150 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
SAG0051  CDS  NC_004116  66825  67205  381  MORN motif-containing protein  NP_687087  unclonable  2.39093e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0052  CDS  NC_004116  67202  68980  1779  hypothetical protein  NP_687088  unclonable  0.000983267  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0053  CDS  NC_004116  69250  71892  2643  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  NP_687089  unclonable  0.00824493  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0054  CDS  NC_004116  72071  73087  1017  alcohol dehydrogenase  NP_687090  unclonable  6.3384e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0108  CDS  NC_004116  117633  118559  927  hypothetical protein  NP_687144  unclonable  2.48564e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0113  CDS  NC_004116  123041  124495  1455  glutamyl-tRNA synthetase  NP_687149  unclonable  0.000311302  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0129  CDS  NC_004116  138990  139178  189  50S ribosomal protein L28  NP_687165  unclonable  3.11049e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0130  CDS  NC_004116  139310  139675  366  hypothetical protein  NP_687166  unclonable  4.09279e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0136  CDS  NC_004116  144329  145879  1551  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein/permease protein  NP_687172  unclonable  0.000337877  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0147  CDS  NC_004116  157648  158883  1236  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  NP_687183  unclonable  7.845e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0148  CDS  NC_004116  159124  160779  1656  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  NP_687184  unclonable  0.000587403  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0172  CDS  NC_004116  193424  194089  666  protease, putative  NP_687207  unclonable  1.01892e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0260  CDS  NC_004116  267645  268361  717  ABC transporter, ATP-binding protein  NP_687295  unclonable  1.46773e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0266  CDS  NC_004116  271678  272826  1149  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  NP_687301  unclonable  0.000106441  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0302  CDS  NC_004116  311317  311649  333  cell division protein GpsB  NP_687337  unclonable  3.77139e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0360  CDS  NC_004116  371857  372669  813  PTS system, mannose-specific IIC component  NP_687394  unclonable  2.69759e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0398  CDS  NC_004116  406906  407445  540  BioY family protein  NP_687432  unclonable  9.49175e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0399  CDS  NC_004116  407584  408360  777  AtsA/ElaC family protein  NP_687433  unclonable  1.65635e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0400  CDS  NC_004116  408360  408866  507  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  NP_687434  unclonable  7.50433e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0401  CDS  NC_004116  408968  409102  135  hypothetical protein  NP_687435  unclonable  2.13904e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0402  CDS  NC_004116  409138  410487  1350  glucose-6-phosphate isomerase  NP_687436  unclonable  0.000236735  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0441  CDS  NC_004116  456126  456437  312  hypothetical protein  NP_687472  unclonable  2.8095e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0449  CDS  NC_004116  464852  465916  1065  hypothetical protein  NP_687480  unclonable  3.97187e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0450  CDS  NC_004116  466030  467022  993  asparagine synthetase AsnA  NP_687481  unclonable  3.14133e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0488  CDS  NC_004116  501870  504131  2262  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  NP_687518  unclonable  0.00725796  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0491  CDS  NC_004116  504801  505493  693  amino acid ABC transporter, permease protein  NP_687521  unclonable  1.98933e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0505  CDS  NC_004116  517969  518244  276  DNA-binding protein HU  NP_687535  unclonable  1.81795e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0506  CDS  NC_004116  518441  518638  198  hypothetical protein  NP_687536  unclonable  1.76345e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0507  CDS  NC_004116  518682  519614  933  dihydroorotate dehydrogenase 1A  NP_687537  unclonable  3.69994e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0524  CDS  NC_004116  538679  541186  2508  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  NP_687553  unclonable  0.00517102  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0539  CDS  NC_004116  554829  555272  444  flavodoxin  NP_687568  unclonable  7.06098e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0547  CDS  NC_004116  560334  560891  558  hypothetical protein  NP_687576  unclonable  4.66929e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0548  CDS  NC_004116  560893  561690  798  prophage LambdaSa1, repressor protein, putative  NP_687577  unclonable  1.27482e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0623  