17 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Psyr_0762  CDS  NC_007005  867577  868851  1275  extracellular solute-binding protein  YP_233858  unclonable  2.77245e-06  normal  0.855778  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
 
Psyr_0840  CDS  NC_007005  951821  952165  345  pentapeptide repeat-containing protein  YP_233936  unclonable  4.9264e-09  decreased coverage  6.26764e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
 
Psyr_1406  CDS  NC_007005  1592180  1593955  1776  aspartyl-tRNA synthetase  YP_234495  unclonable  2.71682e-05  normal  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_1595  CDS  NC_007005  1794461  1794913  453  hypothetical protein  YP_234681  unclonable  4.50152e-09  normal  0.0299142  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_2097  CDS  NC_007005  2444715  2445749  1035  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  YP_235178  unclonable  1.82424e-07  decreased coverage  0.00163672  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_2148  CDS  NC_007005  2505150  2505851  702  deoxyribonuclease I  YP_235229  unclonable  1.04352e-08  normal  0.178715  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_3022  CDS  NC_007005  3619950  3620417  468  regulatory proteins, AsnC/Lrp  YP_236094  unclonable  2.42064e-09  normal  0.0404205  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_3157  CDS  NC_007005  3783012  3784595  1584  aldehyde dehydrogenase  YP_236227  unclonable  8.09211e-06  normal  0.137723  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_3410  CDS  NC_007005  4073399  4076032  2634  hypothetical protein  YP_236480  unclonable  0.00835296  normal  0.27975  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_3626  CDS  NC_007005  4309580  4310053  474  regulatory protein, MarR  YP_236696  unclonable  2.1465e-09  normal  0.0936579  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_3627  CDS  NC_007005  4310244  4310663  420  OsmC-like protein  YP_236697  unclonable  1.86572e-09  normal  0.0859541  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
 
Psyr_4187  CDS  NC_007005  4979980  4981884  1905  peptidase M41, FtsH  YP_237255  unclonable  0.000128423  normal  0.66671  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_4561  CDS  NC_007005  5419660  5420028  369  preprotein translocase subunit SecE  YP_237629  unclonable  4.32419e-09  normal  0.440887  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_4581  CDS  NC_007005  5443049  5443648  600  anthranilate synthase component II  YP_237649  unclonable  1.48168e-08  normal  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_5056  CDS  NC_007005  5998600  6000162  1563  regulatory protein, GntR  YP_238121  unclonable  1.52055e-05  normal  0.949132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_RNA66  tRNA  NC_007005  5420075  5420150  76  tRNA-Trp    unclonable  4.64617e-10  normal  0.636582  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Psyr_RNA9  tRNA  NC_007005  835185  835260  76  tRNA-Asn    unclonable  3.14512e-10  normal  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>