123 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BCE_0087  CDS  NC_003909  97325  98782  1458  glutamyl-tRNA synthetase  NP_976415  unclonable  5.36948e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0093  CDS  NC_003909  102990  103649  660  RNA polymerase factor sigma-70  NP_976421  unclonable  4.40627e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0094  CDS  NC_003909  103777  103923  147  50S ribosomal protein L33  NP_976422  unclonable  2.58554e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0095  CDS  NC_003909  103956  104135  180  preprotein translocase subunit SecE  NP_976423  unclonable  2.31467e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0096  CDS  NC_003909  104267  104800  534  transcription antitermination protein NusG  NP_976424  unclonable  2.61698e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0097  CDS  NC_003909  104968  105393  426  50S ribosomal protein L11  NP_976425  unclonable  2.12022e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0098  CDS  NC_003909  105571  106263  693  50S ribosomal protein L1  NP_976426  unclonable  6.78721e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0104  CDS  NC_003909  115656  115937  282  hypothetical protein  NP_976432  unclonable  2.88714e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0107  CDS  NC_003909  117181  119259  2079  elongation factor G  NP_976435  unclonable  1.43993e-06  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0108  CDS  NC_003909  119377  120564  1188  elongation factor Tu  NP_976436  unclonable  7.7853e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0109  CDS  NC_003909  120965  121273  309  30S ribosomal protein S10  NP_976437  unclonable  8.77818e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0110  CDS  NC_003909  121308  121940  633  50S ribosomal protein L3  NP_976438  unclonable  5.28056e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0111  CDS  NC_003909  121966  122589  624  50S ribosomal protein L4  NP_976439  unclonable  5.72324e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0112  CDS  NC_003909  122589  122879  291  50S ribosomal protein L23  NP_976440  unclonable  8.86787e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0113  CDS  NC_003909  122908  123738  831  50S ribosomal protein L2  NP_976441  unclonable  2.00839e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0114  CDS  NC_003909  123799  124077  279  30S ribosomal protein S19  NP_976442  unclonable  7.93752e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0115  CDS  NC_003909  124095  124436  342  50S ribosomal protein L22  NP_976443  unclonable  8.18335e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0123  CDS  NC_003909  127371  127556  186  30S ribosomal protein S14  NP_976451  unclonable  1.76609e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0124  CDS  NC_003909  127586  127984  399  30S ribosomal protein S8  NP_976452  unclonable  5.99604e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0133  CDS  NC_003909  132965  133183  219  translation initiation factor IF-1  NP_976461  unclonable  1.19555e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0134  CDS  NC_003909  133219  133332  114  50S ribosomal protein L36  NP_976462  unclonable  8.09318e-12  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0135  CDS  NC_003909  133354  133719  366  30S ribosomal protein S13  NP_976463  unclonable  3.32211e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0197  CDS  NC_003909  204469  205281  813  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  NP_976525  unclonable  6.6517e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0263  CDS  NC_003909  262378  263793  1416  amino acid permease  NP_976591  unclonable  3.58452e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0369  CDS  NC_003909  388754  389902  1149  restriction endonuclease, putative  NP_976697  unclonable  2.00287e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0375  CDS  NC_003909  393769  394857  1089  hypothetical protein  NP_976703  unclonable  1.23702e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0376  CDS  NC_003909  394909  395457  549  hypothetical protein  NP_976704  unclonable  4.3617e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0382  CDS  NC_003909  399794  400546  753  phage antirepressor protein, putative  NP_976710  unclonable  7.07014e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0554  CDS  NC_003909  565387  566880  1494  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component, putative  NP_976881  unclonable  8.78879e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0597  CDS  NC_003909  613446  614222  777  penicillin-binding domain-containing protein  NP_976924  unclonable  1.08833e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0614  CDS  NC_003909  631228  632778  1551  glycine betaine transporter  NP_976940  unclonable  1.5754e-07  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0714  CDS  NC_003909  737076  737633  558  RNA polymerase sigma factor  NP_977039  unclonable  2.48853e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0740  CDS  NC_003909  763103  765502  2400  immune inhibitor A metalloprotease  NP_977065  unclonable  1.42513e-05  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0744  CDS  NC_003909  768953  769804  852  phospholipase C  NP_977069  unclonable  