21 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
PSPTO_0399  CDS  NC_004578  440454  441251  798  electron transfer flavoprotein, beta subunit  NP_790248  unclonable  1.76793e-07  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0400  CDS  NC_004578  441859  443655  1797  chitinase  NP_790249  unclonable  1.06126e-05  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0482  CDS  NC_004578  528719  529069  351  hypothetical protein  NP_790331  unclonable  4.3148e-08  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_0483  CDS  NC_004578  529381  530268  888  rarD protein  NP_790332  unclonable  3.25655e-07  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_1373  CDS  NC_004578  1509390  1510664  1275  type III helper protein HrpW1  NP_791200  unclonable  1.04079e-06  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_2272  CDS  NC_004578  2514998  2515249  252  outer membrane lipoprotein OprI  NP_792091  unclonable  1.53909e-08  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_2273  CDS  NC_004578  2515482  2515655  174  hypothetical protein  NP_792092  unclonable  1.12865e-08  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_2274  CDS  NC_004578  2515722  2516009  288  hypothetical protein  NP_792093  unclonable  1.80646e-08  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_2299  CDS  NC_004578  2542838  2543872  1035  outer membrane porin OprF  NP_792118  unclonable  3.00566e-07  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_2820  CDS  NC_004578  3144448  3145563  1116  hypothetical protein  NP_792624  unclonable  4.26889e-07  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_2821  CDS  NC_004578  3145551  3146459  909  hypothetical protein  NP_792625  unclonable  2.27124e-07  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_3155  CDS  NC_004578  3545226  3548708  3483  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase family protein  NP_792946  unclonable  0.000412297  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_3156  CDS  NC_004578  3548894  3549361  468  transcriptional regulator, AsnC family  NP_792947  unclonable  3.3258e-08  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_3157  CDS  NC_004578  3549774  3550406  633  hypothetical protein  NP_792948  unclonable  4.22864e-08  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_3422  CDS  NC_004578  3859929  3860504  576  hypothetical protein  NP_793205  unclonable  6.31056e-08  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_3427  CDS  NC_004578  3862800  3864584  1785  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  NP_793210  unclonable  5.65023e-06  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_4315  CDS  NC_004578  4865912  4866292  381  transcriptional regulator, putative  NP_794071  unclonable  2.86205e-08  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_4432  CDS  NC_004578  4999132  5001030  1899  sulfate adenylate transferase, subunit 1/adenylylsulfate kinase  NP_794186  unclonable  1.87918e-05  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_4433  CDS  NC_004578  5001041  5001958  918  sulfate adenylate transferase, subunit 2  NP_794187  unclonable  3.25655e-07  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_5649  ncRNA  NC_004578  1058888  1059034  147  prrF    unclonable  8.70099e-09  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
PSPTO_5657  ncRNA  NC_004578  3549457  3549603  147  prrF2    unclonable  6.64102e-09  n/a    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>