70 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Ava_0083  CDS  NC_007413  106817  112159  5343  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  YP_320604  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0434  CDS  NC_007413  553560  555584  2025  Serine/threonine protein kinase  YP_320955  unclonable  3.41904e-10  normal  0.409693  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0711  CDS  NC_007413  885325  885549  225  translation initiation factor IF-1  YP_321230  unclonable  3.62397e-14  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0744  CDS  NC_007413  917927  918982  1056  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  YP_321263  unclonable  1.02583e-12  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0781  CDS  NC_007413  958604  959608  1005  phosphoribulokinase  YP_321300  unclonable  2.8784e-12  unclonable  8.17454e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0782  CDS  NC_007413  960777  962099  1323  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  YP_321301  hitchhiker  0.00024869  unclonable  7.85266e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0783  CDS  NC_007413  962323  963612  1290  homoserine dehydrogenase  YP_321302  hitchhiker  0.00270854  unclonable  5.75852e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0885  CDS  NC_007413  1081570  1082124  555  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  YP_321404  normal  unclonable  1.27189e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0886  CDS  NC_007413  1082262  1082498  237  hypothetical protein  YP_321405  normal  unclonable  1.20945e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0887  CDS  NC_007413  1082593  1083087  495  acetyltransferase  YP_321406  normal  unclonable  1.33756e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0888  CDS  NC_007413  1083128  1083703  576  hypothetical protein  YP_321407  normal  unclonable  1.42126e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0889  CDS  NC_007413  1083841  1084290  450  hypothetical protein  YP_321408  normal  unclonable  1.37854e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0890  CDS  NC_007413  1084547  1085539  993  MscS mechanosensitive ion channel  YP_321409  normal  unclonable  2.01965e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_0891  CDS  NC_007413  1085628  1085747  120  potassium channel protein  YP_321410  normal  unclonable  1.39287e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1060  CDS  NC_007413  1290899  1291492  594  hypothetical protein  YP_321579  unclonable  1.22836e-13  decreased coverage  2.22645e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1357  CDS  NC_007413  1673689  1674303  615  hypothetical protein  YP_321876  unclonable  2.681e-13  normal  0.0119499  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1461  CDS  NC_007413  1801932  1802975  1044  rod shape-determining protein MreB  YP_321979  hitchhiker  3.97491e-10  unclonable  2.42005e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1462  CDS  NC_007413  1803310  1803672  363  single-stranded DNA-binding protein  YP_321980  unclonable  2.99636e-14  hitchhiker  0.000565917  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1463  CDS  NC_007413  1803736  1804482  747  hypothetical protein  YP_321981  unclonable  3.88338e-13  hitchhiker  0.000639516  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1466  CDS  NC_007413  1809178  1811061  1884  cell wall hydrolase/autolysin  YP_321984  unclonable  1.00817e-10  normal  0.166489  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1505  CDS  NC_007413  1852432  1853463  1032  30S ribosomal protein S1  YP_322023  unclonable  4.0832e-13  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1506  CDS  NC_007413  1853791  1853898  108  photosystem II reaction center protein T  YP_322024  unclonable  3.03065e-15  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1507  CDS  NC_007413  1853989  1855518  1530  photosystem antenna protein-like  YP_322025  unclonable  1.24352e-11  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1583  CDS  NC_007413  1954349  1955431  1083  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  YP_322101  unclonable  1.69219e-12  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1597  CDS  NC_007413  1971884  1972966  1083  photosystem II reaction centre protein PsbA/D1  YP_322115  unclonable  1.96706e-12  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_1939  CDS  NC_007413  2408515  2408760  246  hypothetical protein  YP_322456  unclonable  1.45773e-14  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2013  CDS  NC_007413  2494737  2495102  366  hypothetical protein  YP_322530  unclonable  4.89269e-14  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2084  CDS  NC_007413  2574626  2576557  1932  Serine/threonine protein kinase  YP_322601  unclonable  6.49074e-11  unclonable  2.62207e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2085  CDS  NC_007413  2576722  2577210  489  hypothetical protein  YP_322602  hitchhiker  8.9244e-10  unclonable  1.03026e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2086  CDS  NC_007413  2577482  2577778  297  hypothetical protein  YP_322603  hitchhiker  5.44815e-08  unclonable  9.04049e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2087  CDS  NC_007413  2578320  2578607  288  prevent-host-death protein  YP_322604  hitchhiker  7.57578e-07  unclonable  8.85843e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2088  CDS  NC_007413  2578617  2578949  333  addiction module toxin, Txe/YoeB  YP_322605  hitchhiker  1.11653e-05  unclonable  9.50728e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2089  CDS  NC_007413  2578953  2580866  1914  small GTP-binding protein domain-containing protein  YP_322606  hitchhiker  0.000643797  unclonable  2.12393e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2365  CDS  NC_007413  2945263  2946414  1152  hypothetical protein  YP_322878  unclonable  5.80643e-12  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2410  CDS  NC_007413  2998069  2998956  888  peptidoglycan-binding LysM  YP_322922  hitchhiker  0.000688679  unclonable  1.12748e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2411  CDS  NC_007413  