CDS  NC_004116  611651  613603  1953  DNA gyrase subunit B  NP_687647  unclonable  0.00302751  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0624  CDS  NC_004116  613697  615421  1725  septation ring formation regulator EzrA  NP_687648  unclonable  0.00118243  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0627  CDS  NC_004116  616675  617130  456  hypothetical protein  NP_687651  unclonable  9.0207e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0686  CDS  NC_004116  677555  678340  786  DNA-entry nuclease, putative  NP_687702  unclonable  2.69759e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0707  CDS  NC_004116  699851  700855  1005  RegM family transcriptional regulator  NP_687722  unclonable  4.62743e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0718  CDS  NC_004116  712240  712995  756  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  NP_687733  unclonable  1.10627e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0762  CDS  NC_004116  757604  758800  1197  elongation factor Tu  NP_687777  unclonable  0.000170202  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0770  CDS  NC_004116  767630  768316  687  hypothetical protein  NP_687785  unclonable  1.15194e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0771  CDS  NC_004116  768495  770033  1539  cell wall surface anchor family protein  NP_687786  unclonable  0.000478369  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0808  CDS  NC_004116  807332  808261  930  foldase protein PrsA  NP_687823  unclonable  2.78355e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0843  CDS  NC_004116  841645  842904  1260  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  NP_687858  unclonable  7.76334e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0853  CDS  NC_004116  853443  855311  1869  glycogen branching enzyme  NP_687868  unclonable  0.00164465  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0876  CDS  NC_004116  881804  883180  1377  tRNA modification GTPase TrmE  NP_687890  unclonable  0.000254143  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0946  CDS  NC_004116  953605  953934  330  phnA protein  NP_687958  unclonable  3.17474e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0947  CDS  NC_004116  954069  954710  642  amino acid ABC transporter, permease protein  NP_687959  unclonable  9.9829e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0960  CDS  NC_004116  966643  969102  2460  DNA gyrase subunit A  NP_687972  unclonable  0.00632258  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0965  CDS  NC_004116  972846  973229  384  IS1381 transposase protein A  NP_687977  unclonable  4.00817e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0966  CDS  NC_004116  973262  973651  390  IS1381 transposase protein B  NP_687978  unclonable  4.81364e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG0993  CDS  NC_004116  1002308  1003618  1311  NOL1/NOP2/sun family protein  NP_688004  unclonable  0.000219997  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1002  CDS  NC_004116  1009537  1010415  879  protease, putative  NP_688013  unclonable  8.25875e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1005  CDS  NC_004116  1014001  1016121  2121  DNA topoisomerase I  NP_688016  unclonable  0.00429671  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1049  CDS  NC_004116  1058869  1060410  1542  ABC transporter, ATP-binding protein  NP_688059  unclonable  0.000311302  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1050    NC_004116  1060541  1060879  339      unclonable  3.44373e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1090  CDS  NC_004116  1097922  1099922  2001  potassium uptake protein, putative  NP_688099  unclonable  0.00180767  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1092  CDS  NC_004116  1100881  1101873  993  phosphotransacetylase  NP_688101  unclonable  2.7546e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1134  CDS  NC_004116  1139034  1139675  642  GntR family transcriptional regulator  NP_688143  unclonable  1.05089e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1142  CDS  NC_004116  1143007  1145286  2280  ATP-dependent DNA helicase PcrA  NP_688151  unclonable  0.00645373  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1144  CDS  NC_004116  1145911  1147236  1326  uracil permease  NP_688153  unclonable  0.00015053  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1150  CDS  NC_004116  1152810  1154012  1203  30S ribosomal protein S1  NP_688159  unclonable  0.000136012  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1151  CDS  NC_004116  1154356  1154586  231  hypothetical protein  NP_688160  unclonable  2.29617e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1153  CDS  NC_004116  1155806  1158265  2460  DNA topoisomerase IV subunit A  NP_688162  unclonable  0.00798408  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1224  CDS  NC_004116  1234712  1236052  1341  MATE efflux family protein  NP_688231  unclonable  0.000144559  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1225  CDS  NC_004116  1236152  1236562  411  hypothetical protein  NP_688232  unclonable  4.43563e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1226  CDS  NC_004116  1236572  1237069  498  hypothetical protein  NP_688233  unclonable  6.31981e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1227  