54 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
HS_0059  CDS  NC_008309  63460  64086  627  50S ribosomal protein L3  YP_718265  unclonable  1.58228e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0060  CDS  NC_008309  64102  64704  603  50S ribosomal protein L4  YP_718266  unclonable  1.07913e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0061  CDS  NC_008309  64701  65006  306  50S ribosomal protein L23  YP_718267  unclonable  1.05028e-10  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0062  CDS  NC_008309  65027  65848  822  50S ribosomal protein L2  YP_718268  unclonable  3.94369e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0070  CDS  NC_008309  71086  71457  372  50S ribosomal protein L14  YP_718276  unclonable  1.46326e-10  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0095  CDS  NC_008309  87921  90158  2238  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  YP_718302  unclonable  0.000291848  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0117  CDS  NC_008309  105057  105977  921  acyltransferase  YP_718321  unclonable  1.25573e-08  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0118  CDS  NC_008309  105959  106426  468  hypothetical protein  YP_718322  unclonable  4.49189e-10  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0195  CDS  NC_008309  175770  176954  1185  elongation factor Tu  YP_718402  unclonable  8.54566e-08  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0256  CDS  NC_008309  253414  254979  1566  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit I  YP_718464  unclonable  1.01407e-06  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0328  CDS  NC_008309  325053  325913  861  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  YP_718536  unclonable  6.51268e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0329  CDS  NC_008309  326040  326369  330  sulfite reductase-like protein  YP_718537  unclonable  1.1498e-10  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0330  CDS  NC_008309  326447  327109  663  integral membrane protein  YP_718538  unclonable  1.28049e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0338  CDS  NC_008309  335169  336857  1689  putative symporter YidK  YP_718546  unclonable  3.69581e-06  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0348  CDS  NC_008309  353182  354765  1584  carbon starvation protein A  YP_718558  unclonable  1.80552e-06  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0362  CDS  NC_008309  369596  370870  1275  cell division protein FtsA  YP_718572  unclonable  7.95904e-08  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0363  CDS  NC_008309  371056  372171  1116  cell division protein FtsZ  YP_718573  unclonable  2.81943e-08  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0464  CDS  NC_008309  494512  495141  630  superoxide dismutase, manganese  YP_718675  unclonable  1.02594e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0511  CDS  NC_008309  550922  552367  1446  glycerol 3-phosphate transporter  YP_718722  unclonable  6.1877e-07  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0582  CDS  NC_008309  616932  619298  2367  heme uptake protein  YP_718794  unclonable  0.000461965  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0624  CDS  NC_008309  670750  671370  621  disulfide bond formation protein B  YP_718836  unclonable  7.50855e-10  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0684  CDS  NC_008309  730010  730309  300  cell division protein ZapA  YP_718896  unclonable  5.36576e-11  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0701  CDS  NC_008309  743326  744378  1053  TRAP dicarboxylate transporter, periplasmic component  YP_718913  unclonable  2.67748e-08  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0749  CDS  NC_008309  803777  804697  921  ribokinase  YP_718959  unclonable  7.20941e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0767  CDS  NC_008309  822127  823065  939  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  YP_718977  unclonable  1.73406e-08  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0768  CDS  NC_008309  823280  824770  1491  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  YP_718978  unclonable  1.05666e-06  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0856  CDS  NC_008309  932597  932806  210  cold-shock DNA-binding protein family protein  YP_719066  unclonable  1.89352e-11  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0857  CDS  NC_008309  932878  933324  447  hypothetical protein  YP_719067  unclonable  1.17366e-10  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0874  CDS  NC_008309  954122  954727  606  hypothetical protein  YP_719084  unclonable  9.56069e-10  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_0971  CDS  NC_008309  1070718  1071668  951  ompH family outer membrane protein  YP_719182  unclonable  9.4699e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1006  CDS  NC_008309  1107112  1108428  1317  lysine/cadaverine antiporter  YP_719217  unclonable  7.05878e-07  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1055  CDS  NC_008309  1161299  1162234  936  malate dehydrogenase  YP_719267  unclonable  6.18832e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1076  CDS  NC_008309  1192980  1194053  1074  homoserine O-acetyltransferase  YP_719288  unclonable  3.73874e-08  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1120  CDS  NC_008309  1255786  1258410  2625  alanyl-tRNA synthetase  YP_719332  unclonable  0.00495062  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1127  CDS  NC_008309  1264599  1265654  1056  rod shape-determining protein MreB  YP_719339  unclonable  2.27657e-08  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1160  CDS  NC_008309  1310334  1311419  1086  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  YP_719372  unclonable  3.02553e-08  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1163  CDS  NC_008309  1315768  1318413  2646  DNA gyrase subunit A  YP_719375  unclonable  0.00841835  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1186  CDS  NC_008309  1336965  1339676  2712  DNA translocase FtsK  YP_719398  unclonable  0.00816417  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1265  CDS  NC_008309  1450879  1451508  630  outer membrane protein precursor  YP_719477  unclonable  1.28049e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1291  CDS  NC_008309  1479422  1480291  870  Dna-J like membrane chaperone protein  YP_719503  unclonable  6.51268e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1306  CDS  NC_008309  1494813  1496891  2079  iron-regulated outer membrane protein  YP_719518  unclonable  6.56516e-05  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1309  CDS  NC_008309  1498984  1499313  330  hypothetical protein  YP_719521  unclonable  2.43937e-10  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1387  CDS  NC_008309  1585825  1586151  327  hypothetical protein  YP_719599  unclonable  1.95659e-10  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1388  CDS  NC_008309  1586124  1586660  537  lysozyme, phage-related lysozyme  YP_719600  unclonable  5.77391e-10  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1538  CDS  NC_008309  1736080  1736355  276  DNA-binding protein HU  YP_719743  unclonable  6.76058e-11  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1561  CDS  NC_008309  1759227  1759817  591  bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase  YP_719766  unclonable  1.34759e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1562  CDS  NC_008309  1759927  1761177  1251  tryptophan-specific transport protein  YP_719767  unclonable  3.04843e-07  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1563  CDS  NC_008309  1761577  1762494  918  hypothetical protein  YP_719768  unclonable  1.59898e-08  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1584  CDS  NC_008309  1798287  1799783  1497  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  YP_719789  unclonable  1.21824e-06  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1655  CDS  NC_008309  1887245  1887994  750  VacJ lipoprotein  YP_719860  unclonable  3.71202e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1676  CDS  NC_008309  1906732  1907013  282  hypothetical protein  YP_719881  unclonable  6.36346e-11  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_1715  CDS  NC_008309  1941365  1942081  717  DNA transformation protein  YP_719920  unclonable  3.35694e-09  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_tHis01  tRNA  NC_008309  1395013  1395091  79  tRNA-His    unclonable  3.97081e-11  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
HS_tPro01  tRNA  NC_008309  1394930  1395009  80  tRNA-Pro    unclonable  4.13507e-11  n/a    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>