1.41243e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0757  CDS  NC_003909  781246  782631  1386  proton/peptide symporter family protein  NP_977082  unclonable  3.69558e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0758  CDS  NC_003909  782823  782921  99  hypothetical protein  NP_977083  unclonable  2.5335e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0794  CDS  NC_003909  827353  828507  1155  M24/M37 family peptidase  NP_977118  unclonable  1.1526e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0878  CDS  NC_003909  903826  905460  1635  Na/Pi-cotransporter family protein  NP_977201  unclonable  2.42556e-07  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_0984  CDS  NC_003909  1009891  1011480  1590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  NP_977307  unclonable  8.10888e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1055  CDS  NC_003909  1077885  1078235  351  hypothetical protein  NP_977378  unclonable  7.25313e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1126  CDS  NC_003909  1132773  1134455  1683  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  NP_977449  unclonable  2.04459e-07  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1232  CDS  NC_003909  1243049  1243252  204  cold shock protein CspA  NP_977554  unclonable  3.25579e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1269  CDS  NC_003909  1278483  1279718  1236  ammonium transporter  NP_977590  unclonable  2.00287e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1270  CDS  NC_003909  1279932  1281233  1302  alpha-amylase family protein  NP_977591  unclonable  4.43122e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1353  CDS  NC_003909  1357555  1359033  1479  sodium/proline symporter family protein  NP_977674  unclonable  7.18577e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1554  CDS  NC_003909  1527541  1528812  1272  M24/M37 family peptidase  NP_977875  unclonable  1.52765e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1556  CDS  NC_003909  1530649  1531167  519  hypothetical protein  NP_977877  unclonable  2.59051e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1557  CDS  NC_003909  1531323  1532804  1482  Na+/H+ antiporter family protein  NP_977878  unclonable  4.08774e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1611  CDS  NC_003909  1580921  1581433  513  CAAX amino terminal protease family protein  NP_977932  unclonable  1.56991e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1617  CDS  NC_003909  1584597  1585883  1287  glutamate dehydrogenase  NP_977938  unclonable  3.88705e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_1889  CDS  NC_003909  1822662  1823906  1245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  NP_978205  unclonable  2.70589e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2073  CDS  NC_003909  2002489  2003649  1161  protease, putative  NP_978386  unclonable  1.21211e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2226  CDS  NC_003909  2129043  2129774  732  hypothetical protein  NP_978538  unclonable  1.0453e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2269  CDS  NC_003909  2176830  2177465  636  azoreductase  NP_978580  unclonable  6.07817e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2270  CDS  NC_003909  2177576  2178295  720  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  NP_978581  unclonable  1.19102e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2271  CDS  NC_003909  2178334  2179053  720  hemolysin III  NP_978582  unclonable  1.42686e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2515  CDS  NC_003909  2398275  2398682  408  hypothetical protein  NP_978824  unclonable  1.12808e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2516  CDS  NC_003909  2398971  2399753  783  hypothetical protein  NP_978825  unclonable  8.21985e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2571  CDS  NC_003909  2446627  2449302  2676  neutral protease A, bacillolysin  NP_978879  unclonable  4.42231e-05  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2839  CDS  NC_003909  2678823  2680892  2070  uvrD/Rep helicase family protein  NP_979143  unclonable  1.85117e-06  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_2979  CDS  NC_003909  2786753  2787580  828  hypothetical protein  NP_979282  unclonable  1.65918e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3033  CDS  NC_003909  2845024  2845773  750  IclR family transcriptional regulator  NP_979336  unclonable  4.87376e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3034  CDS  NC_003909  2845924  2847465  1542  amino acid permease family protein  NP_979337  unclonable  7.78692e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3037  CDS  NC_003909  2850297  2852681  2385  proteinase  NP_979340  unclonable  2.11319e-05  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3488  CDS  NC_003909  3244453  3245217  765  hypothetical protein  NP_979786  unclonable  4.82446e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3553  CDS  NC_003909  3304422  3304622  201  cold shock protein CspB  NP_979850  unclonable  9.60966e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3554  CDS  NC_003909  3304839  3305738  900  BNR repeat-containing protein  NP_979851  unclonable  3.74039e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3555  CDS  NC_003909  