37 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
OEOE_0002  CDS  NC_008528  1528  2652  +  1125  DNA polymerase III, beta subunit  YP_809649  unclonable  0.00000374529  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0212  CDS  NC_008528  200008  201201  +  1194  hypothetical protein  YP_809865  unclonable  0.00000517482  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0349  CDS  NC_008528  341152  341904  -  753  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  YP_809986  unclonable  0.000000402346  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0350  CDS  NC_008528  342289  342609  +  321  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  YP_809987  unclonable  0.0000000162152  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0351  CDS  NC_008528  342633  342902  +  270  nickel resistance determinant  YP_809988  unclonable  0.0000000183122  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0352  CDS  NC_008528  343002  343205  -  204  hypothetical protein  YP_809989  unclonable  0.00000000934533  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0413  CDS  NC_008528  397092  398087  +  996  phosphoglycerate dehydrogenase or related dehydrogenase  YP_810037  unclonable  0.000000845131  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0455  CDS  NC_008528  442444  443592  +  1149  signal recognition particle-docking protein FtsY  YP_810077  unclonable  0.00000410251  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0555  CDS  NC_008528  534722  535588  +  867  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  YP_810165  unclonable  0.000000309892  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0587  CDS  NC_008528  563461  565707  +  2247  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  YP_810195  unclonable  0.00257021  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0594  CDS  NC_008528  573150  573458  +  309  SSU ribosomal protein S10P  YP_810201  unclonable  0.00000000677882  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0595  CDS  NC_008528  573484  574227  +  744  50S ribosomal protein L3P  YP_810202  unclonable  0.000000158145  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0596  CDS  NC_008528  574242  574865  +  624  50S ribosomal protein L4P  YP_810203  unclonable  0.0000000475036  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0597  CDS  NC_008528  574865  575164  +  300  50S ribosomal protein L23P  YP_810204  unclonable  0.00000000650952  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0598  CDS  NC_008528  575186  576025  +  840  50S ribosomal protein L2  YP_810205  unclonable  0.000000263643  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0599  CDS  NC_008528  576038  576319  +  282  SSU ribosomal protein S19P  YP_810206  unclonable  0.00000000698901  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0600  CDS  NC_008528  576330  576692  +  363  50S ribosomal protein L22  YP_810207  unclonable  0.0000000168861  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0630  CDS  NC_008528  592073  593191  +  1119  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  YP_810237  unclonable  0.00000125028  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0664  CDS  NC_008528  627389  628300  +  912  F0F1-type ATP synthase, gamma subunit  YP_810266  unclonable  0.000000644453  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0665  CDS  NC_008528  628315  629829  +  1515  F0F1 ATP synthase subunit beta  YP_810267  unclonable  0.000014903  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0697  CDS  NC_008528  656143  657450  +  1308  hypothetical protein  YP_810297  unclonable  0.00000533536  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0759  CDS  NC_008528  709406  711070  +  1665  major facilitator superfamily permease  YP_810354  unclonable  0.0000977825  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0975  CDS  NC_008528  906981  907763  +  783  SSU ribosomal protein S2P  YP_810549  unclonable  0.000000199149  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0996  CDS  NC_008528  930519  931895  +  1377  DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)  YP_810570  unclonable  0.0000205805  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1027  CDS  NC_008528  960719  963154  +  2436  DNA topoisomerase IV subunit A  YP_810601  unclonable  0.00772659  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1053  CDS  NC_008528  983187  983690  -  504  hypothetical protein  YP_810620  unclonable  0.0000000892414  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1200  CDS  NC_008528  1135972  1136598  +  627  hypothetical protein  YP_810758  unclonable  0.000000126846  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1316  CDS  NC_008528  1225089  1225502  -  414  30S ribosomal protein S12  YP_810853  unclonable  0.000000011083  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1342  CDS  NC_008528  1250916  1251404  -  489  phosphotransferase system IIA component  YP_810876  unclonable  0.0000000249807  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1343  CDS  NC_008528  1251644  1252159  -  516  lysophospholipase L1 or related esterase  YP_810877  unclonable  0.0000000279155  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1419  CDS  NC_008528  1331876  1332466  -  591  50S ribosomal protein L11P  YP_810945  unclonable  0.000000108032  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1426  CDS  NC_008528  1338323  1338727  -  405  ribonuclease III family protein  YP_810952  unclonable  0.0000000290705  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1567  CDS  NC_008528  1485157  1485624  -  468  hypothetical protein  YP_811086  unclonable  0.0000000168861  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1586  CDS  NC_008528  1504763  1505200  -  438  3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  YP_811103  unclonable  0.0000000412753  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1595  CDS  NC_008528  1511401  1511844  -  444  3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  YP_811112  unclonable  0.0000000254992  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1596  CDS  NC_008528  1512105  1513094  +  990  biotin operon repressor  YP_811113  unclonable  0.00000131655  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1806  CDS  NC_008528  1724397  1725803  +  1407  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  YP_811310  unclonable  0.0000163155  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>