63 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CPF_0101  CDS  NC_008261  121682  122422  741  hypothetical protein  YP_694565  unclonable  7.5579e-09  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0102  CDS  NC_008261  122534  123406  873  hypothetical protein  YP_694566  unclonable  1.70522e-08  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0238  CDS  NC_008261  287113  289440  2328  GGDEF/EAL domain-containing protein  YP_694700  unclonable  6.52634e-05  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0277  CDS  NC_008261  332413  332652  240  AbrB family transcriptional regulator  YP_694737  unclonable  3.9637e-10  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0348  CDS  NC_008261  414446  415225  780  hypothetical protein  YP_694806  unclonable  1.32581e-08  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0359  CDS  NC_008261  429345  431828  2484  hypothetical protein  YP_694816  unclonable  0.000526889  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0360  CDS  NC_008261  432083  432409  327  hypothetical protein  YP_694817  unclonable  1.14826e-09  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0361  CDS  NC_008261  432472  434523  2052  type III restriction-modification system, Mod subunit  YP_694818  unclonable  3.61373e-05  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0471  CDS  NC_008261  557796  559688  1893  heparinase II/III-like protein  YP_694926  unclonable  5.00761e-06  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0472  CDS  NC_008261  559699  561078  1380  putative capK protein  YP_694927  unclonable  2.1402e-07  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0473  CDS  NC_008261  561106  562176  1071  glycosyl transferase, group 1  YP_694928  unclonable  3.88083e-08  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0474  CDS  NC_008261  562178  563644  1467  putative polysaccharide transporter protein  YP_694929  unclonable  4.32304e-07  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0475  CDS  NC_008261  563631  564848  1218  hypothetical protein  YP_694930  unclonable  1.01664e-07  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0541  CDS  NC_008261  643462  644883  1422  PTS system, trehalose-specific IIBC component  YP_694995  unclonable  3.64471e-07  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0625  CDS  NC_008261  752131  752547  417  flavodoxin  YP_695078  unclonable  7.60525e-10  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0635  CDS  NC_008261  763274  764065  792  relA/spoT family protein  YP_695088  unclonable  1.18611e-08  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0717  CDS  NC_008261  852189  853028  840  zinc transporter ZupT  YP_695169  unclonable  1.26072e-08  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_0917  CDS  NC_008261  1081573  1082385  813  licD family protein  YP_695366  unclonable  1.19843e-08  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1014  CDS  NC_008261  1164914  1166227  1314  hypothetical protein  YP_695460  unclonable  1.99416e-07  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1015  CDS  NC_008261  1166292  1166957  666  hypothetical protein  YP_695461  unclonable  3.89978e-09  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1016  CDS  NC_008261  1166971  1168458  1488  putative type II restriction endonuclease  YP_695462  unclonable  5.61814e-07  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1017  CDS  NC_008261  1168761  1169984  1224  DNA-cytosine methyltransferase  YP_695463  unclonable  1.73246e-07  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1018  CDS  NC_008261  1170044  1171384  1341  DNA-cytosine methyltransferase  YP_695464  unclonable  4.87753e-07  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1019  CDS  NC_008261  1171434  1171916  483  hypothetical protein  YP_695465  unclonable  2.71806e-09  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1020  CDS  NC_008261  1172294  1172719  426  hypothetical protein  YP_695466  unclonable  1.36149e-09  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1182  CDS  NC_008261  1348121  1348795  675  hypothetical protein  YP_695628  unclonable  9.61119e-09  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1226  CDS  NC_008261  1394596  1396506  1911  hypothetical protein  YP_695672  unclonable  6.92495e-06  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1256  CDS  NC_008261  1431385  1431540  156  hypothetical protein  YP_695702  unclonable  1.9657e-10  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1257  CDS  NC_008261  1431768  1432382  615  hypothetical protein  YP_695703  unclonable  4.44267e-09  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1334  CDS  NC_008261  1509910  1510164  255  hypothetical protein  YP_695780  unclonable  3.27564e-10  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1370  CDS  NC_008261  1548207  1549427  1221  sodium:dicarboxylate symporter family protein  YP_695816  unclonable  5.79538e-08  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1439  CDS  NC_008261  1619394  1622543  3150  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  YP_695884  unclonable  0.00896108  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1497  