2999314  3000519  1206  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  YP_322923  hitchhiker  2.41562e-06  unclonable  1.45022e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2412  CDS  NC_007413  3000591  3000935  345  hypothetical protein  YP_322924  hitchhiker  9.14307e-08  unclonable  8.34111e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2413  CDS  NC_007413  3001113  3001646  534  condensin subunit ScpB  YP_322925  decreased coverage  5.81218e-12  unclonable  8.85843e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2510  CDS  NC_007413  3103321  3105045  1725  S-layer region-like  YP_323020  unclonable  3.93409e-11  normal  0.0737899  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2511  CDS  NC_007413  3105412  3105693  282  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  YP_323021  unclonable  2.04873e-14  normal  0.0924158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2512  CDS  NC_007413  3106302  3107357  1056  photosystem II reaction centre protein PsbD/D2  YP_323022  unclonable  1.39889e-12  normal  0.112901  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2899  CDS  NC_007413  3602972  3603640  669  hypothetical protein  YP_323405  hitchhiker  4.14809e-05  unclonable  1.49465e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2900  CDS  NC_007413  3604015  3604611  597  hypothetical protein  YP_323406  unclonable  1.21592e-13  unclonable  1.37854e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2901  CDS  NC_007413  3604710  3605522  813  pyrroline-5-carboxylate reductase  YP_323407  hitchhiker  8.1741e-08  unclonable  1.52537e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2902  CDS  NC_007413  3605669  3608350  2682  Type III restriction enzyme, res subunit  YP_323408  normal  unclonable  2.84094e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_2990  CDS  NC_007413  3708967  3710295  1329  Serine/threonine protein kinase  YP_323495  unclonable  1.08087e-11  normal  0.539453  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_3195  CDS  NC_007413  3970284  3972548  2265  peptidoglycan-binding LysM  YP_323698  unclonable  9.99045e-10  decreased coverage  6.82898e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_3315  CDS  NC_007413  4139371  4140591  1221  hypothetical protein  YP_323817  unclonable  3.05692e-12  normal  0.429894  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_3731  CDS  NC_007413  4642256  4643272  1017  hypothetical protein  YP_324231  unclonable  1.59336e-12  normal  0.309617  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_3972  CDS  NC_007413  4921847  4922332  486  hypothetical protein  YP_324472  unclonable  6.22089e-14  hitchhiker  0.00288517  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4059  CDS  NC_007413  5044434  5046179  1746  S-layer region-like  YP_324558  unclonable  8.41951e-11  normal  0.105376  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4166  CDS  NC_007413  5215892  5216170  279  hypothetical protein  YP_324660  unclonable  1.50238e-14  decreased coverage  1.43914e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4357  CDS  NC_007413  5463155  5463415  261  30S ribosomal protein S16  YP_324850  unclonable  9.29169e-15  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4400  CDS  NC_007413  5513198  5514070  873  hypothetical protein  YP_324893  unclonable  1.96706e-12  unclonable  1.29781e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4808  CDS  NC_007413  6042793  6043623  831  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  YP_325300  unclonable  6.03288e-13  normal  0.956727  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4861  CDS  NC_007413  6124393  6125838  1446  glutamyl-tRNA synthetase  YP_325353  unclonable  7.02508e-12  unclonable  1.80865e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4862  CDS  NC_007413  6126457  6127983  1527  Serine/threonine protein kinase  YP_325354  hitchhiker  4.03484e-08  unclonable  1.97931e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4863  CDS  NC_007413  6128039  6129643  1605  Serine/threonine protein kinase  YP_325355  hitchhiker  0.00126679  unclonable  2.30163e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4864  CDS  NC_007413  6129977  6131161  1185  hypothetical protein  YP_325356  normal  0.019631  unclonable  2.01965e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4865  CDS  NC_007413  6131381  6132865  1485  hypothetical protein  YP_325357  normal  0.120137  unclonable  2.12393e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4866  CDS  NC_007413  6132915  6134120  1206  aminotransferase, class V  YP_325358  normal  0.403598  unclonable  1.72014e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4867  CDS  NC_007413  6134485  6135573  1089  HEAT repeat-containing PBS lyase  YP_325359  normal  0.116369  unclonable  1.50992e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4868  CDS  NC_007413  6135836  6136450  615  hypothetical protein  YP_325360  normal  0.359447  unclonable  1.2465e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4869  CDS  NC_007413  6136595  6137041  447  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  YP_325361  normal  0.536474  unclonable  9.99645e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_4900  CDS  NC_007413  6168967  6171975  3009  ATPase, E1-E2 type  YP_325392  unclonable  8.21628e-08  normal  0.0255689  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_B0094  CDS  NC_007410  104475  105056  582  hypothetical protein  YP_319995  unclonable  4.9462e-12  n/a    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_B0323  CDS  NC_007410  348500  349396  897  hypothetical protein  YP_320222  unclonable  2.50631e-11  n/a    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_D0044  CDS  NC_014000  31145  33658  2514  hypothetical protein  YP_003541167  unclonable  0.00826544  n/a    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_R0019  tRNA  NC_007413  2494613  2494686  74  tRNA-Pro    unclonable  1.00673e-14  normal  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Ava_R0059  tRNA  NC_007413  6126002  6126075  74  tRNA-Asp    unclonable  3.38363e-15  unclonable  9.22471e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>