30 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Pfl01_0006  CDS  NC_007492  7716  9257  1542  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  YP_345739  unclonable  2.67267e-11  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0007  CDS  NC_007492  9415  10239  825  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_345740  unclonable  6.02556e-13  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_0307  CDS  NC_007492  353183  353998  816  methyltransferase FkbM  YP_346040  unclonable  3.76535e-13  normal  0.78325  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_1658  CDS  NC_007492  1847114  1847437  324  hypothetical protein  YP_347390  unclonable  9.57137e-15  decreased coverage  0.00112349  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_1672  CDS  NC_007492  1865557  1866012  456  hypothetical protein  YP_347404  unclonable  1.29043e-13  normal  0.0587565  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2383  CDS  NC_007492  2741796  2743784  1989  peptidase U32  YP_348115  normal  unclonable  4.37173e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2384  CDS  NC_007492  2743845  2745155  1311  major facilitator transporter  YP_348116  normal  unclonable  3.40178e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2385  CDS  NC_007492  2745510  2746535  1026  transcriptional regulator  YP_348117  normal  0.259464  unclonable  3.72406e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2386  CDS  NC_007492  2746557  2747621  1065  Alpha/beta hydrolase fold  YP_348118  normal  0.250689  unclonable  3.87671e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2387  CDS  NC_007492  2747842  2748096  255  hypothetical protein  YP_348119  normal  0.137385  unclonable  2.92693e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2388  CDS  NC_007492  2748193  2749029  837  AraC family transcriptional regulator  YP_348120  normal  0.262251  unclonable  3.40178e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2684  CDS  NC_007492  3088049  3091135  3087  Outer membrane autotransporter barrel  YP_348415  normal  0.335444  unclonable  3.68637e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2685  CDS  NC_007492  3091193  3092881  1689  triacylglycerol lipase  YP_348416  normal  0.871664  unclonable  2.37171e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_2686  CDS  NC_007492  3092982  3094835  1854  lipase, class 3  YP_348417  normal  0.458877  unclonable  2.92693e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_3190  CDS  NC_007492  3668385  3669464  1080  ATPase domain-containing protein  YP_348919  unclonable  7.97397e-13  unclonable  4.9795e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_4793  CDS  NC_007492  5409193  5410749  1557  hypothetical protein  YP_350521  hitchhiker  0.000600328  unclonable  2.72859e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_4794  CDS  NC_007492  5410841  5411185  345  pentapeptide repeat-containing protein  YP_350522  hitchhiker  1.03308e-07  unclonable  2.08152e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_4795  CDS  NC_007492  5411405  5411677  273  TfoX-like  YP_350523  hitchhiker  1.50833e-08  unclonable  2.06045e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_4796  CDS  NC_007492  5411693  5412484  792  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  YP_350524  hitchhiker  3.70555e-12  unclonable  2.16721e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_4797  CDS  NC_007492  5412711  5413562  852  hypothetical protein  YP_350525  unclonable  1.15582e-13  unclonable  2.08152e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_4918  CDS  NC_007492  5540845  5541765  921  histone deacetylase superfamily protein  YP_350646  unclonable  2.73279e-13  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5064  CDS  NC_007492  5697899  5698432  534  50S ribosomal protein L6  YP_350792  unclonable  9.65255e-14  normal  0.133122  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5065  CDS  NC_007492  5698445  5698837  393  30S ribosomal protein S8  YP_350793  unclonable  4.51262e-14  normal  0.127719  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5066  CDS  NC_007492  5699047  5699352  306  30S ribosomal protein S14  YP_350794  unclonable  1.67621e-14  normal  0.114431  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5067  CDS  NC_007492  5699366  5699905  540  50S ribosomal protein L5  YP_350795  unclonable  5.62403e-14  normal  0.121811  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5068  CDS  NC_007492  5699926  5700240  315  50S ribosomal protein L24  YP_350796  unclonable  1.62639e-14  normal  0.122565  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5069  CDS  NC_007492  5700252  5700620  369  50S ribosomal protein L14  YP_350797  unclonable  1.72755e-14  normal  0.126935  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5099  CDS  NC_007492  5733436  5734947  1512  peptidase M23B  YP_350827  unclonable  1.86305e-11  normal  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5181  CDS  NC_007492  5827109  5827996  888  RarD protein  YP_350909  unclonable  1.81331e-13  normal  0.141075  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Pfl01_5219  CDS  NC_007492  5869683  5873135  3453  glucose-methanol-choline oxidoreductase  YP_350947  hitchhiker  4.90282e-05  unclonable  7.21023e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>