CDS  NC_008261  1704972  1707809  2838  ATPase domain-containing protein  YP_695940  unclonable  0.0028368  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1526  CDS  NC_008261  1744050  1744754  705  sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  YP_695969  unclonable  6.56832e-09  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1527  CDS  NC_008261  1744792  1745784  993  putative iron-sulfur cluster-binding protein  YP_695970  unclonable  2.39897e-08  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1528  CDS  NC_008261  1745929  1746438  510  serine O-acetyltransferase  YP_695971  unclonable  1.91347e-09  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1529  CDS  NC_008261  1746457  1747359  903  cysteine synthase A  YP_695972  unclonable  3.3727e-08  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1531  CDS  NC_008261  1749309  1750097  789  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  YP_695974  unclonable  2.30414e-08  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1562  CDS  NC_008261  1781006  1782667  1662  NlpC/P60 family protein  YP_696005  unclonable  2.46871e-06  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1650  CDS  NC_008261  1865685  1867271  1587  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  YP_696091  unclonable  1.09109e-06  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_1756  CDS  NC_008261  1974886  1976184  1299  uracil transporter  YP_696192  unclonable  1.76806e-07  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2019  CDS  NC_008261  2258872  2260110  1239  cell division protein FtsA  YP_696452  unclonable  1.29502e-07  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2107  CDS  NC_008261  2338461  2338910  450  hypothetical protein  YP_696536  unclonable  2.03247e-09  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2125  CDS  NC_008261  2356082  2356798  717  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  YP_696553  unclonable  4.72054e-09  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2126  CDS  NC_008261  2356814  2357911  1098  TPR domain-containing protein  YP_696554  unclonable  5.03657e-08  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2166  CDS  NC_008261  2402861  2403517  657  single-stranded DNA-binding protein  YP_696590  unclonable  3.74562e-09  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2242  CDS  NC_008261  2489656  2491518  1863  sensor histidine kinase  YP_696666  unclonable  1.01794e-05  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2354  CDS  NC_008261  2619173  2620429  1257  hypothetical protein  YP_696777  unclonable  4.69448e-08  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2393  CDS  NC_008261  2662297  2663094  798  septum site-determining protein MinD  YP_696816  unclonable  3.28791e-09  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2466  CDS  NC_008261  2735105  2736187  1083  peptide chain release factor 1  YP_696880  unclonable  7.99175e-08  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2715  CDS  NC_008261  2974959  2975267  309  30S ribosomal protein S10  YP_697095  unclonable  4.42606e-10  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2725  CDS  NC_008261  2989558  2990247  690  50S ribosomal protein L1  YP_697105  unclonable  4.62552e-09  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2726  CDS  NC_008261  2990305  2990730  426  50S ribosomal protein L11  YP_697106  unclonable  9.20277e-10  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2727  CDS  NC_008261  2990805  2991326  522  transcription antitermination protein NusG  YP_697107  unclonable  2.31541e-09  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2728  CDS  NC_008261  2991364  2991588  225  preprotein translocase subunit SecE  YP_697108  unclonable  3.6945e-10  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2729  CDS  NC_008261  2991642  2991791  150  50S ribosomal protein L33  YP_697109  unclonable  2.21707e-10  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2730  CDS  NC_008261  2991974  2993167  1194  elongation factor Tu  YP_697110  unclonable  7.82822e-08  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2797  CDS  NC_008261  3057379  3057783  405  hypothetical protein  YP_697162  unclonable  9.39181e-10  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2798  CDS  NC_008261  3057843  3058163  321  putative cell division protein FtsL  YP_697163  unclonable  6.6737e-10  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2799  CDS  NC_008261  3058259  3058633  375  spore cortex biosynthesis protein YabQ  YP_697164  unclonable  8.83899e-10  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2800  CDS  NC_008261  3058643  3058942  300  sporulation protein YabP  YP_697165  unclonable  7.15998e-10  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2801  CDS  NC_008261  3059073  3059333  261  S4 domain-containing protein  YP_697166  unclonable  5.68506e-10  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
CPF_2910  CDS  NC_008261  3183567  3184916  1350  nucleoside recognition domain-containing protein  YP_697274  unclonable  2.09711e-07  n/a    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>