37 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
OEOE_0002  CDS  NC_008528  1528  2652  1125  DNA polymerase III, beta subunit  YP_809649  unclonable  3.74529e-06  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0212  CDS  NC_008528  200008  201201  1194  hypothetical protein  YP_809865  unclonable  5.17482e-06  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0349  CDS  NC_008528  341152  341904  753  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  YP_809986  unclonable  4.02346e-07  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0350  CDS  NC_008528  342289  342609  321  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  YP_809987  unclonable  1.62152e-08  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0351  CDS  NC_008528  342633  342902  270  nickel resistance determinant  YP_809988  unclonable  1.83122e-08  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0352  CDS  NC_008528  343002  343205  204  hypothetical protein  YP_809989  unclonable  9.34533e-09  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0413  CDS  NC_008528  397092  398087  996  phosphoglycerate dehydrogenase or related dehydrogenase  YP_810037  unclonable  8.45131e-07  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0455  CDS  NC_008528  442444  443592  1149  signal recognition particle-docking protein FtsY  YP_810077  unclonable  4.10251e-06  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0555  CDS  NC_008528  534722  535588  867  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  YP_810165  unclonable  3.09892e-07  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0587  CDS  NC_008528  563461  565707  2247  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  YP_810195  unclonable  0.00257021  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0594  CDS  NC_008528  573150  573458  309  SSU ribosomal protein S10P  YP_810201  unclonable  6.77882e-09  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0595  CDS  NC_008528  573484  574227  744  50S ribosomal protein L3P  YP_810202  unclonable  1.58145e-07  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0596  CDS  NC_008528  574242  574865  624  50S ribosomal protein L4P  YP_810203  unclonable  4.75036e-08  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0597  CDS  NC_008528  574865  575164  300  50S ribosomal protein L23P  YP_810204  unclonable  6.50952e-09  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0598  CDS  NC_008528  575186  576025  840  50S ribosomal protein L2  YP_810205  unclonable  2.63643e-07  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0599  CDS  NC_008528  576038  576319  282  SSU ribosomal protein S19P  YP_810206  unclonable  6.98901e-09  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0600  CDS  NC_008528  576330  576692  363  50S ribosomal protein L22  YP_810207  unclonable  1.68861e-08  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0630  CDS  NC_008528  592073  593191  1119  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  YP_810237  unclonable  1.25028e-06  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0664  CDS  NC_008528  627389  628300  912  F0F1-type ATP synthase, gamma subunit  YP_810266  unclonable  6.44453e-07  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0665  CDS  NC_008528  628315  629829  1515  F0F1 ATP synthase subunit beta  YP_810267  unclonable  1.4903e-05  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0697  CDS  NC_008528  656143  657450  1308  hypothetical protein  YP_810297  unclonable  5.33536e-06  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0759  CDS  NC_008528  709406  711070  1665  major facilitator superfamily permease  YP_810354  unclonable  9.77825e-05  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0975  CDS  NC_008528  906981  907763  783  SSU ribosomal protein S2P  YP_810549  unclonable  1.99149e-07  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_0996  CDS  NC_008528  930519  931895  1377  DNA-directed RNA polymerase, sigma subunit (sigma70/sigma32)  YP_810570  unclonable  2.05805e-05  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1027  CDS  NC_008528  960719  963154  2436  DNA topoisomerase IV subunit A  YP_810601  unclonable  0.00772659  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1053  CDS  NC_008528  983187  983690  504  hypothetical protein  YP_810620  unclonable  8.92414e-08  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1200  CDS  NC_008528  1135972  1136598  627  hypothetical protein  YP_810758  unclonable  1.26846e-07  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1316  CDS  NC_008528  1225089  1225502  414  30S ribosomal protein S12  YP_810853  unclonable  1.1083e-08  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1342  CDS  NC_008528  1250916  1251404  489  phosphotransferase system IIA component  YP_810876  unclonable  2.49807e-08  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1343  CDS  NC_008528  1251644  1252159  516  lysophospholipase L1 or related esterase  YP_810877  unclonable  2.79155e-08  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1419  CDS  NC_008528  1331876  1332466  591  50S ribosomal protein L11P  YP_810945  unclonable  1.08032e-07  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1426  CDS  NC_008528  1338323  1338727  405  ribonuclease III family protein  YP_810952  unclonable  2.90705e-08  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1567  CDS  NC_008528  1485157  1485624  468  hypothetical protein  YP_811086  unclonable  1.68861e-08  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1586  CDS  NC_008528  1504763  1505200  438  3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  YP_811103  unclonable  4.12753e-08  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1595  CDS  NC_008528  1511401  1511844  444  3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  YP_811112  unclonable  2.54992e-08  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1596  CDS  NC_008528  1512105  1513094  990  biotin operon repressor  YP_811113  unclonable  1.31655e-06  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
OEOE_1806  CDS  NC_008528  1724397  1725803  1407  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  YP_811310  unclonable  1.63155e-05  n/a    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>