3305755  3306198  444  flavodoxin  NP_979852  unclonable  1.42004e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3556  CDS  NC_003909  3306324  3306944  621  hypothetical protein  NP_979853  unclonable  3.10297e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3716  CDS  NC_003909  3467812  3468033  222  hypothetical protein  NP_980013  unclonable  3.93903e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3717  CDS  NC_003909  3468112  3468552  441  hypothetical protein  NP_980014  unclonable  1.10555e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3741  CDS  NC_003909  3491422  3492375  954  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  NP_980038  unclonable  1.67613e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3744  CDS  NC_003909  3494145  3496001  1857  PTS system, fructose-specific IIABC component  NP_980041  unclonable  4.05115e-07  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3756  CDS  NC_003909  3505457  3505729  273  DNA-binding protein HU  NP_980053  unclonable  2.31467e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3795  CDS  NC_003909  3537926  3538723  798  cell wall hydrolase, putative  NP_980092  unclonable  1.05599e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3814  CDS  NC_003909  3563035  3564393  1359  recombinase A  NP_980111  unclonable  3.88705e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3828  CDS  NC_003909  3578272  3580653  2382  stage III sporulation protein E  NP_980125  unclonable  1.34118e-05  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3837  CDS  NC_003909  3585242  3586474  1233  aspartate kinase I  NP_980134  unclonable  2.73355e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3868  CDS  NC_003909  3617474  3618175  702  30S ribosomal protein S2  NP_980165  unclonable  5.60898e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3869  CDS  NC_003909  3618524  3619303  780  transcriptional repressor CodY  NP_980166  unclonable  7.36114e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3875  CDS  NC_003909  3623701  3625779  2079  DNA topoisomerase I  NP_980172  unclonable  2.21974e-06  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3882  CDS  NC_003909  3631546  3631890  345  50S ribosomal protein L19  NP_980179  unclonable  1.43455e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3883  CDS  NC_003909  3632037  3632771  735  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  NP_980180  unclonable  1.51535e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3884  CDS  NC_003909  3632771  3633286  516  16S rRNA-processing protein RimM  NP_980181  unclonable  3.98495e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3885  CDS  NC_003909  3633408  3633641  234  KH domain-containing protein  NP_980182  unclonable  8.01997e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3886  CDS  NC_003909  3633650  3633922  273  30S ribosomal protein S16  NP_980183  unclonable  7.93752e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3887  CDS  NC_003909  3634023  3635372  1350  signal recognition particle protein  NP_980184  unclonable  3.47799e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3896  CDS  NC_003909  3644360  3644953  594  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  NP_980193  unclonable  1.71057e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3900  CDS  NC_003909  3649820  3650008  189  50S ribosomal protein L28  NP_980197  unclonable  7.17977e-11  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_3948  CDS  NC_003909  3698584  3699453  870  sporulation sigma factor SigG  NP_980243  unclonable  1.96829e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4141  CDS  NC_003909  3866671  3868197  1527  sodium-dependent symporter family protein  NP_980434  unclonable  9.62307e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4248  CDS  NC_003909  3961116  3961955  840  hemolysin A  NP_980541  unclonable  8.72961e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4324  CDS  NC_003909  4012160  4013554  1395  sodium:dicarboxylate symporter family protein  NP_980617  unclonable  4.95156e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4366  CDS  NC_003909  4050600  4051910  1311  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  NP_980659  unclonable  1.10703e-08  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4372  CDS  NC_003909  4056642  4057769  1128  RNA polymerase sigma factor RpoD  NP_980665  unclonable  6.24256e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4394  CDS  NC_003909  4074818  4075933  1116  chaperone protein DnaJ  NP_980687  unclonable  4.85596e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4484  CDS  NC_003909  4153657  4154424  768  hesA/moeB/thiF family protein  NP_980777  unclonable  6.92664e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4502  CDS  NC_003909  4172546  4173685  1140  queuine tRNA-ribosyltransferase  NP_980795  unclonable  5.75969e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4604  CDS  NC_003909  4267501  4268295  795  Type II restriction endonuclease, putative  NP_980897  unclonable  2.26675e-09  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
BCE_4712  CDS  NC_003909  4365163  4365555  393  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  NP_981005  unclonable  1.87984e-10  n/a    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>