  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0538  CDS  NC_002620  648951  649253  303  integration host factor beta subunit, putative  NP_296915  unclonable  4.18171e-06  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0727  CDS  NC_002620  864582  866246  1665  60 kDa outer membrane protein  NP_297101  unclonable  0.00741455  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0730  CDS  NC_002620  867209  868729  1521  glutamyl-tRNA synthetase  NP_297104  unclonable  0.00473213  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0782  CDS  NC_002620  924755  926386  1632  ADP, ATP carrier protein  NP_297155  unclonable  0.00645947  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0873  CDS  NC_002620  1010963  1011514  552  hypothetical protein  NP_297246  unclonable  1.72181e-05  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
TC0893  CDS  NC_002620  1035482  1037086  1605  60 kDa chaperonin  NP_297266  unclonable  0.00498028  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
tRNA-Arg-2  tRNA  NC_002620  32623  32695  73  tRNA-Arg    unclonable  1.33182e-06  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
tRNA-Leu-5  tRNA  NC_002620  958000  958086  87  tRNA-Leu    unclonable  1.2405e-06  n/a    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>