CDS  NC_004116  1237291  1237887  597  hypothetical protein  NP_688234  unclonable  8.2221e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1233  CDS  NC_004116  1241015  1243483  2469  streptococcal histidine triad family protein  NP_688238  unclonable  0.00703595  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1234  CDS  NC_004116  1243496  1244416  921  laminin-binding surface protein  NP_688239  unclonable  4.44188e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1279  CDS  NC_004116  1283368  1283667  300  hypothetical protein  NP_688279  unclonable  2.05244e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1297  CDS  NC_004116  1308706  1310061  1356  C-5 cytosine-specific DNA methylase  NP_688295  unclonable  0.000219997  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1302  CDS  NC_004116  1311826  1312326  501  50S ribosomal protein L10  NP_688300  unclonable  7.6628e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1306  CDS  NC_004116  1315909  1317285  1377  amino acid permease  NP_688304  unclonable  0.000234157  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1307  CDS  NC_004116  1317415  1318065  651  hypothetical protein  NP_688305  unclonable  1.36788e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1308  CDS  NC_004116  1318223  1318726  504  hypothetical protein  NP_688306  unclonable  6.9876e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1333  CDS  NC_004116  1340840  1342912  2073  5'-nucleotidase family protein  NP_688331  unclonable  0.00306106  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1358  CDS  NC_004116  1368946  1369218  273  30S ribosomal protein S16  NP_688356  unclonable  5.11359e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1368  CDS  NC_004116  1378706  1378990  285  50S ribosomal protein L27  NP_688366  unclonable  2.72527e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1369  CDS  NC_004116  1379021  1379359  339  hypothetical protein  NP_688367  unclonable  3.30577e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1370  CDS  NC_004116  1379366  1379680  315  50S ribosomal protein L21  NP_688368  unclonable  2.86753e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1371  CDS  NC_004116  1379870  1381048  1179  hypothetical protein  NP_688369  unclonable  0.000119096  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1372  CDS  NC_004116  1381150  1382364  1215  thiamine biosynthesis protein ThiI  NP_688370  unclonable  0.000114319  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1385  CDS  NC_004116  1394227  1394910  684  cytidylate kinase  NP_688383  unclonable  1.16404e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1386  CDS  NC_004116  1394921  1395445  525  hypothetical protein  NP_688384  unclonable  8.39573e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1421  CDS  NC_004116  1432941  1433672  732  glycosyl transferase, group 2 family protein  NP_688418  unclonable  8.39573e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1428  CDS  NC_004116  1440385  1440762  378  large conductance mechanosensitive channel protein  NP_688425  unclonable  4.61871e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1429  CDS  NC_004116  1440859  1441035  177  30S ribosomal protein S21  NP_688426  unclonable  2.09576e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1430  CDS  NC_004116  1441139  1441642  504  hypothetical protein  NP_688427  unclonable  8.92693e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1431  CDS  NC_004116  1441725  1442531  807  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  NP_688428  unclonable  2.84109e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1436  CDS  NC_004116  1446755  1448128  1374  glycerol-3-phosphate transporter, putative  NP_688433  unclonable  0.000217705  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1444  CDS  NC_004116  1457503  1458975  1473  proton/peptide symporter family protein  NP_688441  unclonable  0.000293034  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1480  CDS  NC_004116  1500261  1501649  1389  amino acid permease  NP_688474  unclonable  0.000231717  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1482  CDS  NC_004116  1502203  1504608  2406  VacB/Rnb family exoribonuclease  NP_688476  unclonable  0.0098629  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1483  CDS  NC_004116  1504721  1504957  237  preprotein translocase subunit SecG  NP_688477  unclonable  4.05026e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1484  CDS  NC_004116  1505004  1505150  147  50S ribosomal protein L33  NP_688478  unclonable  2.98588e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1518  CDS  NC_004116  1530169  1531785  1617  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  NP_688512  unclonable  0.000374669  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1523  CDS  NC_004116  1536544  1537758  1215  M20/M25/M40 family peptidase  NP_688517  unclonable  0.000131931  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1533  CDS  NC_004116  1547790  1548716  927  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  NP_688527  unclonable  2.1133e-05  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
SAG1534  CDS  NC_004116  1548883  1549530  648  iron-dependent transcriptional regulator  NP_688528  unclonable  8.30846e-06  n/a    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>